seq1 = pF1KE5907.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5907/gi568815587r_124442725.tfa (gi568815587r:124442725_124643654), 200930 bp

>pF1KE5907 930
>gi568815587r:124442725_124643654 (Chr11)

(complement)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCAAAAACTCTTCTGTGACAGAGTTTATCCTCGAAGGCTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCAAAAACTCTTCTGTGACAGAGTTTATCCTCGAAGGCTTAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCAGCCGGGACTGCGGATCCCCCTCTTCTTCCTGTTTCTGGGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACCAGCCGGGACTGCGGATCCCCCTCTTCTTCCTGTTTCTGGGTTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACACGGTCACCGTGGTGGGGAACCTGGGCTTGATAACCCTGATTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACACGGTCACCGTGGTGGGGAACCTGGGCTTGATAACCCTGATTGGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTCTCACCTGCACACTCCCATGTACTTCTTCCTTTTTAACCTCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACTCTCACCTGCACACTCCCATGTACTTCTTCCTTTTTAACCTCTCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATAGATTTCTGTTTCTCCACTACCATCACTCCCAAAATGCTGATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATAGATTTCTGTTTCTCCACTACCATCACTCCCAAAATGCTGATGAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTCTCAAGGAAGAACATCATTTCCTTCACAGGGTGTATGACTCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTCTCAAGGAAGAACATCATTTCCTTCACAGGGTGTATGACTCAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCTTCTGCTTCTTTGTCGTCTCTGAGTCCTTCATCCTGTCAGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCTTCTGCTTCTTTGTCGTCTCTGAGTCCTTCATCCTGTCAGCGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGTATGACCGCTACGTGGCCATCTGTAACCCACTGTTGTACACAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGTATGACCGCTACGTGGCCATCTGTAACCCACTGTTGTACACAGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATGTCTTGCCAGGTGTGTTTGCTCCTTTTGTTGGGTGCCTATGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATGTCTTGCCAGGTGTGTTTGCTCCTTTTGTTGGGTGCCTATGGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGTTTGCTGGGGCCATGGCCCACACAGGAAGCATAATGAACCTGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGTTTGCTGGGGCCATGGCCCACACAGGAAGCATAATGAACCTGACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGCTGACAACCTTGTCAATCATTTCATGTGTGACATCCTTCCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTGCTGACAACCTTGTCAATCATTTCATGTGTGACATCCTTCCTCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGAGCTCTCCTGCAACAGCTCTTACATGAATGAGCTGGTGGTCTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGAGCTCTCCTGCAACAGCTCTTACATGAATGAGCTGGTGGTCTTTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGTGGCTGTTGACGTTGGAATGCCCATTGTCACTGTCTTTATTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGTGGCTGTTGACGTTGGAATGCCCATTGTCACTGTCTTTATTTCTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCCTCATCCTCTCCAGCATTCTACACAACAGTTCTACAGAAGGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCCTCATCCTCTCCAGCATTCTACACAACAGTTCTACAGAAGGCAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAAAGCCTTTAGTACTTGCAGTTCCCACATAATTGTAGTTTCTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAAAGCCTTTAGTACTTGCAGTTCCCACATAATTGTAGTTTCTCTTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGTTCTGGTGCTTTCATGTATCTCAAACCCCTTTCCATCCTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGTTCTGGTGCTTTCATGTATCTCAAACCCCTTTCCATCCTGCCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGAGCAAGGGAAAGTGTCCTCCCTGTTCTATACCATAATAGTCCCCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGAGCAAGGGAAAGTGTCCTCCCTGTTCTATACCATAATAGTCCCCGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAACCCATTAATCTATAGCTTGAGGAACAAGGATGTCAAAGTTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAACCCATTAATCTATAGCTTGAGGAACAAGGATGTCAAAGTTGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AGGAGAACTTTGGGCAGAAAAATCTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGGAGAACTTTGGGCAGAAAAATCTTTTCT