seq1 = pF1KE5939.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5939/gi568815579r_9014831.tfa (gi568815579r:9014831_9215763), 200933 bp

>pF1KE5939 933
>gi568815579r:9014831_9215763 (Chr19)

(complement)

1-933  (100001-100933)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACCCAGAAACCAAACAGCTGTTTCAGAATTTCTTCTCATGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACCCAGAAACCAAACAGCTGTTTCAGAATTTCTTCTCATGAAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAGAGGACCCAGAACTGAAGTTAATCCCTTTCAGCCTGTTCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAGAGGACCCAGAACTGAAGTTAATCCCTTTCAGCCTGTTCCTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGTCACCATCCTGGGGAACCTGCTCATTCTCCTGGCTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGTCACCATCCTGGGGAACCTGCTCATTCTCCTGGCTGTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCCTTCTCTTTAATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCCTTCTCTTTAATCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTACTGACATCTGTTTAACCACAACCACAGTCCCAAAGATCCTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTACTGACATCTGTTTAACCACAACCACAGTCCCAAAGATCCTAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATCCAAGCTCAGAATCAGAGTATCACTTACACAGGCTGCCTCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATCCAAGCTCAGAATCAGAGTATCACTTACACAGGCTGCCTCACCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTGTCTTGTCTTGGTTTTTGCTGGCTTGGAAAGTTGCTTTCTTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTGTCTTGTCTTGGTTTTTGCTGGCTTGGAAAGTTGCTTTCTTGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTACGACCGCTATGTGGCCATTTGCCACCCACTGAGGTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTACGACCGCTATGTGGCCATTTGCCACCCACTGAGGTACACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTCATGAATGTCCATTTCTGGGGCTTGCTGATTCTTCTCTCCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTCATGAATGTCCATTTCTGGGGCTTGCTGATTCTTCTCTCCATGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGAGCACTATGGATGCCCTGGTTCAGAGTCTGATGGTATTGCAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGAGCACTATGGATGCCCTGGTTCAGAGTCTGATGGTATTGCAGCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGCAAAAACGTTGAAATCCCTTTGTTCTTCTGTGAAGTCGTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGCAAAAACGTTGAAATCCCTTTGTTCTTCTGTGAAGTCGTTCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATCAAGCTCGCCTGTTCTGACACCCTCATCAACAACATCCTCATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATCAAGCTCGCCTGTTCTGACACCCTCATCAACAACATCCTCATATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGCAAGTAGTGTATTTGGTGCAATTCCTCTCTCTGGAATAATTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGCAAGTAGTGTATTTGGTGCAATTCCTCTCTCTGGAATAATTTTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATTCTCAAATAGTCACCTCTGTTCTGAGAATGCCATCAGCAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATTCTCAAATAGTCACCTCTGTTCTGAGAATGCCATCAGCAAGAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGTATAAAGCGTTTTCCACCTGTGGCTGTCACCTCTCTGTTTTTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGTATAAAGCGTTTTCCACCTGTGGCTGTCACCTCTCTGTTTTTTCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACAGCTTTTGGGGTGTACATTAGTTCTGCTGTTGCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACAGCTTTTGGGGTGTACATTAGTTCTGCTGTTGCTGAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCCCGAATTACTGCTGTGGCTTCAGTGATGTACACTGTGGTCCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCCCGAATTACTGCTGTGGCTTCAGTGATGTACACTGTGGTCCCTCAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGATGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGAAATAAGGAGATGAAGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGATGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGAAATAAGGAGATGAAGAAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 TTGAGGAAACTTATTGGTAGGCTGTTTCCTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGAGGAAACTTATTGGTAGGCTGTTTCCTTTT