seq1 = pF1KE5811.tfa, 2670 bp
seq2 = pF1KE5811/gi568815593r_45161924.tfa (gi568815593r:45161924_45796093), 634170 bp

>pF1KE5811 2670
>gi568815593r:45161924_45796093 (Chr5)

(complement)

1-425  (100001-100425)   100% ->
426-849  (150486-150909)   100% ->
850-1011  (334087-334248)   100% ->
1012-1230  (399384-399602)   100% ->
1231-1377  (442848-442994)   100% ->
1378-1618  (492255-492495)   100% ->
1619-1783  (528841-529005)   100% ->
1784-2670  (533284-534170)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGAGGCGGCAAGCCCAACTCTTCGTCTAACAGCCGGGACGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGAGGCGGCAAGCCCAACTCTTCGTCTAACAGCCGGGACGATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACAGCGTCTTCCCCGCCAAGGCGTCCGCGACGGGCGCGGGGCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACAGCGTCTTCCCCGCCAAGGCGTCCGCGACGGGCGCGGGGCCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCCGAGAAGCGCCTGGGCACCCCGCCGGGGGGCGGCGGGGCCGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCCGAGAAGCGCCTGGGCACCCCGCCGGGGGGCGGCGGGGCCGGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGAGCACGGCAACTCCGTGTGCTTCAAGGTGGACGGCGGTGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGAGCACGGCAACTCCGTGTGCTTCAAGGTGGACGGCGGTGGCGGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAGCCGGCGGGGGGCTTCGAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAGCCGGCGGGGGGCTTCGAAGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGAGGGGCCCCGGCGGCAGTACGGCTTCATGCAGAGGCAGTTCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGAGGGGCCCCGGCGGCAGTACGGCTTCATGCAGAGGCAGTTCACCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCTGCAGCCCGGGGTCAACAAATTCTCCCTCCGCATGTTTGGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCTGCAGCCCGGGGTCAACAAATTCTCCCTCCGCATGTTTGGGAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGCGGTGGAAAAGGAGCAGGAAAGGGTTAAAACTGCAGGCTTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGGCGGTGGAAAAGGAGCAGGAAAGGGTTAAAACTGCAGGCTTCTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTATCCACCCTTACAGTGATTTCAG         GTTTTACTGGGATTTA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100401 TTATCCACCCTTACAGTGATTTCAGGTG...TAGGTTTTACTGGGATTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATAATGCTTATAATGATGGTTGGAAATCTAGTCATCATACCAGTTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150502 ATAATGCTTATAATGATGGTTGGAAATCTAGTCATCATACCAGTTGGAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACATTCTTTACAGAGCAAACAACAACACCATGGATTATTTTCAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150552 CACATTCTTTACAGAGCAAACAACAACACCATGGATTATTTTCAATGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CATCAGATACAGTTTTCCTATTGGACCTGATCATGAATTTTAGGACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150602 CATCAGATACAGTTTTCCTATTGGACCTGATCATGAATTTTAGGACTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACTGTCAATGAAGACAGTTCTGAAATCATCCTGGACCCCAAAGTGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150652 ACTGTCAATGAAGACAGTTCTGAAATCATCCTGGACCCCAAAGTGATCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GATGAATTATTTAAAAAGCTGGTTTGTGGTTGACTTCATCTCATCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150702 GATGAATTATTTAAAAAGCTGGTTTGTGGTTGACTTCATCTCATCCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAGTGGATTATATCTTTCTTATTGTAGAAAAAGGAATGGATTCTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150752 CAGTGGATTATATCTTTCTTATTGTAGAAAAAGGAATGGATTCTGAAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACAAGACAGCCAGGGCACTTCGCATTGTGAGGTTTACAAAAATTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150802 TACAAGACAGCCAGGGCACTTCGCATTGTGAGGTTTACAAAAATTCTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCTCTTGCGTTTATTACGACTTTCAAGGTTAATTAGATACATACATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150852 TCTCTTGCGTTTATTACGACTTTCAAGGTTAATTAGATACATACATCAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGGAAGAG         