seq1 = pF1KE5904.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5904/gi568815587r_49881575.tfa (gi568815587r:49881575_50082501), 200927 bp

>pF1KE5904 927
>gi568815587r:49881575_50082501 (Chr11)

(complement)

1-927  (100001-100927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGAAAAAGAATGTGACTGAATTCATTTTAATAGGTCTTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGAAAAAGAATGTGACTGAATTCATTTTAATAGGTCTTACACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCCCATAATGGAGAAAGTCACGTTTGTAGTATTTTTGGTTCTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACCCCATAATGGAGAAAGTCACGTTTGTAGTATTTTTGGTTCTTTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATAACACTTTCAGGCAACCTGCTCATTGTGGTTACCATTACCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATAACACTTTCAGGCAACCTGCTCATTGTGGTTACCATTACCACCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGCTCTGAGCTCCCCCATGTACTTCTTCCTGACCCACCTTTCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGCTCTGAGCTCCCCCATGTACTTCTTCCTGACCCACCTTTCTTTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACACAGTTTATTCTTCTTCTTCAGCTCCTAAGTTGATTGTGGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGACACAGTTTATTCTTCTTCTTCAGCTCCTAAGTTGATTGTGGATTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCAAGAGAAGAAAATCATCTCCTTTAATGGGTGTATGGCTCAAGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCAAGAGAAGAAAATCATCTCCTTTAATGGGTGTATGGCTCAAGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGAACACATTTTTGGTGCTACTGAGATCATCCTGCTGACAGTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAGAACACATTTTTGGTGCTACTGAGATCATCCTGCTGACAGTGATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGTGACTGCTATGTGGCCATCTGCAAACCTCTGAACTACACAACCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGTGACTGCTATGTGGCCATCTGCAAACCTCTGAACTACACAACCATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCCACAGCCTGTGCATTCTCCTGGTGGCAGTGGCCTGGGTGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCCACAGCCTGTGCATTCTCCTGGTGGCAGTGGCCTGGGTGGGAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTTCATGCAACTATTCAGATTCTCTTTACAGTATGGCTGCCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTTCATGCAACTATTCAGATTCTCTTTACAGTATGGCTGCCCTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGCCCCAATGTCATAGGCCACTTCATGTGTGACTTGTACCCATTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGCCCCAATGTCATAGGCCACTTCATGTGTGACTTGTACCCATTGTTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACTTGTTTGCATAGACACTCATACCCTTGGTCTCTTTGTTGCTGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACTTGTTTGCATAGACACTCATACCCTTGGTCTCTTTGTTGCTGTGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGTGGGTTTATCTGCTTATTAAACTTCCTTATCTTGGTGGTATCCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGTGGGTTTATCTGCTTATTAAACTTCCTTATCTTGGTGGTATCCTATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATCATCTTGAGATCTTTAAAGAACAATAGCTTGGAGGGGAGGTGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATCATCTTGAGATCTTTAAAGAACAATAGCTTGGAGGGGAGGTGTAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTCTCCACCTGTATTTCTCACATCATAGTAGTTGTCTTATTCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTCTCCACCTGTATTTCTCACATCATAGTAGTTGTCTTATTCTTTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCTGTATATTTGTGTATCTGCGCTCAGTGACCACTCTGCCCATTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCTGTATATTTGTGTATCTGCGCTCAGTGACCACTCTGCCCATTGATAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCTGTTGCTGTATTTTATACTATGGTGGTCCCAATGTTAAATCCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCTGTTGCTGTATTTTATACTATGGTGGTCCCAATGTTAAATCCCGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTACACACTCAGAAATGCTGAGGTAAAAAGTGCAATAAGGAAGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTACACACTCAGAAATGCTGAGGTAAAAAGTGCAATAAGGAAGCTTTGG

    900     .    :    .    :    .
    901 AGAAAAAAAGTGACTTCAGATAATGAT
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAAAAAAAGTGACTTCAGATAATGAT