seq1 = pF1KE5942.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5942/gi568815579r_9026015.tfa (gi568815579r:9026015_9226950), 200936 bp

>pF1KE5942 936
>gi568815579r:9026015_9226950 (Chr19)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGCAGGAAACTTCTCAGACACTCCAGAATTCTTTCTCTTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGCAGGAAACTTCTCAGACACTCCAGAATTCTTTCTCTTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCAGGGGATCCGGAGCTGCAGCCCATCCTCTTCATGCTGTTCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCAGGGGATCCGGAGCTGCAGCCCATCCTCTTCATGCTGTTCCTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGCCACAATGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGCCACAATGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCGTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCCTCCTCTCTATCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCCTCCTCTCTATCCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGGTCGACATCTGTTTCACCTCCACCACGATGCCCAAGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGGTCGACATCTGTTTCACCTCCACCACGATGCCCAAGATGCTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATCCAGGCACAGGCTCAATCCATCAATTACACAGGCTGCCTCACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATCCAGGCACAGGCTCAATCCATCAATTACACAGGCTGCCTCACCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTGCTTTGTCCTGGTTTTTGTTGGATTGGAAAATGGAATTCTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTGCTTTGTCCTGGTTTTTGTTGGATTGGAAAATGGAATTCTGGTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGATCGATTTGTGGCCATCTGTCACCCACTGAGGTACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGATCGATTTGTGGCCATCTGTCACCCACTGAGGTACAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAACCCCAAACTCTGTGGGCTGCTGCTTCTGCTGTCCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAACCCCAAACTCTGTGGGCTGCTGCTTCTGCTGTCCTTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTTAGTGTCCTGGATGCTCTGCTGCACACGTTGATGGTGCTACAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTTAGTGTCCTGGATGCTCTGCTGCACACGTTGATGGTGCTACAGCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGCATAGACCTGGAAATTCCCCACTTTTTCTGTGAACTAGCTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGCATAGACCTGGAAATTCCCCACTTTTTCTGTGAACTAGCTCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCTCAAGCTCGCCTGTTCTGATGTCCTCATCAATAACATCCTGGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCTCAAGCTCGCCTGTTCTGATGTCCTCATCAATAACATCCTGGTGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGGTGACCAGCCTGTTAGGTGTTGTTCCTCTCTCTGGGATCATTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGGTGACCAGCCTGTTAGGTGTTGTTCCTCTCTCTGGGATCATTTTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACACACGAATTGTCTCCTCTGTCATGAAAATTCCATCAGCTGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACACACGAATTGTCTCCTCTGTCATGAAAATTCCATCAGCTGGTGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGTATAAAGCTTTTTCCATCTGCGGGTCACATTTAATCGTTGTTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGTATAAAGCTTTTTCCATCTGCGGGTCACATTTAATCGTTGTTTCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTTATGGAACAGGGTTTGGGGTGTACCTTAGTTCTGGGGCTACCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTTATGGAACAGGGTTTGGGGTGTACCTTAGTTCTGGGGCTACCCACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCAGGAAGGGTGCAATAGCATCAGTGATGTATACCGTGGTCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCCAGGAAGGGTGCAATAGCATCAGTGATGTATACCGTGGTCACCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAACCCACTCATTTACAGCCTGAGAAACAAGGACATGTTGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAACCCACTCATTTACAGCCTGAGAAACAAGGACATGTTGAAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 TTGAGGAAACTAATATCTAGGATACCATCTTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGAGGAAACTAATATCTAGGATACCATCTTTCCAT