ATATTCCACATGACATATGATCTCGCCAGTGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 150902 GGGAAGAGGTA...CAGATATTCCACATGACATATGATCTCGCCAGTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GTGGTGAGAATTTTTAATCTCATCGGCATGATGCTGCTCCTGTGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334120 GTGGTGAGAATTTTTAATCTCATCGGCATGATGCTGCTCCTGTGCCACTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGATGGTTGTCTTCAGTTCTTAGTACCACTACTGCAGGACTTCCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334170 GGATGGTTGTCTTCAGTTCTTAGTACCACTACTGCAGGACTTCCCACCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATTGCTGGGTGTCTTTAAATGAAATGGTT         AATGATTCTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 334220 ATTGCTGGGTGTCTTTAAATGAAATGGTTGTA...CAGAATGATTCTTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGAAAGCAGTATTCATACGCACTCTTCAAAGCTATGAGTCACATGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399396 GGAAAGCAGTATTCATACGCACTCTTCAAAGCTATGAGTCACATGCTGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CATTGGGTATGGAGCCCAAGCCCCAGTCAGCATGTCTGACCTCTGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399446 CATTGGGTATGGAGCCCAAGCCCCAGTCAGCATGTCTGACCTCTGGATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCATGCTGAGCATGATCGTCGGGGCCACCTGCTATGCCATGTTTGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399496 CCATGCTGAGCATGATCGTCGGGGCCACCTGCTATGCCATGTTTGTCGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CATGCCACCGCTTTAATCCAGTCTCTGGATTCTTCGAGGCGGCAGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399546 CATGCCACCGCTTTAATCCAGTCTCTGGATTCTTCGAGGCGGCAGTATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGAGAAG         TATAAGCAAGTGGAACAATACATGTCATTCCATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399596 AGAGAAGGTA...CAGTATAAGCAAGTGGAACAATACATGTCATTCCATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGTTACCAGCTGATATGCGTCAGAAGATACATGATTACTATGAACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 442882 AGTTACCAGCTGATATGCGTCAGAAGATACATGATTACTATGAACACAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TACCAAGGCAAAATCTTTGATGAGGAAAATATTCTCAATGAACTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 442932 TACCAAGGCAAAATCTTTGATGAGGAAAATATTCTCAATGAACTCAATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TCCTCTGAGAGAG         GAGATAGTCAACTTCAACTGTCGGAAAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 442982 TCCTCTGAGAGAGGTA...TAGGAGATAGTCAACTTCAACTGTCGGAAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGGTGGCTACAATGCCTTTATTTGCTAATGCGGATCCTAATTTTGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 492283 TGGTGGCTACAATGCCTTTATTTGCTAATGCGGATCCTAATTTTGTGACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GCCATGCTGAGCAAGTTGAGATTTGAGGTGTTTCAACCTGGAGATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 492333 GCCATGCTGAGCAAGTTGAGATTTGAGGTGTTTCAACCTGGAGATTATAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CATACGAGAAGGAGCCGTGGGTAAAAAAATGTATTTCATTCAACACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 492383 CATACGAGAAGGAGCCGTGGGTAAAAAAATGTATTTCATTCAACACGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TTGCTGGTGTCATTACAAAATCCAGTAAAGAAATGAAGCTGACAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 492433 TTGCTGGTGTCATTACAAAATCCAGTAAAGAAATGAAGCTGACAGATGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 TCTTACTTTGGAG         AGATTTGCCTGCTGACCAAAGGACGTCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 492483 TCTTACTTTGGAGGTT...TAGAGATTTGCCTGCTGACCAAAGGACGTCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TACTGCCAGTGTTCGAGCTGATACATATTGTCGTCTTTACTCACTTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 528869 TACTGCCAGTGTTCGAGCTGATACATATTGTCGTCTTTACTCACTTTCCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TGGACAATTTCAACGAGGTCCTGGAGGAATATCCAATGATGAGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 528919 TGGACAATTTCAACGAGGTCCTGGAGGAATATCCAATGATGAGGAGAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TTTGAGACAGTTGCCATTGACCGACTAGATCGAATAG         