seq1 = pF1KE6070.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KE6070/gi568815587r_4823377.tfa (gi568815587r:4823377_5024339), 200963 bp

>pF1KE6070 963
>gi568815587r:4823377_5024339 (Chr11)

(complement)

1-963  (100001-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAATTCTTCTTAATAGCAGCCTCCAAAGAGCCACTTTCTTCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAATTCTTCTTAATAGCAGCCTCCAAAGAGCCACTTTCTTCCTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTTCCAAGGTCTAGAAGGTCTCCATGGCTGGATCTCTATTCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTTCCAAGGTCTAGAAGGTCTCCATGGCTGGATCTCTATTCCCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCATCTACCTGACAGTTATCTTGGGGAACCTCACCATTCTCCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCATCTACCTGACAGTTATCTTGGGGAACCTCACCATTCTCCACGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTGTACTGATGCCACTCTCCATGGACCCATGTACTATTTCTTGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTTGTACTGATGCCACTCTCCATGGACCCATGTACTATTTCTTGGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTAGCTGTCACAGACTTAGGCCTTTGCCTTTCCACACTGCCCACTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTAGCTGTCACAGACTTAGGCCTTTGCCTTTCCACACTGCCCACTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGCATTTTCTGGTTTGATACCAGAGAGATTGGCATCCCTGCCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGCATTTTCTGGTTTGATACCAGAGAGATTGGCATCCCTGCCTGTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTCAGCTCTTCTTCATCCACACCTTGTCTTCAATGGAGTCATCAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTCAGCTCTTCTTCATCCACACCTTGTCTTCAATGGAGTCATCAGTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTATCCATGTCCATTGACCGCTACGTGGCCGTCTGCAACCCACTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTATCCATGTCCATTGACCGCTACGTGGCCGTCTGCAACCCACTGCATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTCCACCGTCCTGACACCTGCATGTATTGTCAAGATGGGGCTAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTCCACCGTCCTGACACCTGCATGTATTGTCAAGATGGGGCTAAGCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCTTAGAAGTGCTCTCCTCATCCTCCCCTTGCCATTCCTCCTGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGCTTAGAAGTGCTCTCCTCATCCTCCCCTTGCCATTCCTCCTGAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCCAATACTGCCACTCCCATGTGCTGGCTCATGCTTATTGTCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCCAATACTGCCACTCCCATGTGCTGGCTCATGCTTATTGTCTTCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAGATCATGAAGCTGGCCTGCTCTAGCATCATTGTCAATCACATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAGATCATGAAGCTGGCCTGCTCTAGCATCATTGTCAATCACATCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGCTCTTTGTTGTGGCCTGCACCGTGGGTGTGGACTCCCTGCTCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGCTCTTTGTTGTGGCCTGCACCGTGGGTGTGGACTCCCTGCTCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTCTCATACGCCCTCATCCTTCGCACCGTGCTCAGCATTGCCTCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTCTCATACGCCCTCATCCTTCGCACCGTGCTCAGCATTGCCTCCCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAGCGACTCCGAGCCCTCAACACCTGTGTCTCTCATATCTGTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAGCGACTCCGAGCCCTCAACACCTGTGTCTCTCATATCTGTGCTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCTCTTCTACATCCCCATGATTGGCTTGTCTCTTGTGCATCGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCTCTTCTACATCCCCATGATTGGCTTGTCTCTTGTGCATCGCTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAACATCTGCCCCGCGTTGTACACCTCTTCATGTCCTATGTGTATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAACATCTGCCCCGCGTTGTACACCTCTTCATGTCCTATGTGTATCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTACCACCCCTTATGAACCCCATCATCTACAGCATCAAGACCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTACCACCCCTTATGAACCCCATCATCTACAGCATCAAGACCAAGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTCGCCAGCGCATCATTAAGAAGTTTCAGTTTATAAAGTCACTTAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTCGCCAGCGCATCATTAAGAAGTTTCAGTTTATAAAGTCACTTAGGTG

    950     .    :
    951 TTTTTGGAAGGAT
        |||||||||||||
 100951 TTTTTGGAAGGAT