seq1 = pF1KE5912.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5912/gi568815587r_5201017.tfa (gi568815587r:5201017_5401946), 200930 bp

>pF1KE5912 930
>gi568815587r:5201017_5401946 (Chr11)

(complement)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGTATAACAACAGTGCTGGCCCCTTCTTGCTGACTGGCTTCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGTATAACAACAGTGCTGGCCCCTTCTTGCTGACTGGCTTCTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGAGGCAGTTCACTACCGGATCTCTATGTCCTTCTTTGTCATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGAGGCAGTTCACTACCGGATCTCTATGTCCTTCTTTGTCATCTACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCGTCCTTTTTGGAAATGGCACTCTTCTTGTCCTCATTTGGAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCGTCCTTTTTGGAAATGGCACTCTTCTTGTCCTCATTTGGAATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACAGCCTCCATGAGCCCATGTACTACTTCCTGGCTATGCTGGCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACAGCCTCCATGAGCCCATGTACTACTTCCTGGCTATGCTGGCAGACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACCTTGGGATGACATTCACTACAATGCCCACAGTCCTGGGTGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACCTTGGGATGACATTCACTACAATGCCCACAGTCCTGGGTGTCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTAGACCAGAGGGAGATTGCCCATGCTGCCTGTTTCACCCAATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTAGACCAGAGGGAGATTGCCCATGCTGCCTGTTTCACCCAATCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTCATTCACTGGCCATTGTAGAATCAGGTATCTTGCTTGTTTTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTCATTCACTGGCCATTGTAGAATCAGGTATCTTGCTTGTTTTGGCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACTGTTTCATTGCCATCCGCACACCACTGAGGTACAACTGCATTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACTGTTTCATTGCCATCCGCACACCACTGAGGTACAACTGCATTCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAATTCCCGAGTGATGAACATAGGACTGGGGGTACTGATGAGAGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAATTCCCGAGTGATGAACATAGGACTGGGGGTACTGATGAGAGGTTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGTCCATTTTGCCCATAATTCTTTCACTCTACTGCTACCCATATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGTCCATTTTGCCCATAATTCTTTCACTCTACTGCTACCCATATTGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCCCGTGCCCTCTTGCACACATTTTGCCTCCATCAAGATGTCATAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCCCGTGCCCTCTTGCACACATTTTGCCTCCATCAAGATGTCATAAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGCCTGTGCTGATATCACGTTTAATCACATATATCCAATTATTCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCGCCTGTGCTGATATCACGTTTAATCACATATATCCAATTATTCAGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTTTGACTGTCTTTTTAGATGCTCTAATCATCATCTTTTCTTATATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTTTGACTGTCTTTTTAGATGCTCTAATCATCATCTTTTCTTATATACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AATCCTCAAGACAGTGATGGGCATTGCGTCTGGACAAGAGGAAGCTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AATCCTCAAGACAGTGATGGGCATTGCGTCTGGACAAGAGGAAGCTAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCTCAACACTTGTGTCTCCCATATTAGCTGTGTCCTAGTATTTCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCTCAACACTTGTGTCTCCCATATTAGCTGTGTCCTAGTATTTCACATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACTGTGATGGGACTGTCATTCATTCACAGGTTTGGGAAACATGCACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACTGTGATGGGACTGTCATTCATTCACAGGTTTGGGAAACATGCACCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGGTCCCCATTACCATGAGCTATGTCCATTTTCTCTTTCCTCCATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGGTCCCCATTACCATGAGCTATGTCCATTTTCTCTTTCCTCCATTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATCCTATCATTTATAGCATCAAGACCAAGCAGATTCAAAGAAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATCCTATCATTTATAGCATCAAGACCAAGCAGATTCAAAGAAGCATT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 ATTCGCCTATTTTCTGGGCAGAGTAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTCGCCTATTTTCTGGGCAGAGTAGGGCT