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 528969 TTTGAGACAGTTGCCATTGACCGACTAGATCGAATAGGTA...CAGGAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GAAAAATTCAATTCTTCTGCAAAAGTTCCAGAAGGATCTGAACACTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533288 GAAAAATTCAATTCTTCTGCAAAAGTTCCAGAAGGATCTGAACACTGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 TTTTCAACAATCAGGAGAACGAAATCCTCAAGCAGATTGTGAAACATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533338 TTTTCAACAATCAGGAGAACGAAATCCTCAAGCAGATTGTGAAACATGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AGGGAGATGGTGCAGGCAATCGCTCCCATCAATTATCCTCAAATGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533388 AGGGAGATGGTGCAGGCAATCGCTCCCATCAATTATCCTCAAATGACAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 CCTGAATTCCACATCGTCTACTACGACCCCGACCTCCCGCATGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533438 CCTGAATTCCACATCGTCTACTACGACCCCGACCTCCCGCATGAGGACAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 AATCTCCACCGGTGTACACAGCGACCAGCCTGTCTCACAGCAACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533488 AATCTCCACCGGTGTACACAGCGACCAGCCTGTCTCACAGCAACCTGCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 TCCCCCAGTCCCAGCACACAGACCCCCCAGCCATCAGCCATCCTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533538 TCCCCCAGTCCCAGCACACAGACCCCCCAGCCATCAGCCATCCTGTCACC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 CTGCTCCTACACCACCGCGGTCTGCAGCCCTCCTGTACAGAGCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533588 CTGCTCCTACACCACCGCGGTCTGCAGCCCTCCTGTACAGAGCCCTCTGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 CCGCTCGAACTTTCCACTATGCCTCCCCCACCGCCTCCCAGCTGTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533638 CCGCTCGAACTTTCCACTATGCCTCCCCCACCGCCTCCCAGCTGTCACTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 ATGCAACAGCAGCCGCAGCAGCAGGTACAGCAGTCCCAGCCGCCGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533688 ATGCAACAGCAGCCGCAGCAGCAGGTACAGCAGTCCCAGCCGCCGCAGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 TCAGCCACAGCAGCCGTCCCCGCAGCCACAGACACCTGGCAGCTCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533738 TCAGCCACAGCAGCCGTCCCCGCAGCCACAGACACCTGGCAGCTCCACGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 CGAAAAATGAAGTGCACAAGAGCACGCAGGCGCTTCACAACACCAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533788 CGAAAAATGAAGTGCACAAGAGCACGCAGGCGCTTCACAACACCAACCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 ACCCGGGAAGTCAGGCCACTCTCCGCCTCGCAGCCCTCGCTGCCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533838 ACCCGGGAAGTCAGGCCACTCTCCGCCTCGCAGCCCTCGCTGCCCCATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 GGTGTCCACTCTGATTTCCAGACCTCATCCCACTGTGGGCGAGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533888 GGTGTCCACTCTGATTTCCAGACCTCATCCCACTGTGGGCGAGTCCCTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 CCTCCATCCCTCAACCCGTGACGGCGGTCCCCGGAACGGGCCTTCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533938 CCTCCATCCCTCAACCCGTGACGGCGGTCCCCGGAACGGGCCTTCAGGCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 GGGGGCAGGAGCACTGTCCCGCAGCGCGTCACCCTCTTCCGACAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 533988 GGGGGCAGGAGCACTGTCCCGCAGCGCGTCACCCTCTTCCGACAGATGTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538 GTCGGGAGCCATCCCCCCGAACCGAGGAGTCCCTCCAGCACCCCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 534038 GTCGGGAGCCATCCCCCCGAACCGAGGAGTCCCTCCAGCACCCCCTCCAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2588 CAGCAGCTGCTCTTCCAAGAGAATCTTCCTCAGTCTTAAACACAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 534088 CAGCAGCTGCTCTTCCAAGAGAATCTTCCTCAGTCTTAAACACAGACCCA

   2700     .    :    .    :    .    :
   2638 GACGCAGAAAAGCCACGATTTGCTTCAAATTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 534138 GACGCAGAAAAGCCACGATTTGCTTCAAATTTA