seq1 = pF1KE5972.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5972/gi568815586f_55300529.tfa (gi568815586f:55300529_55501464), 200936 bp

>pF1KE5972 936
>gi568815586f:55300529_55501464 (Chr12)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAATATGACATCAATTAGAGAATTCATTCTTCTGGGATTTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAAATATGACATCAATTAGAGAATTCATTCTTCTGGGATTTACAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAACCCAGAGTTACAAGTTGTGATATTCTTCTTTATGTTGATCACATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAACCCAGAGTTACAAGTTGTGATATTCTTCTTTATGTTGATCACATACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTGAGTGTAAGTGGAAACATGATCATCATTATGTTAACATTGTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTGAGTGTAAGTGGAAACATGATCATCATTATGTTAACATTGTCAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTCATTTGAAAACTCCTATGTATTTCTTCCTCAGGAATTTCTCTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTCATTTGAAAACTCCTATGTATTTCTTCCTCAGGAATTTCTCTTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAATTTCATTTACGACAGTCTTCATTCCTAGATTTCTGATCAACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAAATTTCATTTACGACAGTCTTCATTCCTAGATTTCTGATCAACATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTACAGGAGACACAACCATTTCCTATAATGCTTCCATGGCCCAAGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTACAGGAGACACAACCATTTCCTATAATGCTTCCATGGCCCAAGTATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTAATTCTTTTGGGATCAACAGAATTTTTTCTTCTGGCTGTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTTAATTCTTTTGGGATCAACAGAATTTTTTCTTCTGGCTGTCATGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTATGATCGCTATGTGGCTATCTGCAAACCTCTACATTATACAACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTATGATCGCTATGTGGCTATCTGCAAACCTCTACATTATACAACCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGTAACAAAGTCTGTAATTGGCTTGTAATCAGCTCCTGGCTGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGTAACAAAGTCTGTAATTGGCTTGTAATCAGCTCCTGGCTGGCTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTCATTATTTTTCCCCCCGTGATTATGGGCCTCCAACTGGATTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTCATTATTTTTCCCCCCGTGATTATGGGCCTCCAACTGGATTTTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGACTCCAGCACTATTGACCATTTCATCTGTGATTCTTCCCCTATGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGACTCCAGCACTATTGACCATTTCATCTGTGATTCTTCCCCTATGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATTGCTTGCACAGACACACAGTTTCTAGAGCTTATGGCATTTTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATTGCTTGCACAGACACACAGTTTCTAGAGCTTATGGCATTTTTGCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAGTATTCACACTCATGGTAACTTTGGCCTTGGTGGTTCTCTCCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCAGTATTCACACTCATGGTAACTTTGGCCTTGGTGGTTCTCTCCTACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACTCATCCTTAAAACAATTCTGAAGATTCCCTCTGCCCAGCAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACTCATCCTTAAAACAATTCTGAAGATTCCCTCTGCCCAGCAAAGGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGCTTTTTCAACTTGTTCCTCCCATATGATTGTGGTTTCTGTTTCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGCTTTTTCAACTTGTTCCTCCCATATGATTGTGGTTTCTGTTTCTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGAGTTGCATTTTTATGTGTGTAAAAACATCTGCAAAAGAAGGTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGAGTTGCATTTTTATGTGTGTAAAAACATCTGCAAAAGAAGGTATGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTGAGCAAAGGTGTAGCAGTGCTTAATACCTCTGTTGCTCCTATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTGAGCAAAGGTGTAGCAGTGCTTAATACCTCTGTTGCTCCTATGTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCCTTTATTTATACCTTAAGAAACCAGCAGGTGAAACAGGCCCTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCCTTTATTTATACCTTAAGAAACCAGCAGGTGAAACAGGCCCTTAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GAATTCACCAAAAAAATATTATCATTGAACAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAATTCACCAAAAAAATATTATCATTGAACAAGCAA