seq1 = pF1KE6057.tfa, 960 bp
seq2 = pF1KE6057/gi568815587r_74988754.tfa (gi568815587r:74988754_75189713), 200960 bp

>pF1KE6057 960
>gi568815587r:74988754_75189713 (Chr11)

(complement)

1-960  (100001-100960)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCCACAGCCTGTAATGAATCAGTGGATGGCTCACCCGTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCCACAGCCTGTAATGAATCAGTGGATGGCTCACCCGTCTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTATTGGGCATCCCCTCTCTGCCAGAGACCTTCTTCCTCCCTGTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTATTGGGCATCCCCTCTCTGCCAGAGACCTTCTTCCTCCCTGTGTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTATTTTCCTCCTCTTCTACCTTCTCATCCTGATGGGTAATGCCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTATTTTCCTCCTCTTCTACCTTCTCATCCTGATGGGTAATGCCCTGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGTGGCCGTGGTGGCAGAGCCCAGCCTCCACAAGCCCATGTACTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGTGGCCGTGGTGGCAGAGCCCAGCCTCCACAAGCCCATGTACTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGATCAATCTCTCCACCTTGGACATCCTTTTCACCACAACCACTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGATCAATCTCTCCACCTTGGACATCCTTTTCACCACAACCACTGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAAGATGCTGTCCTTATTCTTGCTTGGGGACCGCTTCCTCAGCTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAAGATGCTGTCCTTATTCTTGCTTGGGGACCGCTTCCTCAGCTTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCTGCTTACTGCAGATGTACCTCTTCCAAAGTTTTACATGTTCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCTGCTTACTGCAGATGTACCTCTTCCAAAGTTTTACATGTTCAGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCATCCTGGTGGTCATGGCCTATGACCGCTATGTGGCTATCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCATCCTGGTGGTCATGGCCTATGACCGCTATGTGGCTATCTGCCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACTGCACTACCCTGTCCTCATGAACCCACAGACCAATGCTACCTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACTGCACTACCCTGTCCTCATGAACCCACAGACCAATGCTACCTTGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAGTGCCTGGCTAACTGCCCTCCTCCTGCCCATCCCAGCAGTAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAGTGCCTGGCTAACTGCCCTCCTCCTGCCCATCCCAGCAGTAGTAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACCTCCCAGATGGCATATAACAGCATTGCCTACATCTACCACTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACCTCCCAGATGGCATATAACAGCATTGCCTACATCTACCACTGCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGATCATCTGGCTGTGGTCCAGGCCTCCTGCTCTGACACCACCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGATCATCTGGCTGTGGTCCAGGCCTCCTGCTCTGACACCACCCCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCCTCATGGGCTTCTGCATCGCCATGGTGGTGTCCTTCCTCCCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCCTCATGGGCTTCTGCATCGCCATGGTGGTGTCCTTCCTCCCCCTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGTGCTTCTCTCCTATGTCCACATCCTGGCCTCAGTGCTTCGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTGGTGCTTCTCTCCTATGTCCACATCCTGGCCTCAGTGCTTCGCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTTCCCTAGAAGGACGGGCAAAAGCCTTCTCCACCTGCAGCTCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTTCCCTAGAAGGACGGGCAAAAGCCTTCTCCACCTGCAGCTCCCACCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGGTCGTGGGCACCTACTACTCATCTATTGCCATAGCCTACGTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGGTCGTGGGCACCTACTACTCATCTATTGCCATAGCCTACGTGGCCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGGGCTGACCTGCCCCTTGACTTCCATATCATGGGCAATGTGGTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGGGCTGACCTGCCCCTTGACTTCCATATCATGGGCAATGTGGTATATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATTCTCACACCAATTCTCAACCCCCTCATTTACACGCTGAGAAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATTCTCACACCAATTCTCAACCCCCTCATTTACACGCTGAGAAACAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATGTAAAGGCAGCCATCACCAAAATCATGTCTCAAGACCCAGGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATGTAAAGGCAGCCATCACCAAAATCATGTCTCAAGACCCAGGCTGTGA

    950     .    :
    951 CAGGAGCATT
        ||||||||||
 100951 CAGGAGCATT