seq1 = pF1KE5902.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5902/gi568815587f_56888914.tfa (gi568815587f:56888914_57089840), 200927 bp

>pF1KE5902 927
>gi568815587f:56888914_57089840 (Chr11)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACACTAGGAAACAGCACTGAAGTCACTGAATTCTATCTTCTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACACTAGGAAACAGCACTGAAGTCACTGAATTCTATCTTCTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGTGCCCAGCATGAGTTTTGGTGTATCCTCTTCATTGTATTCCTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGTGCCCAGCATGAGTTTTGGTGTATCCTCTTCATTGTATTCCTTCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTGACCTCCATAATGGGTAATACTGGAATAATCTTACTCATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTGACCTCCATAATGGGTAATAGTGGAATAATCTTACTCATCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAGATTCCAGATTTCAAACACTCACGTACTTTTTTCTACAACATTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGATTCCAGATTTCAAACACTCACGTACTTTTTTCTACAACATTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTGTTGATATCTGTTACACTTCTGCTATCACTCCCAAGATGCTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTGTTGATATCTGTTACACTTCTGCTATCACTCCCAAGATGCTCCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCACAGAAGAAAAGAATTTGATATTATTTCAGGGCTGTGTGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCACAGAAGAAAAGAATTTGATGTTATTTCAGGGCTGTGTGATACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTAGTTTATGCAACATTTGCAACCAGTGACTGTTATCTCCTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTAGTTTATGCAACATTTGCAACCAGTGACTGTTATCTCCTGGCTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCAGTGGATCCTTATGTTGCCATCTGTAAGCCCCTTCACTATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCAGTGGATCCTTATGTTGCCATCTGTAAGCCCCTTCACTATACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAATCATGTCCCGAACAGTCTGCATCCGTTTGGTAGCTGGTTCATACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAATCATGTCCCGAACAGTCTGCATCCGTTTGGTAGCTGGTTCATACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGGCTCAATAAATGCCTCTGTACAAACAGGTTTTACATGTTCACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGGCTCAATAAATGCCTCTGTACAAACAGGTTTTACATGTTCACTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGCAAGTCCAATAGCATCAATCACTTTTTCTGTGATGTTCCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGCAAGTCCAATAGCATCAATCACTTTTTCTGTGATGTTCCCCCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCTTGCTCTTTCATGCTCCAATGTTGACATCAACATCATGCTACTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCTTGCTCTTTCATGCTCCAATGTTGACATCAACATCATGCTACTTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTCTTTGTGGGATCTAACTTGATATTCACTGGGTTGGTCGTCATCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTCTTTGTGGGATCTAACTTGATATTCACTGGGTTGGTCGTCATCTTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACATCTACATCATGGCCACCATCCTGAAAATGTCTTCTAGTGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACATCTACATCATGGCCACCATCCTGAAAATGTCTTCTAGTGCAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAAAAATCCTTCTCAACATGTGCTTCCCACCTGACCGCAGTCACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAAAAATCCTTCTCAACATGTGCTTCCCACCTGACCGCAGTCACCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACACTCTCTTACATGTATTTGCAGTCTCATTCTAATAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACACTCTCTTACATGTATTTGCAGTCTCATTCTAATAATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCAGGAAAATATGAAAGTGGCCTTTATATTTTATGGCACAGTTATTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCAGGAAAATATGAAAGTGGCCTTTATATTTTATGGCACAGTTATTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTAAATCCTTTAATCTATAGCTTGAGAAATAAGGAAGTAAAAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTAAATCCTTTAATCTATAGCTTGAGAAATAAGGAAGTAAAAGAAGCT

    900     .    :    .    :    .
    901 TTAAAAGTGATAGGGAAAAAGTTATTT
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAAAAGTGATAGGGAAAAAGTTATTT