seq1 = pF1KE5918.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5918/gi568815595f_98049386.tfa (gi568815595f:98049386_98250315), 200930 bp

>pF1KE5918 930
>gi568815595f:98049386_98250315 (Chr3)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAGGAAAATGCAACATTGCTGACAGAGTTTGTTCTCACAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAGGAAAATGCAACATTGCTGACAGAGTTTGTTCTCACAGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTATATCAACCACAGTGGAAAATACCCCTGTTCCTGGCATTCTTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTATATCAACCACAGTGGAAAATACCCCTGTTCCTGGCATTCTTGGTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATATCTCATCACCATCATGGGGAATCTTGGTCTGATTGCTGTCATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATATCTCATCACCATCATGGGGAATCTTGGTCTGATTGCTGTCATCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGACCCTCATCTTCATATCCCAATGTACTTACTCCTTGGGAATTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAGACCCTCATCTTCATATCCCAATGTACTTACTCCTTGGGAATTTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTGTGGATGCTTTGTTATCATCCTCAGTGACTCTGAAGATGCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTGTGGATGCTTTGTTATCATCCTCAGTGACTCTGAAGATGCTGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTCTTAGCTAAGAGTAAGATGATATCTCTCTCTGAATGCAAGATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCTTAGCTAAGAGTAAGATGATATCTCTCTCTGAATGCAAGATACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGTTTTCGTTTGCAATCAGTGTAACCACGGAATGTTTTCTCTTGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGTTTTCGTTTGCAATCAGTGTAACCACGGAATGTTTTCTCTTGGCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATATGATCGCTATGTAGCCATATGCAAACCCTTACTTTATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATATGATCGCTATGTAGCCATATGCAAACCCTTACTTTATCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATTATGACCAATGGACTGTGCATCCGGCTATTAATCTTGTCATATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATTATGACCAATGGACTGTGCATCCGGCTATTAATCTTGTCATATGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTGGTCTTCTTCATGCTTTAATCCATGAAGGATTTTTATTCAGACTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTGGTCTTCTTCATGCTTTAATCCATGAAGGATTTTTATTCAGACTAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTAACTCCAACATAATACAACACTTTTACTGTGACATTATCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTAACTCCAACATAATACAACACTTTTACTGTGACATTATCCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTAAAGATTTCTTATACTGATTCCTCTATTAACTTTCTAATGGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTAAAGATTTCTTATACTGATTCCTCTATTAACTTTCTAATGGTTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTTTTGCAGGTTCAATTCAAGTTTTTACCATAGGGACTGTTCTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTTTTGCAGGTTCAATTCAAGTTTTTACCATAGGGACTGTTCTTATATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACATATTTGTCCTCTATACAATCTTGAAAAAGAAGTCTGTCAAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACATATTTGTCCTCTATACAATCTTGAAAAAGAAGTCTGTCAAAGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGAAAAGCCTTCTCCACCTGTGGAGCTCATCTCTTATCTGTATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGAAAAGCCTTCTCCACCTGTGGAGCTCATCTCTTATCTGTATCTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACTATGGGCCCCTCGCCTTCATGTATATGGGCTCTGCATCCCCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACTATGGGCCCCTCGCCTTCATGTATATGGGCTCTGCATCCCCACAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATGACCAAGATATGATGGAGTCTCTATTTTACACTGTCATAGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATGACCAAGATATGATGGAGTCTCTATTTTACACTGTCATAGTTCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TATTAAATCCCATGATCTACAGCCTGAGAAACAAGCAAGTAATAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TATTAAATCCCATGATCTACAGCCTGAGAAACAAGCAAGTAATAGCTTCA

    900     .    :    .    :    .    :
    901 TTCACAAAAATGTTCAAAAGAAATGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCACAAAAATGTTCAAAAGAAATGATGTT