seq1 = pF1KE6002.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE6002/gi568815587r_4814722.tfa (gi568815587r:4814722_5015663), 200942 bp

>pF1KE6002 942
>gi568815587r:4814722_5015663 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTGGGATCCCTGGGAAACAGCAGCAGCAGCGTTTCTGCTACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTGGGATCCCTGGGAAACAGCAGCAGCAGCGTTTCTGCTACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGAGTGGCATCCCTGGGCTGGAGCGCATGCACATCTGGATCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGAGTGGCATCCCTGGGCTGGAGCGCATGCACATCTGGATCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCACTGTGCTTCATGTATCTGGTTTCCATCCCGGGCAACTGCACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCACTGTGCTTCATGTATCTGGTTTCCATCCCGGGCAACTGCACAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTTTTATCATTAAAACAGAGCGCTCACTTCATGAACCTATGTATCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTTTTATCATTAAAACAGAGCGCTCACTTCATGAACCTATGTATCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGTCCATGCTGGCTCTGATTGACCTGGGTCTCTCCCTTTGCACTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGTCCATGCTGGCTCTGATTGACCTGGGTCTCTCCCTTTGCACTCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTACAGTCCTGGGCATCTTTTGGGTTGGAGCACGAGAAATTAGCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTACAGTCCTGGGCATCTTTTGGGTTGGAGCACGAGAAATTAGCCATGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTGCTTTGCTCAGCTCTTTTTCATTCACTGCTTCTCCTTCCTCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTGCTTTGCTCAGCTCTTTTTCATTCACTGCTTCTCCTTCCTCGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTGTGCTACTGTCTATGGCCTTTGACCGCTTTGTGGCTATCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTGTGCTACTGTCTATGGCCTTTGACCGCTTTGTGGCTATCTGCCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTGCACTATGTTTCCATTCTCACCAACACAGTCATTGGCAGGATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTGCACTATGTTTCCATTCTCACCAACACAGTCATTGGCAGGATTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTCTCTCTGGGTCGTAGTGTAGCACTCATTTTTCCATTACCTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTCTCTCTGGGTCGTAGTGTAGCACTCATTTTTCCATTACCTTTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTCAAAAGATTCCCCTATTGTGGCTCCCCAGTTCTCTCACATTCTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTCAAAAGATTCCCCTATTGTGGCTCCCCAGTTCTCTCACATTCTTATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTCTCCACCAAGAAGTGATGAAATTGGCCTGTGCCGACATGAAGGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTCTCCACCAAGAAGTGATGAAATTGGCCTGTGCCGACATGAAGGCCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCATCTACGGCATGTTTGTCATCGTCTCTACAGTGGGTATAGACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCATCTACGGCATGTTTGTCATCGTCTCTACAGTGGGTATAGACTCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTCATCCTCTTCTCTTATGCTCTGATCCTGCGCACCGTGCTGTCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTCATCCTCTTCTCTTATGCTCTGATCCTGCGCACCGTGCTGTCCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTCCAGGGCTGAGAGATTCAAGGCCCTTAACACCTGTGTTTCCCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTCCAGGGCTGAGAGATTCAAGGCCCTTAACACCTGTGTTTCCCACATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGTGCTGTGCTGCTCTTCTACACTCCCATGATTGGCCTCTCTGTCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGTGCTGTGCTGCTCTTCTACACTCCCATGATTGGCCTCTCTGTCATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCGCTTTGGAAAGCAGGCACCCCACCTGGTCCAGGTGGTCATGGGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCGCTTTGGAAAGCAGGCACCCCACCTGGTCCAGGTGGTCATGGGTTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTATCTTCTCTTTCCTCCTGTGATGAATCCCATTGTCTACAGTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTATCTTCTCTTTCCTCCTGTGATGAATCCCATTGTCTACAGTGTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAAACAGATCCGGGATCGAGTGACGCATGCCTTTTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCAAACAGATCCGGGATCGAGTGACGCATGCCTTTTGTTAC