seq1 = pF1KE6008.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE6008/gi568815587r_58258128.tfa (gi568815587r:58258128_58459069), 200942 bp

>pF1KE6008 942
>gi568815587r:58258128_58459069 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATAATACAGAGGTGAGTGAATTCATCCTGCTTGGTCTAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATAATACAGAGGTGAGTGAATTCATCCTGCTTGGTCTAACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCCCAGAACTACAGGTTCCCCTCTTTATCATGTTTACCCTCATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCCCAGAACTACAGGTTCCCCTCTTTATCATGTTTACCCTCATCTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCACTCTGACTGGGAACCTGGGGATGATCATATTAATCCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCACTCTGACTGGGAACCTGGGGATGATCATATTAATCCTGCTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCATCTCCACACTCCCATGTACTTTTTTCTCAGTAACCTGTCTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTCATCTCCACACTCCCATGTACTTTTTTCTCAGTAACCTGTCTCTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGCATTGGTTACTCCTCAGCTGTCACTCCAAAGGTTTTAACTGGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGCATTGGTTACTCCTCAGCTGTCACTCCAAAGGTTTTAACTGGGTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTATAGAAGACAAAGCCATCTCCTACAGTGCCTGTGCTGCTCAGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTATAGAAGACAAAGCCATCTCCTACAGTGCCTGTGCTGCTCAGATGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTGTGCAGTCTTTGCCACTGTGGAAAATTACCTCTTGTCCTCAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTGTGCAGTCTTTGCCACTGTGGAAAATTACCTCTTGTCCTCAATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGACCGCTACGCAGCAGTGTGTAACCCCCTACATTATACCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGACCGCTACGCAGCAGTGTGTAACCCCCTACATTATACCACCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACAACACGTGTGTGTGCTTGTCTGGCTATAGGCTGTTATGTCATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACAACACGTGTGTGTGCTTGTCTGGCTATAGGCTGTTATGTCATTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTGAATGCTTCTATCCAAATTGGAGATACATTTCGCCTCTCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTGAATGCTTCTATCCAAATTGGAGATACATTTCGCCTCTCTTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGTCCAATGTGATTCATCACTTTTTCTGTGACAAACCAGCAGTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGTCCAATGTGATTCATCACTTTTTCTGTGACAAACCAGCAGTCATTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCTGACCTGCTCTGAGAAACACATTAGTGAGTTGATTCTTGTTCTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCTGACCTGCTCTGAGAAACACATTAGTGAGTTGATTCTTGTTCTTATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCAAGTTTTAATGTCTTTTTTGCACTTCTTGTTACCTTGATTTCCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCAAGTTTTAATGTCTTTTTTGCACTTCTTGTTACCTTGATTTCCTATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTCATATTGATCACCATTCTTAAGAGGCACACAGGTAAGGGATACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTCATATTGATCACCATTCTTAAGAGGCACACAGGTAAGGGATACCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCCTTTATCTACCTGTGGTTCTCACCTCATTGCCATTTTCTTATTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCCTTTATCTACCTGTGGTTCTCACCTCATTGCCATTTTCTTATTTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATAACTGTCATCATCATGTACATACGACCAAGTTCCAGTCATTCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATAACTGTCATCATCATGTACATACGACCAAGTTCCAGTCATTCCATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACAGACAAAATTGCATCTGTGTTCTACACTATGATCATCCCCATGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACAGACAAAATTGCATCTGTGTTCTACACTATGATCATCCCCATGCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTCCTATAGTCTATACCCTGAGGAACAAAGACGTGAAGAATGCATTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTCCTATAGTCTATACCCTGAGGAACAAAGACGTGAAGAATGCATTCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGTTGTTGAGAAGGCAAAATATTCTCTAGATTCAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGTTGTTGAGAAGGCAAAATATTCTCTAGATTCAGTCTTT