seq1 = pF1KE6073.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KE6073/gi568815581r_3177973.tfa (gi568815581r:3177973_3378935), 200963 bp

>pF1KE6073 963
>gi568815581r:3177973_3378935 (Chr17)

(complement)

1-963  (100001-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTTACAGAAACTCATGGAGCCAGAAGCTGGGACCAATAGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTTACAGAAACTCATGGAGCCAGAAGCTGGGACCAATAGGACCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGCTGAGTTCATTCTACTGGGCCTAGTGCAAACAGAAGAGATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGCTGAGTTCATTCTACTGGGCCTAGTGCAAACAGAAGAGATGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGTTGTCTTTGTGCTCCTCCTCTTTGCCTATCTGGTCACAACTGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTTGTCTTTGTGCTCCTCCTCTTTGCCTATCTGGTCACAACTGGGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCTCAGCATCCTGGCAGCCGTCTTGGTGGAGCCCAAACTCCACGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCTCAGCATCCTGGCAGCCGTCTTGGTGGAGCCCAAACTCCACGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGTACTTCTTCCTGGGGAACCTGTCAGTGCTGGATGTCGGATGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGTACTTCTTCCTGGGGAACCTGTCAGTGCTGGATGTCGGATGTATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGTCACTGTTCCTGCAATGTTGGGTCGTCTCTTGTCCCACAAGTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGTCACTGTTCCTGCAATGTTGGGTCGTCTCTTGTCCCACAAGTCCACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTTCCTATGACGCCTGCCTCTCCCAGCTCTTCTTCTTCCACCTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTTCCTATGACGCCTGCCTCTCCCAGCTCTTCTTCTTCCACCTTCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGGATGGACTGCTTCCTGCTGACCGCCATGGCCTATGACCGACTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGGATGGACTGCTTCCTGCTGACCGCCATGGCCTATGACCGACTCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCTGCCAGCCCCTCACCTACAGCACCCGCATGAGTCAGACAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCTGCCAGCCCCTCACCTACAGCACCCGCATGAGTCAGACAGTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGATGTTGGTGGCTGCGTCCTTGGCTTGTGCCTTCACCAACGCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGATGTTGGTGGCTGCGTCCTTGGCTTGTGCCTTCACCAACGCACTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCACACTGTGGCCATGTCCACGCTCAACTTCTGTGGCCCCAATGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCACACTGTGGCCATGTCCACGCTCAACTTCTGTGGCCCCAATGAGGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCACTTCTACTGTGACCTCCCACAGCTCTTCCAGCTCTCCTGCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCACTTCTACTGTGACCTCCCACAGCTCTTCCAGCTCTCCTGCTCCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCCAACTCAATGAGCTGCTGCTCTTTGCTGTGGGTTTCATCATGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCCAACTCAATGAGCTGCTGCTCTTTGCTGTGGGTTTCATCATGGCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACACCTTTGGTTCTCATCATCACTGCCTACAGCCACGTGGCAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACACCTTTGGTTCTCATCATCACTGCCTACAGCCACGTGGCAGCTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCTACGAATCCGTTCAGTGGAGGGCCGAAAGAAGGCCTTCTCCACGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCTACGAATCCGTTCAGTGGAGGGCCGAAAGAAGGCCTTCTCCACGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCTCCCACCTCACCGTGGTTTGTCTTTTCTTTGGAAGAGGTATCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCTCCCACCTCACCGTGGTTTGTCTTTTCTTTGGAAGAGGTATCTTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTACATGAGACTGGGTTCAGAGGAGGCTTCAGACAAGGATAAAGGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACATGAGACTGGGTTCAGAGGAGGCTTCAGACAAGGATAAAGGGGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAGTTTTCAACACTGTTATCAACCCTATGCTGAACCCTCTTATCTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GAGTTTTCAACACTGTTATCAACCCTATGCTGAACCCTCTTATCTACAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTCAGAAACCCTGATGTTCAGGGTGCTCTGTGGCAAATATTTTTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCAGAAACCCTGATGTTCAGGGTGCTCTGTGGCAAATATTTTTGGGGAG

    950     .    :
    951 GAGATCACTGACC
        |||||||||||||
 100951 GAGATCACTGACC