seq1 = pF1KE6076.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE6076/gi568815587r_123842870.tfa (gi568815587r:123842870_124043812), 200943 bp

>pF1KE6076 969
>gi568815587r:123842870_124043812 (Chr11)

(complement)

1-969  (99975-100943)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCTGAAAACTGGACTCAGGTAACAAGCTTTGTCCTTCTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99975 ATGAACCCTGAAAACTGGACTCAGGTAACAAGCTTTGTCCTTCTGGGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCAGTAGCCACCTCATACAGTTCCTGGTGTTCCTGGGGTTAATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 CCCCAGTAGCCACCTCATACAGTTCCTGGTGTTCCTGGGGTTAATGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTACATTGTAACAGCCACAGGCAAGCTGCTAATTATTGTGCTCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100075 CCTACATTGTAACAGCCACAGGCAAGCTGCTAATTATTGTGCTCAGCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATAGACCAACGCCTGCACATACAGATGTACTTCTTCCTGCGGAATTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100125 ATAGACCAACGCCTGCACATACAGATGTACTTCTTCCTGCGGAATTTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCTGGAGCTGTTGCTGGTAACTGTTGTGGTTCCCAAGATGCTTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100175 CTTCCTGGAGCTGTTGCTGGTAACTGTTGTGGTTCCCAAGATGCTTGTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCCTCACGGGGGATCACACCATCTCATTTGTCAGCTGCATCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100225 TCATCCTCACGGGGGATCACACCATCTCATTTGTCAGCTGCATCATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCTACCTCTACTTCTTTCTAGGCACCACTGACTTCTTCCTCTTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100275 TCCTACCTCTACTTCTTTCTAGGCACCACTGACTTCTTCCTCTTGGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGTCTCTGGATCGTTACCTGGCAATCTGCCGACCACTCCGCTATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100325 CATGTCTCTGGATCGTTACCTGGCAATCTGCCGACCACTCCGCTATGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTGATGAATGGCCATGTCTGTTCCCAACTAGTGCTGGCCTCCTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100375 CCCTGATGAATGGCCATGTCTGTTCCCAACTAGTGCTGGCCTCCTGGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGATTCCTCTGGGTCCTTTGCCCCACTGTCCTCATGGCCAGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100425 GCTGGATTCCTCTGGGTCCTTTGCCCCACTGTCCTCATGGCCAGCCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGCCCCAATGGTATTGACCACTTCTTTCGTGACAGTTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100475 TTTCTGTGGCCCCAATGGTATTGACCACTTCTTTCGTGACAGTTGGCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAGGCTTTCTTGTGGGGACACCCACCTGCTGAAACTGGTGGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100525 TGCTCAGGCTTTCTTGTGGGGACACCCACCTGCTGAAACTGGTGGCTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGCTCTCTACGTTGGTGTTACTGGGCTCACTGGCTCTGACCTCAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100575 ATGCTCTCTACGTTGGTGTTACTGGGCTCACTGGCTCTGACCTCAGTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGCCTGCATTCTTGCCACTGTTCTCAGGGCCCCTACAGCTGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100625 CTATGCCTGCATTCTTGCCACTGTTCTCAGGGCCCCTACAGCTGCTGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAGGAAAGCGTTTTCCACTTGCGCCTCGCATCTTACAGTGGTGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100675 GAAGGAAAGCGTTTTCCACTTGCGCCTCGCATCTTACAGTGGTGGTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTATGGCAGTTCCATCTTTCTCTACATTCGTATGTCAGAGGCTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100725 ATCTATGGCAGTTCCATCTTTCTCTACATTCGTATGTCAGAGGCTCAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAACTGCTCAACAAAGGTGCCTCCGTCCTGAGCTGCATCATCACACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100775 CAAACTGCTCAACAAAGGTGCCTCCGTCCTGAGCTGCATCATCACACCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTTGAACCCATTCATCTTCACTCTCCGCAATGACAAGGTGCAGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100825 TCTTGAACCCATTCATCTTCACTCTCCGCAATGACAAGGTGCAGCAAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGAGAGAAGCCTTGGGGTGGCCCAGGCTCACTGCTGTGATGAAACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100875 CTGAGAGAAGCCTTGGGGTGGCCCAGGCTCACTGCTGTGATGAAACTGAG

    950     .    :    .
    951 GGTCACAAGTCAAAGGAAA
        |||||||||||||||||||
 100925 GGTCACAAGTCAAAGGAAA