seq1 = pF1KE6023.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE6023/gi568815597r_158617171.tfa (gi568815597r:158617171_158818115), 200945 bp

>pF1KE6023 945
>gi568815597r:158617171_158818115 (Chr1)

(complement)

1-945  (100001-100945)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGCGGAAACCAATCAACAGTGACTGAATTTATCTTCACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGCGGAAACCAATCAACAGTGACTGAATTTATCTTCACTGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTCAGCTTCAGGATGGTAGTCTCCTGTACTTCTTTCCTTTACTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTCAGCTTCAGGATGGTAGTCTCCTGTACTTCTTTCCTTTACTTTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATACTTTTATTATCATTGATAACTTATTAATCTTCTCTGCTGTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATACTTTTATTATCATTGATAACTTATTAATCTTCTCTGCTGTAAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGACACCCATCTCCACAACCCCATGTATAATTTTATCAGTATATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGACACCCATCTCCACAACCCCATGTATAATTTTATCAGTATATTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTCTGGAGATCTGGTACACCACAGCCACCATTCCCAAGATGCTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTCTGGAGATCTGGTACACCACAGCCACCATTCCCAAGATGCTCTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCATCAGTGAAAAGAAGGCCATCTCAATGACTGGCTGCATCTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCATCAGTGAAAAGAAGGCCATCTCAATGACTGGCTGCATCTTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTCTTCCACTCACTTGAAAACTCAGAGGGGATCTTGCTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTATTTCTTCCACTCACTTGAAAACTCAGAGGGGATCTTGCTGACCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCATTGACAGATACGTTGCCATCTGCAACCCTCTTCGCTATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCATTGACAGATACGTTGCCATCTGCAACCCTCTTCGCTATCAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATCATGACCCCCCGGCTCTGTGCTCAACTCTCTGCAGGTTCCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATCATGACCCCCCGGCTCTGTGCTCAACTCTCTGCAGGTTCCTGCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCGGTTTCCTTATCCTGCTTCCCGAGATTGTGATGATTTCCACACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCGGTTTCCTTATCCTGCTTCCCGAGATTGTGATGATTTCCACACTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGGCCCAACCAAATCCATCAGATCTTCTGTGACTTGGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGGGCCCAACCAAATCCATCAGATCTTCTGTGACTTGGTCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTAAGCCTGGCCTGTACAGACACGTCCATGATTCTGATTGAGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTAAGCCTGGCCTGTACAGACACGTCCATGATTCTGATTGAGGATGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTCATGCTGTGACCATCATCATTACCTTCCTAATCATTGCCCTGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTCATGCTGTGACCATCATCATTACCTTCCTAATCATTGCCCTGTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTAAGAATTGTCACTGTGATATTGAGGATTCCCTCTTCTGAAGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTAAGAATTGTCACTGTGATATTGAGGATTCCCTCTTCTGAAGGGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAAAGGCTTTTTCTACCTGTGCAGGCCACCTCATGGTCTTCCCGATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAAAGGCTTTTTCTACCTGTGCAGGCCACCTCATGGTCTTCCCGATATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGCAGTGTATCACTCATGTACTTGCGTTTCAGCGACACTTATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCAGTGTATCACTCATGTACTTGCGTTTCAGCGACACTTATCCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGTTTTGGACACAGCCATTGCACTGATGTTTACTGTACTTGCTCCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGTTTTGGACACAGCCATTGCACTGATGTTTACTGTACTTGCTCCATTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAATCCCATCATTTATAGCCTGAGAAACAAGGACATGAACAATGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAATCCCATCATTTATAGCCTGAGAAACAAGGACATGAACAATGCGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 AAAAAACTGTTCTGTCTTCAAAAAGTGTTGAACAAGCCTGGAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAAAACTGTTCTGTCTTCAAAAAGTGTTGAACAAGCCTGGAGGT