seq1 = pF1KE5906.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5906/gi568815584r_19914264.tfa (gi568815584r:19914264_20115193), 200930 bp

>pF1KE5906 930
>gi568815584r:19914264_20115193 (Chr14)

(complement)

1-930  (100001-100930)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCACAGAACTATTCCTTGGTGTCAGAATTTGTGTTGCATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCACAGAACTATTCCTTGGTGTCAGAATTTGTGTTGCATGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCACTTCACGACATCTTCAAAATTTTTTCTTTATATTTTTCTTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCACTTCACGACATCTTCAAAATTTTTTCTTTATATTTTTCTTTGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTGGCCATTATGCTGGGTAACCTTCTCATTTTGGTCACTGTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTGGCCATTATGCTGGGTAACCTTCTCATTTTGGTCACTGTAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGATCCCTGCCTGCACTCCTCCCCTATGTACTTCCTGCTGGGGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGATCCCTGCCTGCACTCCTCCCCTATGTACTTCCTGCTGGGGAACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTTTCCTGGACATGTGGCTGGCCTCATTTGCCACTCCCAAGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCTTTCCTGGACATGTGGCTGGCCTCATTTGCCACTCCCAAGATGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGATTTCCTTAGTGATCAAAAACTCATCTCCTTTGGAGGATGTATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGATTTCCTTAGTGATCAAAAACTCATCTCCTTTGGAGGATGTATGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAATCTTCTTCTTGCACTTTACTGGTGGGGCTGAGATGGTGCTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAATCTTCTTCTTGCACTTTACTGGTGGGGCTGAGATGGTGCTCCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCCATGGCCTATGACAGATATGTGGCCATATGCAAACCCTTGCATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTCCATGGCCTATGACAGATATGTGGCCATATGCAAACCCTTGCATTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACTTTGATGAGTTGGCAGACTTGCATCAGGCGGGTGCTGGCTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100401 TGACTTTGATGAGTTGGCAGACTTGCATCAGGCTGGTGCTGGCTTCATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCGTTGGATTTGTGCACTCCATCAGTCAAGTGGCTTTCACTGTAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCGTTGGATTTGTGCACTCCATCAGTCAAGTGGCTTTCACTGTAAATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCTTACTGTGGCCCCAATGAGGTAGACAGCTTCTTCTGTGACCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCTTACTGTGGCCCCAATGAGGTAGACAGCTTCTTCTGTGACCTCCCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGTGATCAAACTTGCCTGCATGGACACCTATGTCTTGGGTATAATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGTGATCAAACTTGCCTGCATGGACACCTATGTCTTGGGTATAATTATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTCAGACAGTGGGTTGCTTTCCTTGAGCTGTTTTCTGCTCCTCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTCAGACAGTGGGTTGCTTTCCTTGAGCTGTTTTCTGCTCCTCCTGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTACACCGTGATCCTCCTCGCTATCAGACAGCGTGCTGCCGGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTACACCGTGATCCTCCTCGCTATCAGACAGCGTGCTGCCGGTAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATCCAAAGCACTCTCCACTTGCTCTGCACATATCATGGTAGTGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATCCAAAGCACTCTCCACTTGCTCTGCACATATCATGGTAGTGACGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTTGGCCCTTGCATTTTTGTTTATGTGCGGCCTTTCAGTAGGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTTTGGCCCTTGCATTTTTGTTTATGTGCGGCCTTTCAGTAGGTTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGGACAAGCTGCTGTCTGTGTTTTATACCATTTTTACTCCACTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGGACAAGCTGCTGTCTGTGTTTTATACCATTTTTACTCCACTCCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCCATTATCTACACATTGAGAAATGAGGAAATGAAAGCAGCTATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100851 ACCCCATTATCTACACATTGAGAAATGAGGAGATGAAAGCAGCTATGAAG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AAACTGCAAAACCGACGGGTGACTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAACTGCAAAACCGACGGGTGACTTTTCAA