seq1 = pF1KE5955.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5955/gi568815586r_55369203.tfa (gi568815586r:55369203_55570138), 200936 bp

>pF1KE5955 936
>gi568815586r:55369203_55570138 (Chr12)

(complement)

1-936  (100001-100936)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAATCATACAAGGCAGATAGAATTTATTCTTCTGGGACTGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAATCATACAAGGCAGATAGAATTTATTCTTCTGGGACTGACGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATTCTCAGTTACAGATTGTAATTTTCTTATTTCTACTTCTAAATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAATTCTCAGTTACAGATTGTAATTTTCTTATTTCTACTTCTAAATTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTGAGCATGATAGGGAACTTCACTATCATTGCCCTCATTCTGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTGAGCATGATAGGGAACTTCACTATCATTGCCCTCATTCTGCTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCAGCTCAAGACTCCAATGTATTTCTTCCTCCGTAATTTCTCTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCAGCTCAAGACTCCAATGTATTTCTTCCTCCGTAATTTCTCTTTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAATTTCATTCACAACTGCTTGCATTCCCAGATTCCTAATCACCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAATTTCATTCACAACTGCTTGCATTCCCAGATTCCTAATCACCATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTACCAGGGAAAAGACCATTTCCTGTAATGGTTGCATATCTCAGTTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTACCAGGGAAAAGACCATTTCCTGTAATGGTTGCATATCTCAGTTGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTACATATTCTTGGGGGTTACAGAATTTTTCCTTCTAGCTGCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTACATATTCTTGGGGGTTACAGAATTTTTCCTTCTAGCTGCTCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGATCGCTATGTTGCCATCTGCAAACCTTTGCGTTATATGTCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGATCGCTATGTTGCCATCTGCAAACCTTTGCGTTATATGTCCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGTAACAAAGTTTGCTACCAGCTTGTATTCAGTTCTTGGGTAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGTAACAAAGTTTGCTACCAGCTTGTATTCAGTTCTTGGGTAACTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCCTGATCATTTTCACTCCACTGATTTTAGGTCTTAACTTGGATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCCTGATCATTTTCACTCCACTGATTTTAGGTCTTAACTTGGATTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTTCAAATATCATTGATCATTTCATTTGTGACATTTCTCCTATCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100501 TGCTTCAAATATCATTGATCATTTCATTTGTGACATTTCTCTTATCCTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACTTTCTTGCTCAGACACACATTTACTGGAACTGATTGCCTTTTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACTTTCTTGCTCAGACACACATTTACTGGAACTGATTGCCTTTTTATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGTGATGACACTTATTGTCACATTGTTTTTAGTAATCCTTTCTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGTGATGACACTTATTGTCACATTGTTTTTAGTAATCCTTTCTTACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACATCATCAAGACAATTCTGAAATTCCCTTCAGCTCAGCAAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACATCATCAAGACAATTCTGAAATTCCCTTCAGCTCAGCAAAAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGCCTTTTCCACCTGCTCTTCTCACATGATTGTTGTCTCCATCACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGCCTTTTCCACCTGCTCTTCTCACATGATTGTTGTCTCCATCACTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTAGTTGTATGTTTATCTACATAAAGCCATCAGCGAATGAAAGAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTAGTTGTATGTTTATCTACATAAAGCCATCAGCGAATGAAAGAGTTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTAAGCAAAGGAGTAACTGTGCTCAATACTTCAGTTGCCCCGTTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTAAGCAAAGGAGTAACTGTGCTCAATACTTCAGTTGCCCCGTTGTTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCATTTATTTATACTCTGAGGAATCAGCAAGTTAAACAAGCCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCATTTATTTATACTCTGAGGAATCAGCAAGTTAAACAAGCCTTCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GCTGTATTTAGAAAGATATTTTCTGCTTCAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCTGTATTTAGAAAGATATTTTCTGCTTCAGACAAG