seq1 = pF1KE6045.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KE6045/gi568815587r_5756752.tfa (gi568815587r:5756752_5957702), 200951 bp

>pF1KE6045 951
>gi568815587r:5756752_5957702 (Chr11)

(complement)

1-951  (100001-100951)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGAAGAATGTCTACGTCTAATCACACCCAGTTCCATCCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGAAGAATGTCTACGTCTAATCACACCCAGTTCCATCCTTCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTCCTACTGCTGGGTATCCCAGGGCTAGAAGATGTGCACATTTGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTCCTACTGCTGGGTATCCCAGGGCTAGAAGATGTGCACATTTGGATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGTCCCTTTTTTCTTTGTGTATCTTGTTGCACTCCTGGGAAACACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGTCCCTTTTTTCTTTGTGTATCTTGTTGCACTCCTGGGAAACACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTGTTTGTGATCCAGACTGAGCAGAGTCTCCATGAGCCTATGTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTTGTTTGTGATCCAGACTGAGCAGAGTCTCCATGAGCCTATGTACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCTGGCCATGTTGGATTCCATTGACCTGGGCTTGTCTACAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCCTGGCCATGTTGGATTCCATTGACCTGGGCTTGTCTACAGCCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCCCAAAATGTTGGGCATCTTCTGGTTCAATACCAAAGAAATATCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCCCAAAATGTTGGGCATCTTCTGGTTCAATACCAAAGAAATATCTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAGGCTGCCTTTCTCACATGTTCTTCATCCATTTCTTCACTGCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAGGCTGCCTTTCTCACATGTTCTTCATCCATTTCTTCACTGCTATGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCATTGTGTTGGTGGCCATGGCCTTTGACCGCTACATTGCCATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCATTGTGTTGGTGGCCATGGCCTTTGACCGCTACATTGCCATTTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACCTCTTCGGTACACCATGATCCTCACCAGCAAAATCATCAGCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACCTCTTCGGTACACCATGATCCTCACCAGCAAAATCATCAGCCTCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGGCATTGCTGTCCTGAGGAGCCTGTACATGGTTGTTCCACTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGGCATTGCTGTCCTGAGGAGCCTGTACATGGTTGTTCCACTGGTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTCCTTCTGAGGCTGCCCTTCTGTGGGCATCGTATCATCCCTCATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTCCTTCTGAGGCTGCCCTTCTGTGGGCATCGTATCATCCCTCATACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTGTGAGCACATGGGCATTGCCCGTCTGGCCTGTGCCAGCATCAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTGTGAGCACATGGGCATTGCCCGTCTGGCCTGTGCCAGCATCAAAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACATTAGGTTTGGCCTTGGCAACATATCTCTCTTGTTACTGGATGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AACATTAGGTTTGGCCTTGGCAACATATCTCTCTTGTTACTGGATGTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTTATTATTCTCTCCTATGTCAGGATCCTGTATGCTGTCTTCTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTTATTATTCTCTCCTATGTCAGGATCCTGTATGCTGTCTTCTGCCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTCCTGGGAAGCTCGACTCAAAGCTCTCAACACCTGTGGTTCTCATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTCCTGGGAAGCTCGACTCAAAGCTCTCAACACCTGTGGTTCTCATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTGTTATCTTAGCCTTTTTTACACCAGCATTTTTTTCATTCTTGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTGTTATCTTAGCCTTTTTTACACCAGCATTTTTTTCATTCTTGACACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCGTTTTGGCCATAATATCCCACAGTATATACATATTATATTAGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCGTTTTGGCCATAATATCCCACAGTATATACATATTATATTAGCCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTATGTGGTTGTCCCACCAGCCCTCAATCCTGTAATCTATGGAGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTATGTGGTTGTCCCACCAGCCCTCAATCCTGTAATCTATGGAGTCAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACAAAGCAGATTCGAGAGAGAGTGCTGAGGATTTTTCTCAAGACCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACAAAGCAGATTCGAGAGAGAGTGCTGAGGATTTTTCTCAAGACCAATCA

    950 
    951 C
        |
 100951 C