seq1 = pF1KE5910.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5910/gi568815587r_55813680.tfa (gi568815587r:55813680_56014582), 200903 bp

>pF1KE5910 930
>gi568815587r:55813680_56014582 (Chr11)

(complement)

1-930  (100001-100930)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTGGGAAAATTGCTCCTCATTAACTGATTTTTTTCTCTTGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTGGGAAAATTGCTCCTCATTAACTGATTTTTTTCTCTTGGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCAATAACCCAGAGATGAAAGTGACCCTATTTGCTGTATTCTTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCAATAACCCAGAGATGAAAGTGACCCTATTTGCTGTATTCTTGGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATATCATTAATTTCTCAGCAAATCTTGGAATGATAGTTTTAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATATCATTAATTTCTCAGCAAATCTTGGAATGATAGTTTTAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGATTACCAACTTCACACACCAATGTATTTCTTCCTCAGTCATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGATTACCAACTTCACACACCAATGTATTTCTTCCTCAGTCATCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCTGTGATCTCTGCTATTCTACTGCAACTGGGCCCAAGATGCTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCTGTGATCTCTGCTATTCTACTGCAACTGGGCCCAAGATGCTGGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTACTTGCCAAGAACAAGTCAATACCCTTCTATGGCTGTGCTCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTACTTGCCAAGAACAAGTCAATACCCTTCTATGGCTGTGCTCTGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTGGTCTTCTGTATCTTTGCAGATTCTGAGTGTCTACTGCTGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTGGTCTTCTGTATCTTTGCAGATTCTGAGTGTCTACTGCTGTCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTTTGATCGGTACAAGGCCATCATCAACCCCCTGCTCTATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTTTGATCGGTACAAGGCCATCATCAACCCCCTGCTCTATACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAACATGTCTAGCAGAGTGTGCTATCTACTCTTGACTGGGGTTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAACATGTCTAGCAGAGTGTGCTATCTACTCTTGACTGGGGTTTATCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGGAATAGCAGATGCTTTGATACATATGACACTGGCCTTCCGCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGGAATAGCAGATGCTTTGATACATATGACACTGGCCTTCCGCCTATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGGTCTAATGAGATTAATCATTTCTTCTGTGATATCCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGGTCTAATGAGATTAATCATTTCTTCTGTGATATCCCTCCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTTATTACTCTCTTGCTCAGATACACAGGTCAATGAGTTAGTGTTATTC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTTATTACTCTCTCGCTCAGATACACAGGTCAATGAGTTAGTGTTATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCGTCTTTGGTTTTATTGAACTGAGTACCATTTCAGGAGTTTTCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCGTCTTTGGTTTTATTGAACTGAGTACCATTTCAGGAGTTTTCATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATTGTTATATCATCCTATCAGTCTTGGAGATACACTCTGCTGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATTGTTATATCATCCTATCAGTCTTGGAGATACACTCTGCTGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTTCAAAGCTCTCTCTACATGCACTTCCCACTTATCTGCGGTTGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTTCAAAGCTCTCTCTACATGCACTTCCCACTTATCTGCGGTTGCAATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCCAGGGAACTCTGCTCTTTATGTATTTCCGGCCAAGTTCTTCCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCCAGGGAACTCTGCTCTTTATGTATTTCCGGCCAAGTTCTTCCTATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTAGATCAAGATAAAATGACCTCATTGTTTTACACCCTTGTGGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTAGATCAAGATAAAATGACCTCATTGTTTTACACCCTTGTGGTTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTGAACCCCCTGATTTATAGCCTGAGGAACAAGGATGTGAAAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTGAACCCCCTGATTTATAGCCTGAGGAACAAGGATGTGAAAGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTGAAAAAACTGAAAAATAAAATTTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAAAAAACTGAAAAATAAAATTTTATTT