seq1 = pF1KE5943.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5943/gi568815579r_9113902.tfa (gi568815579r:9113902_9314837), 200936 bp

>pF1KE5943 936
>gi568815579r:9113902_9314837 (Chr19)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCAGAAAACCTTACAGAATTATCAAAATTTCTCCTCCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCAGAAAACCTTACAGAATTATCAAAATTTCTCCTCCTGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGATGATCCTGAACTGCAGCCCGTCCTCTTTGGGCTGTTCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGATGATCCTGAACTGCAGCCCGTCCTCTTTGGGCTGTTCCTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGTCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATTCTGGCCGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGTCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATTCTGGCCGTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTGTTGACATCTGTTTCATCTCCACCACAGTCCCCAAGATGCTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTGTTGACATCTGTTTCATCTCCACCACAGTCCCCAAGATGCTAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATCCAGGCACGGAGCAAAGACATCTCCTACATGGGGTGCCTCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATCCAGGCACGGAGCAAAGACATCTCCTACATGGGGTGCCTCACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTATTTTTTAATGATGTTTGCTGGAATGGATACTTTCCTACTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGTATTTTTTAATGATGTTTGCTGGAATGGATACTTTCCTACTGGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGACCGGTTTGTGGCCATCTGCCACCCACTGCACTACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGACCGGTTTGTGGCCATCTGCCACCCACTGCACTACACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAACCCCTGCCTCTGTGGCCTCCTGGTTCTGGCATCTTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAACCCCTGCCTCTGTGGCCTCCTGGTTCTGGCATCTTGGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCATTTTCTGGTTCTCCCTGGTTCATATTCTACTGATGAAGAGGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCATTTTCTGGTTCTCCCTGGTTCATATTCTACTGATGAAGAGGTTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTCCACAGGCACTGAGATTCCGCATTTCTTCTGTGAACCGGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTCCACAGGCACTGAGATTCCGCATTTCTTCTGTGAACCGGCTCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTCAAGGTGGCCTGCTCTAACACCCTCCTCAATAACATTGTCTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTCAAGGTGGCCTGCTCTAACACCCTCCTCAATAACATTGTCTTGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCCACGGCACTGCTGGGTGTGTTTCCTGTAGCTGGGATCCTCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCCACGGCACTGCTGGGTGTGTTTCCTGTAGCTGGGATCCTCTTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACTCTCAGATTGTCTCCTCCTTAATGGGAATGTCCTCCACCAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACTCTCAGATTGTCTCCTCCTTAATGGGAATGTCCTCCACCAAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGTACAAAGCCTTTTCCACCTGTGGATCTCACCTCTGTGTGGTCTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGTACAAAGCCTTTTCCACCTGTGGATCTCACCTCTGTGTGGTCTCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGAACAGGACTTGGGGTCTATCTGAGTTCTGCTGTGACCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGAACAGGACTTGGGGTCTATCTGAGTTCTGCTGTGACCCATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCCCAGAGCAGCTCCACCGCCTCAGTGATGTACGCCATGGTCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCCCAGAGCAGCTCCACCGCCTCAGTGATGTACGCCATGGTCACCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGATGTGAAGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGATGTGAAGGGGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTGGAAAGACTCCTCAGCAGGGCCGACTCTTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGGAAAGACTCCTCAGCAGGGCCGACTCTTGTCCA