seq1 = pF1KE5924.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5924/gi568815593r_180639126.tfa (gi568815593r:180639126_180840058), 200933 bp

>pF1KE5924 933
>gi568815593r:180639126_180840058 (Chr5)

(complement)

1-933  (100001-100933)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAGTTTCAACACCAGTTTTGAAGATGGCTTCATTTTGGTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAGTTTCAACACCAGTTTTGAAGATGGCTTCATTTTGGTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGATTGGCCGCAACTGGAGCCCATCCTGTTTGTCTTTATTTTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGATTGGCCGCAACTGGAGCCCATCCTGTTTGTCTTTATTTTTATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACTCCCTAACTCTCTTTGGCAACACCATCATCATCGCTCTCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACTCCCTAACTCTCTTTGGCAACACCATCATCATCGCTCTCTCCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGACCTTCGGCTGCACACACCTATGTACTTCTTTCTCTCTCATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGACCTTCGGCTGCACACACCTATGTACTTCTTTCTCTCTCATCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCTGGACCTCTGCTTCACCACCAGCACCGTGCCCCAGCTCCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCCTGGACCTCTGCTTCACCACCAGCACCGTGCCCCAGCTCCTGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTTTGCGGGGTGGACCGCACCATCACCCGTGGAGGGTGTGTGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTTTGCGGGGTGGACCGCACCATCACCCGTGGAGGGTGTGTGGCTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTCATCTACCTAGCCCTGGGCTCCACAGAGTGTGTGCTCCTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTTCATCTACCTAGCCCTGGGCTCCACAGAGTGTGTGCTCCTGGTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTGTCTGTCGTCCACTCCACTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTGTCTGTCGTCCACTCCACTACATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCATGCACCCCCATCTCTGCCAGACCCTGGCTATCGCCTCCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCATGCACCCCCATCTCTGCCAGACCCTGGCTATCGCCTCCTGGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCGGGTTTCGTGAACTCTCTGATCCAGACAGGTCTCGCAATGGCCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCGGGTTTCGTGAACTCTCTGATCCAGACAGGTCTCGCAATGGCCATGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTCTGTGGCCATCGACTGAATCACTTCTTCTGTGAGATGCCTGTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTCTGTGGCCATCGACTGAATCACTTCTTCTGTGAGATGCCTGTATTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAGTTGGCTTGTGCGGACACAGAAGGAACAGAGGCCAAGATGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100551 TGAAGTTGGCTTGTGCGGACACAGAAGGAACAGAGGCCAAGATGTTTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCCGAGTCATAGTCGTGGCTGTTCCTGCAGCACTTATTCTAGGCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCCGAGTCATAGTCGTGGCTGTTCCTGCAGCACTTATTCTAGGCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGCACATTGCTCATGCAGTGCTGAGGGTGAAGTCAACGGCTGGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGCACATTGCTCATGCAGTGCTGAGGGTGAAGTCAACGGCTGGGCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAAGGCTTTTGGGACTTGTGGGTCCCACCTCCTAGTAGTTTTCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAAGGCTTTTGGGACTTGTGGGTCCCACCTCCTAGTAGTTTTCCTTTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGCTCAGCCATCTACACATATCTCCAATCCATCCACAATTATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGCTCAGCCATCTACACATATCTCCAATCCATCCACAATTATTCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGTGAGGGAAAATTTGTTGCCCTTTTTTATACTATAATTACCCCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCGTGAGGGAAAATTTGTTGCCCTTTTTTATACTATAATTACCCCCATTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAATCCTCTCATTTATACACTAAGAAACAAGGACGTGAAGGGGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAATCCTCTCATTTATACACTAAGAAACAAGGACGTGAAGGGGGCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 TGGAAAGTACTATGGAGGGGCAGGGACTCAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGGAAAGTACTATGGAGGGGCAGGGACTCAGGG