seq1 = pF1KE5916.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5916/gi568815591f_143995108.tfa (gi568815591f:143995108_144196037), 200930 bp

>pF1KE5916 930
>gi568815591f:143995108_144196037 (Chr7)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGCAATCAGACCTGGATCACAGAAGTCATCCTGTTGGGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGCAATCAGACCTGGATCACAGAAGTCATCCTGTTGGGATTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGACCCAGCTCTGGAGTTGTTCCTCTTTGGGTTTTTCTTGCTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGACCCAGCTCTGGAGTTGTTCCTCTTTGGGTTTTTCTTGCTATTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCTTAACCCTGATGGGAAATGGGATTATCCTGGGGCTCATCTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCTTAACCCTGATGGGAAATGGGATTATCCTGGGGCTCATCTACTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTCTAGACTGCACACACCCATGTATGTCTTCCTGTCACACCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTCTAGACTGCACACACCCATGTATGTCTTCCTGTCACACCTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGGACATGTCCTATGCCTCGAGTACTGTCCCTAAGATGCTAGCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGGACATGTCCTATGCCTCGAGTACTGTCCCTAAGATGCTAGCAAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGATGCACAAAAAAGTCATCTCCTTTGCTCCTTGCATACTTCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTGATGCACAAAAAAGTCATCTCCTTTGCTCCTTGCATACTTCAGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTGTATTTGGCGTTTGCTATTACAGAGTGTCTGATTTTGGTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTTGTATTTGGCGTTTGCTATTACAGAGTGTCTGATTTTGGTGATGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCTATGATCGGTATGTGGCAATCTGTCACCCCTTGCAATACACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCTATGATCGGTATGTGGCAATCTGTCACCCCTTGCAATACACCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTATGAACTGGAGAGTGTGCACTGTCCTGGCCTCAACTTGCTGGATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTATGAACTGGAGAGTGTGCACTGTCCTGGCCTCAACTTGCTGGATATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCTTTCTCTTGGCTCTGGTCCATATTACTCTTATTCTGAGGCTGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCTTTCTCTTGGCTCTGGTCCATATTACTCTTATTCTGAGGCTGCCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTGTGGCCCACAAAAGATCAACCACTTTTTCTGTCAAATCATGTCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTGTGGCCCACAAAAGATCAACCACTTTTTCTGTCAAATCATGTCCGTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAATTGGCCTGTGCTGACACTAGGCTCAACCAGGTGGTCCTATTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAATTGGCCTGTGCTGACACTAGGCTCAACCAGGTGGTCCTATTTGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTTCTGCGTTCATCTTAGTGGGGCCGCTCTGCCTGGTGCTGGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTTCTGCGTTCATCTTAGTGGGGCCGCTCTGCCTGGTGCTGGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTGCACATCCTGGTGGCCATCTTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTGCACATCCTGGTGGCCATCTTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAAGGCCTTCTCTACCTGCTCCTCCCACCTCTGCGTGGTGGGGCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAAGGCCTTCTCTACCTGCTCCTCCCACCTCTGCGTGGTGGGGCTTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGCAGCGCCATTGTCATGTACATGGCCCCCAAGTCAAGCCATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCAGCGCCATTGTCATGTACATGGCCCCCAAGTCAAGCCATTCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAACGGAGGAAGATCCTTTCCCTGTTTTACAGCCTTTTCAACCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAACGGAGGAAGATCCTTTCCCTGTTTTACAGCCTTTTCAACCCGATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAACCCCCTCATCTACAGCCTTAGGAATGCAGAGGTGAAAGGGGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAACCCCCTCATCTACAGCCTTAGGAATGCAGAGGTGAAAGGGGCTCTA

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AAGAGAGTCCTTTGGAAACAGAGATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGAGAGTCCTTTGGAAACAGAGATCAATG