seq1 = pF1KE6021.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE6021/gi568815587r_4703436.tfa (gi568815587r:4703436_4904380), 200945 bp

>pF1KE6021 945
>gi568815587r:4703436_4904380 (Chr11)

(complement)

1-945  (100001-100945)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCTGGCTTCAGGGAACAGCTCTTCTCATCCTGTGTCCTTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCTGGCTTCAGGGAACAGCTCTTCTCATCCTGTGTCCTTCATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTGGAATCCCAGGCCTGGAGAGTTTCCAGTTGTGGATTGCCTTTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTGGAATCCCAGGCCTGGAGAGTTTCCAGTTGTGGATTGCCTTTCCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGTGCCACGTATGCTGTGGCTGTTGTTGGAAATATCACTCTCCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGTGCCACGTATGCTGTGGCTGTTGTTGGAAATATCACTCTCCTCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAATCAGAATTGACCACACCCTGCATGAGCCCATGTACCTCTTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAATCAGAATTGACCACACCCTGCATGAGCCCATGTACCTCTTTCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGCCGGCCATCACTGACCTGGTCCTCTCCTCCTCCACTCAACCTAAGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGCTGGCCATCACTGACCTGGTCCTCTCCTCCTCCACTCAACCTAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTTGGCCATATTCTGGTTTCATGCTCATGAGATTCAGTACCATGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTTGGCCATATTCTGGTTTCATGCTCATGAGATTCAGTACCATGCCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCATCCAGGTGTTCTTCATCCATGCCTTTTCTTCTGTGGAGTCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCATCCAGGTGTTCTTCATCCATGCCTTTTCTTCTGTGGAGTCTGGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCATGGCTATGGCCCTGGACTGCTACGTGGCTATCTGCTTCCCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCATGGCTATGGCCCTGGACTGCTACGTGGCTATCTGCTTCCCACTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GACACTCTAGCATCCTGACCCCATCGGTCGTGATCAAACTGGGGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GACACTCTAGCATCCTGACCCCATCGGTCGTGATCAAACTGGGGACCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGATGCTGAGAGGGCTGCTGTGGGTGAGCCCCTTCTGCTTCATGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGATGCTGAGAGGGCTGCTGTGGGTGAGCCCCTTCTGCTTCATGGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAGGATGCCCTTCTGCCAACACCAAGCCATTCCCCAGTCATACTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAGGATGCCCTTCTGCCAACACCAAGCCATTCCCCAGTCATACTGTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACATGGCTGTGCTGAAGTTGGTGTGTGCTGATACAAGCATAAGTCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACATGGCTGTGCTGAAGTTGGTGTGTGCTGATACAAGCATAAGTCGTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGGGCTCTTTGTGGCCTTCTCTGTGGCTGGCTTTGATATGATTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGGGCTCTTTGTGGCCTTCTCTGTGGCTGGCTTTGATATGATTGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGTATGTCATACGTGATGATTTTGAGAGCTGTGCTTCAGTTGCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGTATGTCATACGTGATGATTTTGAGAGCTGTGCTTCAGTTGCCCTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGAAGCCCGCCTCAAAGCTTTTAGCACACGTTCCTCCCATATCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGAAGCCCGCCTCAAAGCTTTTAGCACACGTTCCTCCCATATCTGTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTGGCTCTTTATATCCCAGCCCTTTTTTCTTTCCTCACCTACCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTTGGCTCTTTATATCCCAGCCCTTTTTTCTTTCCTCACCTACCGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGCCATGATGTGCCCCGAGTTGTACACATCCTGTTTGCTAATCTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGCCATGATGTGCCCCGAGTTGTACACATCCTGTTTGCTAATCTCTATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TACTGATACCTCCCATGCTCAACCCCATCATTTATGGAGTTAGAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TACTGATACCTCCCATGCTCAACCCCATCATTTATGGAGTTAGAACCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 CAGATCGGGGACAGGGTTATCCAAGGATGTTGTGGAAACATCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGATCGGGGACAGGGTTATCCAAGGATGTTGTGGAAACATCCCC