seq1 = pF1KE5963.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5963/gi568815586f_55265111.tfa (gi568815586f:55265111_55466046), 200936 bp

>pF1KE5963 936
>gi568815586f:55265111_55466046 (Chr12)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAAATTCCACAGCAGTAACAGACTTTATTCTTCTTGGATTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAAATTCCACAGCAGTAACAGACTTTATTCTTCTTGGATTGACAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCCACAGTGGCAGGTTGTACTTTTCATATTTCTTCTTGTTACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACCCACAGTGGCAGGTTGTACTTTTCATATTTCTTCTTGTTACCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTAAGTGTGACTGGGAACCTGATCATTATCACCCTCACCCTTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTAAGTGTGACTGGGAACCTGATCATTATCACCCTCACCCTTTCAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCATCTGCAGACTCCCATGTATTTCTTCCTTCGGAACTTCTCATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCATCTGCAGACTCCCATGTATTTCTTCCTTCGGAACTTCTCATTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAATTTCATTCACGTCTGTCTGCATTCCCAGATTCCTTGTCACTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAATTTCATTCACGTCTGTCTGCATTCCCAGATTCCTTGTCACTGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGACAGGAAACAGAACCATTTCTTATAATGGGTGTGTGGCTCAGCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGACAGGAAACAGAACCATTTCTTATAATGGGTGTGTGGCTCAGCTATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTCATCTTCTTGGGGGTGACAGAATTTTACCTTCTGGCTGCCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTTCATCTTCTTGGGGGTGACAGAATTTTACCTTCTGGCTGCCATGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGACCGCTGCATGGCCATCTGCAAACCTCTTCATTACACAATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGACCGCTGCATGGCCATCTGCAAACCTCTTCATTACACAATCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCACCAGAGTGTGTACCCTTCTTGTCTTTAGCTCCTGGCTTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCACCAGAGTGTGTACCCTTCTTGTCTTTAGCTCCTGGCTTGCAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTGATCATCTTTCCACCAGTAATGCTTCTGCTGCAGTTGGATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTGATCATCTTTCCACCAGTAATGCTTCTGCTGCAGTTGGATTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCTCCAATGTAATTGATCATTTTATCTGTGACTCTTCTCCAATGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCTCCAATGTAATTGATCATTTTATCTGTGACTCTTCTCCAATGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCTCTCTTGCACAAACACTCACTTTCTAGAACTCATGGCATTTTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCTCTCTTGCACAAACACTCACTTTCTAGAACTCATGGCATTTTTTTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGTGGTAACACTGATGGTCACCTTGACATTAGTTATTCTCTCCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGTGGTAACACTGATGGTCACCTTGACATTAGTTATTCTCTCCTACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAACATCATCCGGACAATTCTGAAAATTCCTTCTATGAGTCAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAACATCATCCGGACAATTCTGAAAATTCCTTCTATGAGTCAAAGGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGCCTTTTCCACTTGCTCCTCCCATATGATAGTTGTCTCCATCTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGCCTTTTCCACTTGCTCCTCCCATATGATAGTTGTCTCCATCTCTTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGTAGCTGTATCTTCATGTACATTAAGACTTCTGCCAGAGAAAGGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGTAGCTGTATCTTCATGTACATTAAGACTTCTGCCAGAGAAAGGGTGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTAAGCAAAGGAGTAGCTGTGCTCAATACCTCAGTGGCTCCTCTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTAAGCAAAGGAGTAGCTGTGCTCAATACCTCAGTGGCTCCTCTCTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCCTTCATATACACACTGAGAAATAAGCAAGTGAAGCAAGCCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCCTTCATATACACACTGAGAAATAAGCAAGTGAAGCAAGCCTTCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AGCATGGTCCAGAAGATGATTTTTTCTTTAAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCATGGTCCAGAAGATGATTTTTTCTTTAAATAAA