seq1 = pF1KE5903.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5903/gi568815587r_48332220.tfa (gi568815587r:48332220_48533147), 200928 bp

>pF1KE5903 927
>gi568815587r:48332220_48533147 (Chr11)

(complement)

1-927  (100001-100928)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATAGGAATAACATGACAGAGTTTGTTTTGCTGGGGCTTACAGA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||
 100001 ATGGAGAATAGGAATAACGTGACAGAGTTTGTTTTACTAGGGCTTACAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATCCAAAGATGCAGAAAATCATATTTGTTGTG TTTTTTGTCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||
 100051 GAATCCAAAGATGCAGAAAATCATATTTGTTGTGTTTTTTTGTCATCTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 ATCATCACTGTGGTGGGATATGTGCTCATTGTGGTCACCATCACTGCCAG
        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCATCACTGTGGTGGGAAATGCGCTCATTGTGGTCACCATCACTGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 CCCATCACTGGGGTCCCCCATGTACCTTTCCCTGGCCTATCTCTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100151 CCCATCACTGGGGTCCCCCATGTACCTTTTCCTGGCCTATCTCTCCTTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 TTGATGCCTGCTATTCCTCTGTCAATACCCCTAACCTGATCACACATTCA
        | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||
 100201 TAGATGCCTGCTATTCTTCTGTCAATACCCCTAAGCTGATCACAGATTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250 CTCTATGGAAAGAAGGCCATCCTATTCAATGGATGCATGACTCAAGTCTT
        ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCTATGGAAAGAACACCATCCTATTCAATGGATGCATGACTCAAGTCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    300 TGGAGAACATTTCTTCGGAGGTGCAGAGGGCATCCTACTTACTGTGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100301 TGGAGAACATTTCTTCGGAGGTGCAGAGGGTATCCTACTTACTGTGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350 CCTATGACCACTATGTGGCCATCTGCAAGCCCTTGCACTATATGACTATC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTATGACCGCTATGTGGCCATCTGCAAGCCCTTGCACTATATGACTATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    400 ATGAACCAGTGTGTGTGTGCCCTGCTAATGGGAGTGGTGTGGATGGGAGG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGAACCAGTGTGTGTATGCCCTGCTAATGGGAGTGGTGTGGATGGGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    450 CTTTCTTCATGCAACCATACAGATCCTCTTCATCTTCCAATTACCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTTCTTCATGCAACCATACAGATCCTCTTCATCTTCCAATTACCTTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500 GTGGTCCTAATGTCATAGATCACTTTATGTGTGATCTGAACCCTTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGGTCCTAATGTCATAGATCACTTTATGTGTGATCTGAACCCTTTGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550 AACCTCGCCTGCACTGACACCCATATGCTGGAACTCTTCATTGCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100551 AACCTCGCCTGCACTGACACCCATATGCTGGGACTCTTCATTGCTGCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600 CAGTGGATTCATCTGCTTGTTAAACTTTGCCCTCCTGCTGGTCTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100601 CAGTGGATTCATCTGCTTGTTAAACTTTGTCCTCCTGCTGGTCTCCTATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    650 TGGTCATCTTGTGCTCCCTAAGGACTCATAGCTTGGAGGCAAGGCACAAA
        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100651 TGGTCATCTTGCGCTCCCTAAGGACTCACAGCTTGGAGGCAAGGCACAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700 GCCCTCTCCACCTGTGTCTTCCACATCACGGTTGTCATCTTATTCTTTGT
        ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
 100701 GCCCTCTCCACCTGTGTCTCCCACATCACAGTTGTCATCTTATTCTTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    750 GCCCTACATATTTGTGTACATGAGACCTGCAGCTACTTTACCTATTGATA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCCTGCATATTTGTGTACATGAGACCTGCAGCTACTTTACCTATTGATA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800 AAGCAGTTGCTATATTCTACACTATGATAACTCCTATGTTAAACCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAGCAGTTGCTATATTCTACACTATGATAACTCCTATGTTAAACCCCTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850 ATCTATACCTTGAGGAATGCCCAGATGAAAAATGCCATCAGGAAATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCTATACCTTGAGGAATGCCCAGATGAAAAATGCCATCAGGAAATTGTG

    900     .    :    .    :    .
    900 TAGTAGAAAGGACATTTCAGGTGACAAA
        |||||||||||||||||||||| |||||
 100901 TAGTAGAAAGGACATTTCAGGTAACAAA