seq1 = pF1KE6037.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KE6037/gi568815587f_57930953.tfa (gi568815587f:57930953_58131903), 200951 bp

>pF1KE6037 951
>gi568815587f:57930953_58131903 (Chr11)

1-951  (100001-100951)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAACCATATACCAAAAACTGGACCCAGGTAACTGAATTTGTCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAACCATATACCAAAAACTGGACCCAGGTAACTGAATTTGTCATGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTTTGCTGGCATCCATGAAGCACACCTCCTCTTCTTCATACTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTTTGCTGGCATCCATGAAGCACACCTCCTCTTCTTCATACTCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCATGTACCTGTTCACCTTGGTGGAGAATTTGGCCATCATTTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCATGTACCTGTTCACCTTGGTGGAGAATTTGGCCATCATTTTAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGTTTGGACCACCGACTACGGAGACCCATGTATTTCTTCCTGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGGTTTGGACCACCGACTACGGAGACCCATGTATTTCTTCCTGACACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGTCCTGCCTTGAAATCTGGTACACTTCTGTTACAGTGCCCAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGTCCTGCCTTGAAATCTGGTACACTTCTGTTACAGTGCCCAAGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCTGGTTTTATTGGGGTGGATGGTGGCAAGAATATCTCTTATGCTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100251 TGGCTGGTTTTATTGGGGTGGATGGTGGCAAGAATATCTCTTATGCTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCCTATCCCAGCTCTTCATCTTCACCTTTCTTGGGGCAACTGAGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCCTATCCCAGCTCTTCATCTTCACCTTTCTTGGGGCAACTGAGTGTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTACTGGCTGCCATGGCCTATGATCGTTATGTGGCCATTTGTATGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTACTGGCTGCCATGGCCTATGATCGTTATGTGGCCATTTGTATGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCACTATGGGGCTTTTGTGTCCTGGGGCACCTGCATCCGTCTGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCACTATGGGGCTTTTGTGTCCTGGGGCACCTGCATCCGTCTGGCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTGTTGGCTGGTAGGTTTCCTCACACCCATCTTGCCAATCTACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTGTTGGCTGGTAGGTTTCCTCACACCCATCTTGCCAATCTACCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTCTCAGCTAACATTTTGTGGCCCAAATGTCATTGACCATTTCTCCTGTG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTCTCAGCTAACATTTTATGGCCCAAATGTCATTGACCATTTCTCCTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGCCTCACCCTTGCTAGCCTTGTCGTGCTCAGATGTCACTTGGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGCCTCACCCTTGCTAGCCTTGTCGTGCTCAGATGTCACTTGGAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGTGGATTTCCTGGTGTCTCTGGCTGTGCTACTGGCCTCCTCTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGTGGATTTCCTGGTGTCTCTGGCTGTGCTACTGGCCTCCTCTATGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTGCTGTGTCCTATGGCAACATCGTCTGGACACTGCTGCACATCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTGCTGTGTCCTATGGCAACATCGTCTGGACACTGCTGCACATCCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGCTGCTGAGCGCTGGAAGGCCTTCTCTACCTGTGCAGCTCACCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGCTGCTGAGCGCTGGAAGGCCTTCTCTACCTGTGCAGCTCACCTGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGTGAGCCTCTTCTATGGCACTCTTTTCTTTATGTATGTCCAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGTGAGCCTCTTCTATGGCACTCTTTTCTTTATGTATGTCCAGACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGTGACCTCCTCCATCAACTTCAACAAGGTGGTATCTGTCTTCTACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGTGACCTCCTCCATCAACTTCAACAAGGTGGTATCTGTCTTCTACTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTGTCACGCCCATGCTCAATCCTCTCATCTACAGTCTTAGGAACAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTGTCACGCCCATGCTCAATCCTCTCATCTACAGTCTTAGGAACAAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGAAGGGAGCTCTGGGTCGAGTCTTTTCTCTCAACTTTTGGAAGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGAAGGGAGCTCTGGGTCGAGTCTTTTCTCTCAACTTTTGGAAGGGACA

    950 
    951 G
        |
 100951 G