seq1 = pF1KE5817.tfa, 2541 bp
seq2 = pF1KE5817/gi568815584r_50805395.tfa (gi568815584r:50805395_51044403), 239009 bp

>pF1KE5817 2541
>gi568815584r:50805395_51044403 (Chr14)

(complement)

1-243  (100001-100243)   100% ->
244-345  (106567-106668)   100% ->
346-424  (109219-109297)   100% ->
425-528  (112628-112731)   100% ->
529-660  (120304-120435)   100% ->
661-772  (123337-123448)   100% ->
773-855  (123781-123863)   100% ->
856-999  (127299-127442)   100% ->
1000-1092  (127670-127762)   100% ->
1093-1239  (128433-128579)   100% ->
1240-1403  (128905-129068)   100% ->
1404-1518  (129589-129703)   100% ->
1519-1620  (131274-131375)   100% ->
1621-1768  (132101-132248)   100% ->
1769-1827  (132368-132426)   100% ->
1828-1969  (132533-132674)   100% ->
1970-2177  (134302-134509)   100% ->
2178-2312  (135449-135583)   100% ->
2313-2379  (136067-136133)   100% ->
2380-2541  (138848-139009)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGTGGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGTGGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGATCCGCACGCAGCAGCACTACTACGACAAGTGCCCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 CTGGATCCGCACGCAGCAGCACTACTACGACAAGTGCCCCAAGGTA...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   AGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106565 AGAGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACACCATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106615 AACACCATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAG         CTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAGAAGAAATTGAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106665 CCAGGTA...CAGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAGAAGAAATTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109256 AAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGGTA...TA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  CCTGCTTCTTGGATTCCATGGCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112627 GCCTGCTTCTTGGATTCCATGGCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112677 CGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGATGGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCAG         GTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112727 GGCAGGTG...CAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCATGCTGCCTGTGCACTTCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120340 CCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCATGCTGCCTGTGCACTTCTATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 120390 AAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    661      GTGGTCCTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120440 ..CAGGTGGTCCTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGCTCGGGCACCAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123382 AATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGCTCGGGCACCAAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTTAACCTCAGAGACT         TTAATGTTGGAGACTACATTCAGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 123432 CTTTAACCTCAGAGACTGTG...TAGTTAATGTTGGAGACTACATTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTGTGCTGGACCGAAACCTGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123805 CTGTGCTGGACCGAAACCTGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATGACAAT         TTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 123855 AATGACAATGTG...AAGTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127331 GGAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCGTGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127381 AAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCGTGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCCCGGATCAG         GTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 127431 TTCCCGGATCAGGCA...CAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGCACTCGCGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127699 TGCACTCGCGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGCCCTGGTCCAAG         GCATGGGAGCTCACCCAGAAGACCTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 127749 TGCCCTGGTCCAAGGTC...CAGGCATGGGAGCTCACCCAGAAGACCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128460 GCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGACCTGGTGGAGAAGCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128510 GGACCTGGTGGAGAAGCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAAATCAGAAGCATTTAGAT         AGAATTGTGGCCTTGTTTCCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 128560 TAAATCAGAAGCATTTAGATGTA...TAGAGAATTGTGGCCTTGTTTCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128926 AAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAAAAGGATCAACATGGCCCATCTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128976 CAAAAGGATCAACATGGCCCATCTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 129026 ATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGTGTG...C

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1404   ATTCAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129587 AGATTCAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCCTACTCTGCAACCCAGGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129637 CAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCCTACTCTGCAACCCAGGACTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CAGAGCTCATAGCAGAG         AAAATTGGAGAAGACTATGTGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 129687 CAGAGCTCATAGCAGAGGTA...AAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GACCTGAGCCAGCTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131298 GACCTGAGCCAGCTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAG         GAGAATAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 131348 CCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGTG...CAGGAGAATAAGCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132114 AGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TCCATGTTTGATGTCCAGGTGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132164 TCCATGTTTGATGTCCAGGTGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACC         GCATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 132214 CTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGTG...CAGGCATTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AGAAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132374 AGAAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AAA         GCTGCCCCAGGATATCACATGGCCAAAATGATCATAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132424 AAAGTA...AAGGCTGCCCCAGGATATCACATGGCCAAAATGATCATAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132571 GCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GCAAGTTGAAAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132621 GCAAGTTGAAAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AAAG         TCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAGATTTCCAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132671 AAAGGTA...CAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAGATTTCCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134339 TGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GGGCCCTAACTATCGGGACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134389 GGGCCCTAACTATCGGGACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGATAGATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134439 GAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGATAGATGATGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GGCTGCTTTGGACAAGAAAGG         GTACGAGGCAAAAGAATACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134489 GGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTA...CAGGTACGAGGCAAAAGAATACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAGCTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135469 ATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAGCTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135519 TTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACATGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 ATTTTATCATGACAG         GTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 135569 ATTTTATCATGACAGGTG...AAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 CCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTCAGCTGTACATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136093 CCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTCAGCTGTACATGGTG...CAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 AATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138848 AATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GAAATTCTCCAGTGACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138898 GAAATTCTCCAGTGACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 ACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAATGAATCTAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138948 ACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAATGAATCTAACAAA

   2700     .    :
   2530 GTCAATGGAAAT
        ||||||||||||
 138998 GTCAATGGAAAT