seq1 = pF1KE6041.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KE6041/gi568815597r_158676685.tfa (gi568815597r:158676685_158877635), 200951 bp

>pF1KE6041 951
>gi568815597r:158676685_158877635 (Chr1)

(complement)

1-951  (100001-100951)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCAATACAACCATTCAAGCCTGGCTGAATTTGTGTTCCTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCAATACAACCATTCAAGCCTGGCTGAATTTGTGTTCCTTGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCAGTGTGGGCTATGTCAGGGGCTGGCTTTTTGTCCTGCTGCTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCAGTGTGGGCTATGTCAGGGGCTGGCTTTTTGTCCTGCTGCTATTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATACCTGTTCACCATCTGTGGTAACATGCTCATCTTCTCAGTCATCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATACCTGTTCACCATCTGTGGTAACATGCTCATCTTCTCAGTCATCCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGATGCAGCTCTGCACACACCTATGTACCACTTTGTCAGTGTTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGATGCAGCTCTGCACACACCTATGTACCACTTTGTCAGTGTTCTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTTGGAGTTGTGGTATACAGCTACCACTATCCCTAAGATGTTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTTGGAGTTGTGGTATACAGCTACCACTATCCCTAAGATGTTGTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATATTCTCAGTGAGAAGAAAACCATTTCTTTTGCAGGATGCCTCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATATTCTCAGTGAGAAGAAAACCATTTCTTTTGCAGGATGCCTCCTTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTACTTCTTCCACTCCTTGGGAGCGTCTGAATGCTACCTTCTTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTACTTCTTCCACTCCTTGGGAGCGTCTGAATGCTACCTTCTTACAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTATGATAGATACCTGGCCATTTGTCGGCCCCTCCACTACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTATGATAGATACCTGGCCATTTGTCGGCCCCTCCACTACCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAATTATGACCACCACACTCTGTGCCAAGATGGCTGCTGCTTGTTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAATTATGACCACCACACTCTGTGCCAAGATGGCTGCTGCTTGTTGGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGGCTTCCTGTGTCCCATTTCTGAGGTCATCCTTGCCTCCCAGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGGCTTCCTGTGTCCCATTTCTGAGGTCATCCTTGCCTCCCAGCTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTTTGTGCTTACAATGAAATCCAACACATTTTCTGTGACTTTCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTTTGTGCTTACAATGAAATCCAACACATTTTCTGTGACTTTCCACCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAGCTTGGCCTGCAAGGACACATCTGCTAACATTCTGGTGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAGCTTGGCCTGCAAGGACACATCTGCTAACATTCTGGTGGACTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCATTAATGCTTTCATAATTCTTATCACTTTCTTCTTTATCATGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCATTAATGCTTTCATAATTCTTATCACTTTCTTCTTTATCATGATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATGCAAGGATCATTGGGGCTGTGCTGAAGATAAAAACAGCATCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATGCAAGGATCATTGGGGCTGTGCTGAAGATAAAAACAGCATCAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAAGAAGGCCTTTTCTACCTGTGCCTCACATCTTGCTGTGGTCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAAGAAGGCCTTTTCTACCTGTGCCTCACATCTTGCTGTGGTCCTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTTGGGAGCATCATCTTCATGTATGTGCGGCTAAAGAAGAGCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTTTGGGAGCATCATCTTCATGTATGTGCGGCTAAAGAAGAGCTATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGACCCTTGACCGAACACTTGCTATAGTTTACTCCGTACTAACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTGACCCTTGACCGAACACTTGCTATAGTTTACTCCGTACTAACACCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTCAATCCAATTATCTACAGTCTTCGTAACAAGGAAATCATTAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTCAATCCAATTATCTACAGTCTTCGTAACAAGGAAATCATTAAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCAAGAGGACCATCTTCCAGAAGGGAGATAAAGCTAGTCTTGCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCAAGAGGACCATCTTCCAGAAGGGAGATAAAGCTAGTCTTGCTCATCT

    950 
    951 T
        |
 100951 T