seq1 = pF1KE5920.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5920/gi568815587f_55993308.tfa (gi568815587f:55993308_56194237), 200930 bp

>pF1KE5920 930
>gi568815587f:55993308_56194237 (Chr11)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGCAACAATTTCACTGAGGTTACCGTCTTCATCCTCTCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGCAACAATTTCACTGAGGTTACCGTCTTCATCCTCTCTGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAAATCACCCTGAATTACAAGTCAGTCTTTTCTTGATGTTTCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAAATCACCCTGAATTACAAGTCAGTCTTTTCTTGATGTTTCTCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATCTATTCACTGTTTTGGGAAACCTGGGACTGATCACGTTAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATCTATTCACTGTTTTGGGAAACCTGGGACTGATCACGTTAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGATTCTCAGCTTCACACCCCTATGTACTTTTTCCTGAGCAATTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGATTCTCAGCTTCACACCCCTATGTACTTTTTCCTGAGCAATTTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTTATTGACATATTTTACTCCTCTACTGTAACACCTAAGGCATTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTTATTGACATATTTTACTCCTCTACTGTAACACCTAAGGCATTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTCCAATCCAATCGGAGATCCATCTCCTTTGTTGGCTGCTTTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTCCAATCCAATCGGAGATCCATCTCCTTTGTTGGCTGCTTTGTTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTACTTTTTTGTTGGATTGGTGTGTTGTGAGTGTTTCCTTCTGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTACTTTTTTGTTGGATTGGTGTGTTGTGAGTGTTTCCTTCTGGGATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCCTACAATCGCTACATAGCAATCTGCAATCCCTTACTGTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCCTACAATCGCTACATAGCAATCTGCAATCCCTTACTGTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGTCATGTCCCAAAAAGTGTCCAACTGGCTGGGAGTAATGCCATATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGTCATGTCCCAAAAAGTGTCCAACTGGCTGGGAGTAATGCCATATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATAGGCTTCACAAGCTCGCTGATATCTGTCTGGGTGATAAGCAGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATAGGCTTCACAAGCTCGCTGATATCTGTCTGGGTGATAAGCAGTTTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTCTGTGATTCCAGCATCAATCATTTTTTTTGTGACACCACAGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTCTGTGATTCCAGCATCAATCATTTTTTTTGTGACACCACAGCTCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAGCACTCTCCTGTGTAGATACATTCGGCACAGAAATGGTGAGCTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAGCACTCTCCTGTGTAGATACATTCGGCACAGAAATGGTGAGCTTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTAGCTGGATTCACTCTTCTTAGCTCTCTCCTTATCATCACAGTCACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTAGCTGGATTCACTCTTCTTAGCTCTCTCCTTATCATCACAGTCACTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATCATCATCATCTCAGCCATCCTGAGGATCCAGTCAGCAGCAGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATCATCATCATCTCAGCCATCCTGAGGATCCAGTCAGCAGCAGGCAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAAGGCCTTCTCCACCTGCGCATCCCACCTCATGGCTGTAACTATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGAAGGCCTTCTCCACCTGCGCATCCCACCTCATGGCTGTAACTATCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGGTCTCTGATTTTCACCTATTTGCAACCTGATAACACATCATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGGTCTCTGATTTTCACCTATTTGCAACCTGATAACACATCATCGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACCCAGGCGCAGGTGGCATCTGTATTCTATACGATTGTCATTCCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACCCAGGCGCAGGTGGCATCTGTATTCTATACGATTGTCATTCCCATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATCCACTCATCTACAGTCTGAGGAACAAAGATGTGAAAAATGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATCCACTCATCTACAGTCTGAGGAACAAAGATGTGAAAAATGCTCTT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTGAGAGTCATACATAGAAAACTTTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAGAGTCATACATAGAAAACTTTTTCCA