seq1 = pF1KE5913.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5913/gi568815591f_144218125.tfa (gi568815591f:144218125_144419054), 200930 bp

>pF1KE5913 930
>gi568815591f:144218125_144419054 (Chr7)

1-930  (100001-100930)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAAAATCAGACAATGGTCACAGAGTTCCTCCTACTGGGATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAAAATCAGACAATGGTCACAGAGTTCCTCCTACTGGGATTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGCCCAAGGATTCAGATGCTCCTCTTTGGGCTCTTCTCCCTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGCCCAAGGATTCAGATGCTCCTCTTTGGGCTCTTCTCCCTGTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATCTTCACCCTGCTGGGGAACGGGGCCATCCTGGGGCTCATCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATATCTTCACCCTGCTGGGGAACGGGGCCATCCTGGGGCTCATCTCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTCCAGACTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTCCAGACTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCGACATCGCCTACGCCTGCAACACGGTGCCCCAGATGCTGGCGAACC
        |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCGACATCGCCTACACCCGCAACACGGTGCCCCAGATGCTGGCGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTGCATCCAGCCAAGCCCATCTCCTTTGCTGGCTGCATGACGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTGCATCCAGCCAAGCCCATCTCCTTTGCTGGCTGCATGACGCAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTCTCTGTTTGAGTTTTGGACACAGCGAATGTCTCCTGCTGGTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTCTCTGTTTGAGTTTTGGACACAGCGAATGTCTCCTGCTGGTGCTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCTACGATCGTTACGTGGCCATCTGCCACCCTCTCCGATACTCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCCTACGATCGTTACGTGGCCATCTGCCACCCTCTCCGATACTCCGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGACCTGGAGAGTCTGCATCACCCTGGCCGTCACTTCTTGGACGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100401 TCATGACCTGGAGAGTCTGCATCACCCTGGCCGTCACTTCCTGGACGTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTCCCTCCTGGCTCTGGTCCATGTGGTTCTCATCCTAAGACTGCCCTT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTCCCTCCTGGCTCTGGCCCATGTGGTTCTCATCCTAAGACTGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGGGCCTCATGAAATCAACCACTTCTTCTGTGAAATCCTGTCTGTCC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCTGGGCCTCATGAAATCAACCACTTCTTCTGTGAAATCCTGTCTGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAGGCTGGCCTGTGCTGACACCTGGCTCAACCAGGTGGTCATCTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAGGCTGGCCTGTGCTGACACCTGGCTCAACCAGGTGGTCATCTTTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCTGCGTGTTCTTCCTGGTGGGGCCACCCAGCCTGGTGCTTGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCTGCGTGTTCTTCCTGGTGGGGCCACCCAGCCTGGTGCTTGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCGCACATCCTGGCGGCCATCCTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCGCACATCCTGGCGGCCATCCTGAGGATCCAGTCTGGGGAGGGCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTCTGCGTGGTGGGACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTCTGCGTGGTGGGACTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGCAGTGCCATCATCATGTACATGGCCCCCAAGTCCCGCCATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCAGTGCCATCATCATGTACATGGCCCCCAAGTCCCGCCATCCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGCAGCAAAAGGTCTTTTTTCTATTTTACAGTTTTTTCAACCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGCAGCAAAAGGTCTTTTTTCTATTTTACAGTTTTTTCAACCCAACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTAACCCCCTGATTTACAGCCTGAGGAACGGAGAGGTCAAGGGTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTAACCCCCTGATTTACAGCCTGAGGAACGGAGAGGTCAAGGGTGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AGGAGAGCACTGGGCAAGGAAAGTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGGAGAGCACTGGGCAAGGAAAGTCATTCC