seq1 = pF1KE5922.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5922/gi568815584f_19835667.tfa (gi568815584f:19835667_20036599), 200933 bp

>pF1KE5922 933
>gi568815584f:19835667_20036599 (Chr14)

1-933  (100001-100933)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCACACAAATGAATCGATGGTGTCTGAGTTTGTACTTTTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCACACAAATGAATCGATGGTGTCTGAGTTTGTACTTTTGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTAATTCCTGGGGACTTCAACTTTTCTTTTTTGCCATCTTCTCTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTAATTCCTGGGGACTTCAACTTTTCTTTTTTGCCATCTTCTCTATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTGACATCAGTGCTAGGCAATGTCTTAATTATTGTCATTATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTGACATCAGTGCTAGGCAATGTCTTAATTATTGTCATTATTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGACTCCCATTTGAACTCTCCTATGTACTTCTTGCTCAGTAATCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGACTCCCATTTGAACTCTCCTATGTACTTCTTGCTCAGTAATCTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCATTGATATCTGTCAGTCTAACTTTGCCACCCCCAAGATGCTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCATTGATATCTGTCAGTCTAACTTTGCCACCCCCAAGATGCTTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTTTTTATTGAGCACAAGACTATCTCCTTTGAGGGTTGCATGGCCCAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTTTTTATTGAGCGCAAGACTATCTCCTTTGAGGGTTGCATGGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATATTCGTTCTTCACAGTTTTGTTGGGAGTGAGATGATGTTGCTTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATATTCGTTCTTCACAGTTTTGTTGGGAGTGAGATGATGTTGCTTGTAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATGGCATATGACAGATTTATAGCCATATGTAAGCCTCTGCACTACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATGGCATATGACAGATTTATAGCCATATGTAAGCCTCTGCACTACAGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAATTATGAACCGGAGGCTCTGTGTAATTTTTGTGTCTATTTCCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATTATGAACCGGAGGCTCTGTGTAATTTTTGTGTCTATTTCCTGGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGGCGTTCTTCATTCTGTGAGCCACTTGGCTTTTACAGTGGACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGGCGTTCTTCATTCTGTGAGCCACTTGGCTTTTACAGTGGACCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTCTGTGGTCCCAATGAGGTGGATAGCTTCTTTTGTGACCTTCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTCTGTGGTCCCAATGAGGTGGATAGCTTCTTTTGTGACCTTCCCTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATAGAGCTGGCTTGCATGGATACATATGAAATGGAAATTATGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATAGAGCTGGCTTGCATGGATACATATGAAATGGAAATTATGACCCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACGAACAGTGGCCTGATATCATTGAGCTGTTTCCTGGCTTTAATTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACGAACAGTGGCCTGATATCATTGAGCTGTTTCCTGGCTTTAATTATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACACCATCATTTTGATCGGTGTCCGATGCAGGTCCTCCAGTGGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACACCATCATTTTGATCGGTGTCCGATGCAGGTCCTCCAGTGGGTCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTAAGGCTCTTTCTACATTAACTGCCCACATCACAGTGGTCATTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTAAGGCTCTTTCTACATTAACTGCCCACATCACAGTGGTCATTCTTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCGGGCCTTGCATTTATTTCTATATATGGCCTTTTAGAAGACTTCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100751 TTCGGGCCTTGCATTTATTTCTATATATGGCCTTTTAGCAGACTTCCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAAATTTCTTTCTGTGTTCTACACTGTTTGTACTCCCTTGTTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACAAATTTCTTTCTGTGTTCTACACTGTTTGTACTCCCTTGTTGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATCATCTACTCTCTGAGGAATGAAGATGTTAAAGCAGCCATGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATCATCTACTCTCTGAGGAATGAAGATGTTAAAGCAGCCATGTGGAAG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTGAGAAACTGTCATGTGAACTCCTGGAAAAAC
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAGAAACCGTCATGTGAACTCCTGGAAAAAC