seq1 = pF1KE5957.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5957/gi568815586f_55326254.tfa (gi568815586f:55326254_55527174), 200921 bp

>pF1KE5957 936
>gi568815586f:55326254_55527174 (Chr12)

1-936  (100001-100936)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAATAGAACATCAGTGACAGATTTCATCCTTCTGGGTCTGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAAATAGAACATCAGTGACAGATTTCATCCTTCTGGGTCTGACGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATCCGCAACTGCAGGTTGTGATTTTCTCGTTTCTATTTCTTACGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100051 TAATCCGCAACTGCAGGTTGTGATTTTCTCGTTCCTATTTCTTACGTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACTGAGTGTTACTGGAAATCTAACTATCATCTCCCTTACCCTGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACTGAGTGTTACTGGAAATCTAACTATCATCTCCCTTACCCTGCTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCACCTGAAGACCCCCATGTATTTCTTCCTCAGGAATTTCTCCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCACCTGAAGACCCCCATGTATTTCTTCCTCAGGAATTTCTCCTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATTTCATTTACTTCTGTCTGTAATCCTAGATTTCTGATCAGCATTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATTTCATTTACTTCTGTCTGTAATCCTAGATTTCTGATCAGCATTCTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGGGGACAAATCCATATCTTATAATGCTTGTGCAGCTCAGCTATTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGGGGACAAATCCATATCTTATAATGCTTGTGCAGCTCAGCTATTTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTATCTTCCTTGGCTCAACGGAGTTTTTCCTCCTGGCCTCTATGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTATCTTCCTTGGCTCAACGGAGTTTTTCCTCCTGGCCTCTATGTCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATTGCTATGTGGCTATATGTAAGCCTCTGCATTATACAACCATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATTGCTATGTGGCTATATGTAAGCCTCTGCATTATACAACCATCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGACAGGATCTGTTATCAGCTTATAATCAGCTCTTGGCTGGCTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGACAGGATCTGTTATCAGCTTATAATCAGCTCTTGGCTGGCTGGTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGGTAATTTTTCCACCACTGGCCATGGGCTTACAGCTGGATTTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGGTAATTTTTCCACCACTGGCCATGGGCTTACAGCTGGATTTCTGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCAATGTCATTGACCACTTTACCTGTGACTCTGCTCCTTTGCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCAATGTCATTGACCACTTTACCTGTGACTCTGCTCCTTTGCTGCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTCTTGCACAGACACAAGTACTCTAGAGCTCATGAGCTTTATTTTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCTTGCACAGACACAAGTACTCTAGAGCTCATGAGCTTTATTTTAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTTTACTCTTATATCCACTTTGATATTAGTAATTCTCTCCTATACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTTTACTCTTATATCCACTTTGATATTAGTAATTCTCTCCTATACTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCATCAGAACTATTCTGAGAATCCCCTCAGCACAGCAAAGAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCATCAGAACTATTCTGAGAATCCCCTCAGCACAGCAAAGAAAAAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTTTTCAACCTGCTCCTCACATGTGATTGTTGTCTCTATCTCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTTTTCAACCTGCTCCTCACATGTGATTGTTGTCTCTATCTCTTATGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCTGCATCTTCATGTATGTGAAAACATCAGCAAAGGAAGGAGTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCTGCATCTTCATGTATGTGAAAACATCAGCAAAGGAAGGAGTTGCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACAAAAGGAGTAGCTATACTCAATACCTCTGTCGCTCCTATGCTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACAAAAGGAGTAGCTATACTCAATACCTCTGTCGCTCCTATGCTGAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CATTTATTTACACTCTAAGAAACCAGCAGGTGAAACAAGCATTTAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CATTTATTTACACTCTAAGAAACCAGCAGGTGAAACAAGCATTTAAGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GTTCTGAGAAAGATTTCCCACAAAAAAAAAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTTCTGAGAAAGATTTCCCACAAAAAAAAAAAACAC