seq1 = pF1KE5903.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5903/gi568815587r_54503072.tfa (gi568815587r:54503072_54703998), 200927 bp

>pF1KE5903 927
>gi568815587r:54503072_54703998 (Chr11)

(complement)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATAGGAATAACATGACAGAGTTTGTTTTGCTGGGGCTTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATAGGAATAACATGACAGAGTTTGTTTTGCTGGGGCTTACAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATCCAAAGATGCAGAAAATCATATTTGTTGTGTTTTTTGTCATCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATCCAAAGATGCAGAAAATCATATTTGTTGTGTTTTTTGTCATCTATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCACTGTGGTGGGATATGTGCTCATTGTGGTCACCATCACTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCACTGTGGTGGGATATGTGCTCATTGTGGTCACCATCACTGCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCATCACTGGGGTCCCCCATGTACCTTTCCCTGGCCTATCTCTCCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCATCACTGGGGTCCCCCATGTACCTTTCCCTGGCCTATCTCTCCTTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATGCCTGCTATTCCTCTGTCAATACCCCTAACCTGATCACACATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATGCCTGCTATTCCTCTGTCAATACCCCTAACCTGATCACACATTCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTATGGAAAGAAGGCCATCCTATTCAATGGATGCATGACTCAAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTATGGAAAGAAGGCCATCCTATTCAATGGATGCATGACTCAAGTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAGAACATTTCTTCGGAGGTGCAGAGGGCATCCTACTTACTGTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAGAACATTTCTTCGGAGGTGCAGAGGGCATCCTACTTACTGTGATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGACCACTATGTGGCCATCTGCAAGCCCTTGCACTATATGACTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGACCACTATGTGGCCATCTGCAAGCCCTTGCACTATATGACTATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAACCAGTGTGTGTGTGCCCTGCTAATGGGAGTGGTGTGGATGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAACCAGTGTGTGTGTGCCCTGCTAATGGGAGTGGTGTGGATGGGAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTTCATGCAACCATACAGATCCTCTTCATCTTCCAATTACCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTTCATGCAACCATACAGATCCTCTTCATCTTCCAATTACCTTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGTCCTAATGTCATAGATCACTTTATGTGTGATCTGAACCCTTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGTCCTAATGTCATAGATCACTTTATGTGTGATCTGAACCCTTTGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTCGCCTGCACTGACACCCATATGCTGGAACTCTTCATTGCTGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTCGCCTGCACTGACACCCATATGCTGGAACTCTTCATTGCTGCCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGTGGATTCATCTGCTTGTTAAACTTTGCCCTCCTGCTGGTCTCCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGTGGATTCATCTGCTTGTTAAACTTTGCCCTCCTGCTGGTCTCCTATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTCATCTTGTGCTCCCTAAGGACTCATAGCTTGGAGGCAAGGCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTCATCTTGTGCTCCCTAAGGACTCATAGCTTGGAGGCAAGGCACAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTCTCCACCTGTGTCTTCCACATCACGGTTGTCATCTTATTCTTTGTG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTCTCCACCTGTGTCTCCCACATCACGGTTGTCATCTTATTCTTTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCTACATATTTGTGTACATGAGACCTGCAGCTACTTTACCTATTGATAA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCTGCATATTTGTGTACATGAGACCTGCAGCTACTTTACCTATTGATAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCAGTTGCTATATTCTACACTATGATAACTCCTATGTTAAACCCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCAGTTGCTATATTCTACACTATGATAACTCCTATGTTAAACCCCTTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTATACCTTGAGGAATGCCCAGATGAAAAATGCCATCAGGAAATTGTGT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTATACCTTGAAGAATGCCCAGATGAAAAATGCCATCAGGAAATTGTGT

    900     .    :    .    :    .
    901 AGTAGAAAGGACATTTCAGGTGACAAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGTAGAAAGGACATTTCAGGTGACAAA