seq1 = pF1KE5915.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5915/gi568815591f_144029113.tfa (gi568815591f:144029113_144230042), 200930 bp

>pF1KE5915 927
>gi568815591f:144029113_144230042 (Chr7)

1-927  (100001-100930)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGCAACAAGACATGGATCACAGACATCACCTTGCCGCGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGCAACAAGACATGGATCACAGACATCACCTTGCCGCGATTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTGGTCCAGCACTGGAGATTCTCCTCTGTGGACTTTTCTCTGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTGGTCCAGCACTGGAGATTCTCCTCTGTGGACTTTTCTCTGCCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATACACTCACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATACACTCACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTGTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTGTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTTGACATATCCTATGCTTCCAACTATGTCCCCAAGATGCTGACGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTTGACATATCCTATGCTTCCAACTATGTCCCCAAGATGCTGACGAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTATGAACCAGGAAAGCACCATCTCCTTTTTTCCATGCATAATGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTATGAACCAGGAAAGCACCATCTCCTTTTTTCCATGCATAATGCAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTGTATTTGGCTTTTGCTCACGTAGAGTGTCTGATTTTGGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTGTATTTGGCTTTTGCTCACGTAGAGTGTCTGATTTTGGTGGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCTATGATCGCTATGCGGACATCTGCCACCCCTTACGTTACAATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100351 GTCCTATGATCGCTATGCGGACATCTGCCACCCCTTACGTTACAATAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGAGCTGGAGAGTGTGCACTGTCCTGGCTGTGGCTTCCTGGGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATGAGCTGGAGAGTGTGCACTGTCCTGGCTGTGGCTTCCTGGGTGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCTTCCTCCTGGCTCTGGTCCCTTTAGTTCTCATCCTGAGGCTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100451 AGCTTCCTCCTGGCTCTGGTCCCTTTAGTTCTCATCCTGAGCCTGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCGGGCCTCATGAAATCAACCACTTCT   GTGAAATCCTGTCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||
 100501 CTGCGGGCCTCATGAAATCAACCACTTCTTCTGTGAAATCCTGTCTGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    548 TCAAGTTGGCCTGTGCTGACACCTGGCTCAACCAGGTGGTCATCTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGTTGGCCTGTGCTGACACCTGGCTCAACCAGGTGGTCATCTTTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598 GCCTGCGTGTTCATCCTGGTGGGGCCACTCTGCCTGGTGCTGGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCTGCGTGTTCATCCTGGTGGGGCCACTCTGCCTGGTGCTGGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    648 CTTGCGCATCCTGGCCGCCATCTTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTGCGCATCCTGGCCGCCATCTTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    698 GAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTTTGCGTGGTGGGACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTTTGCGTGGTGGGACTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748 TTTGGCAGCGCCATTGTCACGTACATGGCCCCCAAGTCCCGCCATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCAGCGCCATTGTCACGTACATGGCCCCCAAGTCCCGCCATCCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    798 GGAGCAGCAGAAAGTTCTTTCCCTGTTTTACAGCCTTTTCAATCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGCAGCAGAAAGTTCTTTCCCTGTTTTACAGCCTTTTCAATCCAATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    848 TGAACCCCCTGATATATAGCCTAAGGAATGCAGAGGTCAAGGGCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAACCCCCTGATATATAGCCTAAGGAATGCAGAGGTCAAGGGCGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :
    898 AGGAGGGCACTGAGGAAGGAGAGGCTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGGAGGGCACTGAGGAAGGAGAGGCTGACG