seq1 = pF1KE6027.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE6027/gi568815587r_56541492.tfa (gi568815587r:56541492_56742439), 200948 bp

>pF1KE6027 948
>gi568815587r:56541492_56742439 (Chr11)

(complement)

1-948  (100001-100948)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGACTTATGAAAGAGGTTCGAGGCAGAAATCAAACAGAAGTAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGACTTATGAAAGAGGTTCGAGGCAGAAATCAAACAGAAGTAACAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTCTCCTCTTAGGACTTTCCGACAATCCAGATCTACAAGGAGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTTCTCCTCTTAGGACTTTCCGACAATCCAGATCTACAAGGAGTCCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGCATTGTTTCTGTTGATCTATATGGCAAACATGGTGGGCAATTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGCATTGTTTCTGTTGATCTATATGGCAAACATGGTGGGCAATTTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGATTGTATTGATTAAGATTGATCTCTGTCTCCACACCCCCATGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGATTGTATTGATTAAGATTGATCTCTGTCTCCACACCCCCATGTATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTCTCAGTAGCCTCTCTTTTGTAGATGCCTCTTACTCTTCTTCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTCTCAGTAGCCTCTCTTTTGTAGATGCCTCTTACTCTTCTTCCGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCCCAAGATGCTGGTGAACCTCATGGCTGAGAATAAGGCCATTTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCCCAAGATGCTGGTGAACCTCATGGCTGAGAATAAGGCCATTTCTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATGGATGTGCTGCCCAGTTCTACTTCTTTGGCTCCTTCCTGGGGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATGGATGTGCTGCCCAGTTCTACTTCTTTGGCTCCTTCCTGGGGACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCTTCCTGTTGGCCATGATGGCATATGACCGCTATGCAGCCATTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCTTCCTGTTGGCCATGATGGCATATGACCGCTATGCAGCCATTTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCCCTGCTCTACCCAGTTCTCGTGTCTGGGAGAATTTGCTTTTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCCCTGCTCTACCCAGTTCTCGTGTCTGGGAGAATTTGCTTTTTGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATAGCTACCTCCTTCTTAGCAGGTTGTGGAAATGCAGCCATACATACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATAGCTACCTCCTTCTTAGCAGGTTGTGGAAATGCAGCCATACATACAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATGACTTTTAGGTTGTCCTTTTGTGGTTCTAATAGGATCAACCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATGACTTTTAGGTTGTCCTTTTGTGGTTCTAATAGGATCAACCATTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTGTGACACCCCGCCACTGCTCAAACTCTCTTGCTCTGATACCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTGTGACACCCCGCCACTGCTCAAACTCTCTTGCTCTGATACCCACTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGGCATTGTGATCATGGCATTCTCAAGTTTTATTGTCATCAGCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGGCATTGTGATCATGGCATTCTCAAGTTTTATTGTCATCAGCTGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATGATTGTCCTCATTTCCTACCTGTGTATCTTCATTGCCGTCTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATGATTGTCCTCATTTCCTACCTGTGTATCTTCATTGCCGTCTTGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCCTTCGTTAGAGGGCAGGCACAAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCCTTCGTTAGAGGGCAGGCACAAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCATGGCTGTCACCATATTCTTTGGAACAATCCTCTTCATGTACTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCATGGCTGTCACCATATTCTTTGGAACAATCCTCTTCATGTACTTGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCTACATCTAGCTACTCAATGGAGCAAGACAAGGTTGTCTCTGTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCTACATCTAGCTACTCAATGGAGCAAGACAAGGTTGTCTCTGTCTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATACAGTAATAATCCCTGTGCTAAATCCCCTCATCTATAGTTTAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATACAGTAATAATCCCTGTGCTAAATCCCCTCATCTATAGTTTAAAAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGGATGTAAAAAAGGCCCTAAAGAAGATCTTATGGAAACACATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGATGTAAAAAAGGCCCTAAAGAAGATCTTATGGAAACACATCTTG