seq1 = pF1KE5948.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5948/gi568815597r_158319931.tfa (gi568815597r:158319931_158520866), 200936 bp

>pF1KE5948 936
>gi568815597r:158319931_158520866 (Chr1)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGGTCAATGAGACTGTGGTGAGAGAGGTCATCTTCCTCGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGGTCAATGAGACTGTGGTGAGAGAGGTCATCTTCCTCGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCATCCCTGGCCAGGCTGCAGCAGCTGCTCTTTGTTATCTTCCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCATCCCTGGCCAGGCTGCAGCAGCTGCTCTTTGTTATCTTCCTGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTGTTCACTCTGGGCACCAATGCAATCATCATTTCCACCATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTGTTCACTCTGGGCACCAATGCAATCATCATTTCCACCATTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGACAGGGCCCTTCATATCCCCATGTACTTCTTCCTTGCCATCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGACAGGGCCCTTCATATCCCCATGTACTTCTTCCTTGCCATCCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTGCTCTGAGATTTGCTACACCTTCATCATTGTACCCAAGATGCTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTGCTCTGAGATTTGCTACACCTTCATCATTGTACCCAAGATGCTGGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGCTGTCCCAGAAGAAGACCATTTCTTTCCTGGGCTGTGCCATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGCTGTCCCAGAAGAAGACCATTTCTTTCCTGGGCTGTGCCATCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTTTCCTTCCTCTTCCTTGGCTGCTCTCACTCCTTTCTGCTGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTTTCCTTCCTCTTCCTTGGCTGCTCTCACTCCTTTCTGCTGGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGGTTATGATCGTTACATAGCCATCTGTAACCCACTGCGCTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGGTTATGATCGTTACATAGCCATCTGTAACCCACTGCGCTACTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTAATGGGACATGGGGTGTGTATGGGACTAGTGGCTGCTGCCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTAATGGGACATGGGGTGTGTATGGGACTAGTGGCTGCTGCCTGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGGCTTCACTGTTGCACAGATCATCACATCCTTGGTATTTCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGGCTTCACTGTTGCACAGATCATCACATCCTTGGTATTTCACCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTTTATTCCTCCAATCAACTACATCACTTCTTCTGTGACATTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTTTATTCCTCCAATCAACTACATCACTTCTTCTGTGACATTGCTCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTCAAGCTGGCATCTCACCATAACCACTTTAGTCAGATTGTCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTCAAGCTGGCATCTCACCATAACCACTTTAGTCAGATTGTCATCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGCTCTGTACATTGGTCCTGGCTATCCCCTTATTGTTGATCTTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGCTCTGTACATTGGTCCTGGCTATCCCCTTATTGTTGATCTTGGTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGTTCACATCCTCTCTGCCATACTTCAGTTTCCTTCCACACTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGTTCACATCCTCTCTGCCATACTTCAGTTTCCTTCCACACTGGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTGCAAAGCTTTTTCTACCTGTGTATCTCACCTCATTATTGTCACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTGCAAAGCTTTTTCTACCTGTGTATCTCACCTCATTATTGTCACTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CACTATGGCTGTGCCTCCTTTATCTACTTAAGGCCTCAGTCCAACTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CACTATGGCTGTGCCTCCTTTATCTACTTAAGGCCTCAGTCCAACTACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCAAGCCAGGATGCTCTAATATCAGTATCCTACACTATTATAACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCAAGCCAGGATGCTCTAATATCAGTATCCTACACTATTATAACTCCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTCAACCCAATGATTTATAGCTTGAGAAATAAAGAGTTCAAATCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTCAACCCAATGATTTATAGCTTGAGAAATAAAGAGTTCAAATCAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTTTGTAAAATTGTGAGAAGAACAATTTCCCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTTGTAAAATTGTGAGAAGAACAATTTCCCTGTTG