seq1 = pF1KE5956.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5956/gi568815587r_123653583.tfa (gi568815587r:123653583_123854518), 200936 bp

>pF1KE5956 936
>gi568815587r:123653583_123854518 (Chr11)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAAATGGCACAGTAATCACAGAATTCATCCTGCTAGGCTTTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAAATGGCACAGTAATCACAGAATTCATCCTGCTAGGCTTTCCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCCAAGGCCTACAAACACCTCTCTTTATTGCAATCTTTCTCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATCCAAGGCCTACAAACACCTCTCTTTATTGCAATCTTTCTCACCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTAACCCTTGCAGGCAATGGGCTTATTATTGCCACTGTGTGGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTAACCCTTGCAGGCAATGGGCTTATTATTGCCACTGTGTGGGCTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAGGCTACAAATTCCAATGTACTTCTTCCTTTGTAACTTGTCTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAGGCTACAAATTCCAATGTACTTCTTCCTTTGTAACTTGTCTTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAATCTGGTACACCACCACAGTCATCCCCAAACTGCTAGGAACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAAATCTGGTACACCACCACAGTCATCCCCAAACTGCTAGGAACCTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGTGGCAAGAACAGTAATCTGCATGTCCTGCTGCCTGCTGCAGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGTGGCAAGAACAGTAATCTGCATGTCCTGCTGCCTGCTGCAGGCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCACTTCTTCGTGGGCACCACCGAGTTCTTGATCCTCACTATCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCACTTCTTCGTGGGCACCACCGAGTTCTTGATCCTCACTATCATGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTGACCGCTACCTCACCATCTGCAATCCCCTTCACCACCCCACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTGACCGCTACCTCACCATCTGCAATCCCCTTCACCACCCCACCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACCAGCAAACTCTGCCTGCAGCTGGCCCTGAGCTCCTGGGTGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACCAGCAAACTCTGCCTGCAGCTGGCCCTGAGCTCCTGGGTGGTGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCACCATTGTCTTTTGTCAGACGATGCTGCTCATCCAGTTGCCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCACCATTGTCTTTTGTCAGACGATGCTGCTCATCCAGTTGCCATTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGCAATAATGTTATCAGTCATTTCTACTGTGATGTTGGGCCCAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGCAATAATGTTATCAGTCATTTCTACTGTGATGTTGGGCCCAGTTTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGCCGCCTGCATAGACACCAGCATTTTGGAACTCCTGGGCGTCATAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGCCGCCTGCATAGACACCAGCATTTTGGAACTCCTGGGCGTCATAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCATCCTTGTGATCCCAGGGTCACTTCTCTTTAATATGATTTCTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCATCCTTGTGATCCCAGGGTCACTTCTCTTTAATATGATTTCTTATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACATTCTGTCCGCAATCCTACGAATTCCTTCAGCCACTGGCCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACATTCTGTCCGCAATCCTACGAATTCCTTCAGCCACTGGCCACCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGACTTTCTCTACCTGTGCCTCGCACCTGACAGTTGTCTCCCTGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGACTTTCTCTACCTGTGCCTCGCACCTGACAGTTGTCTCCCTGCTCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGGCTGTTCTGTTCATGTACCTAAGACCCACAGCACACTCCTCCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGGCTGTTCTGTTCATGTACCTAAGACCCACAGCACACTCCTCCTTTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATTAATAAGGTGGTGTCTGTGCTAAATACTATCCTCACCCCCCTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATTAATAAGGTGGTGTCTGTGCTAAATACTATCCTCACCCCCCTTCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCCTTTATTTATACTATTAGAAACAAGGAGGTGAAGGGAGCCTTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCCTTTATTTATACTATTAGAAACAAGGAGGTGAAGGGAGCCTTAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGGCAATGACTTGCCCAAAGACTGGTCATGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGCAATGACTTGCCCAAAGACTGGTCATGCAAAG