seq1 = pF1KE5967.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5967/gi568815587f_4807370.tfa (gi568815587f:4807370_5008305), 200936 bp

>pF1KE5967 936
>gi568815587f:4807370_5008305 (Chr11)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTTCTCAATAACTCCGAAGTCAAGCTTTTCCTTCTGATTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTTCTCAATAACTCCGAAGTCAAGCTTTTCCTTCTGATTGGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAGGACTGGAACATGCCCACATTTGGTTCTCCATCCCCATTTGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAGGACTGGAACATGCCCACATTTGGTTCTCCATCCCCATTTGCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGCTTGCCATCATGGGCAACTGCACCATTCTCTTTATTATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGCTTGCCATCATGGGCAACTGCACCATTCTCTTTATTATAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAGAGCCCTCGCTTCATGAGCCCATGTATTATTTCCTTGCCATGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGAGCCCTCGCTTCATGAGCCCATGTATTATTTCCTTGCCATGTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTCTCTGACATGGGCCTGTCCCTCTCCTCCCTTCCTACCATGTTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTCTCTGACATGGGCCTGTCCCTCTCCTCCCTTCCTACCATGTTGAGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTCTTGTTCAATGCCATGGGAATTTCACCTAATGCCTGCTTTGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTCTTGTTCAATGCCATGGGAATTTCACCTAATGCCTGCTTTGCTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAATTCTTCATTCATGGATTCACTGTCATGGAATCCTCAGTACTTCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAATTCTTCATTCATGGATTCACTGTCATGGAATCCTCAGTACTTCTAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATGTCTTTGGACCGCTTTCTTGCCATTCACAATCCCTTAAGATACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATGTCTTTGGACCGCTTTCTTGCCATTCACAATCCCTTAAGATACAGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTATCCTCACTAGCAACAGGGTTGCTAAAATGGGACTTATTTTAGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTATCCTCACTAGCAACAGGGTTGCTAAAATGGGACTTATTTTAGCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGAGCATTCTCTTAGTGATTCCATTTCCCTTCACCTTAAGGAGATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGAGCATTCTCTTAGTGATTCCATTTCCCTTCACCTTAAGGAGATTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATATTGTCAAAAGAATCTTCTTTCTCACTCATACTGTCTTCATCAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATATTGTCAAAAGAATCTTCTTTCTCACTCATACTGTCTTCATCAGGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCATGAAGCTGGCCTGCTCTGACAACAAGACCAATGTCATCTATGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCATGAAGCTGGCCTGCTCTGACAACAAGACCAATGTCATCTATGGCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCATTGCTCTCTGTACTATGCTGGACTTGGCACTGATTGTTTTGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCATTGCTCTCTGTACTATGCTGGACTTGGCACTGATTGTTTTGTCTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGCTGATCTTGAAGACTATACTCAGCATTGCATCTTTGGCAGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGCTGATCTTGAAGACTATACTCAGCATTGCATCTTTGGCAGAGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTAAGGCCCTAAATACCTGTGTCTCCCACATCTGTGCTGTGCTCACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTAAGGCCCTAAATACCTGTGTCTCCCACATCTGTGCTGTGCTCACCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGTGCCCATCATCACCCTGGCTGCCATGCATCACTTTGCCAAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGTGCCCATCATCACCCTGGCTGCCATGCATCACTTTGCCAAGCACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAGCCCTCTTGTTGTGATCCTTATTGCAGATATGTTCTTGTTGGTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAGCCCTCTTGTTGTGATCCTTATTGCAGATATGTTCTTGTTGGTGCCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTTATGAACCCCATTGTGTACTGTGTAAAGACTCGACAAATCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTTATGAACCCCATTGTGTACTGTGTAAAGACTCGACAAATCTGGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGATCTTGGGGAAGTTGCTTAATGTATGTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGATCTTGGGGAAGTTGCTTAATGTATGTGGGAGA