seq1 = pF1KE5791.tfa, 1893 bp
seq2 = pF1KE5791/gi568815575f_22900058.tfa (gi568815575f:22900058_23101950), 201893 bp

>pF1KE5791 1893
>gi568815575f:22900058_23101950 (ChrX)

1-1893  (100001-101893)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCACTGGGCCCCAGAGTGGAAGAGGGCGGAGGCTAATCCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCACTGGGCCCCAGAGTGGAAGAGGGCGGAGGCTAATCCAAGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTGGGGCCAGCTGGGATGTCAGGGGCAGCAGAGGCAGTGGCTGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTGGGGCCAGCTGGGATGTCAGGGGCAGCAGAGGCAGTGGCTGGAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCTTCGGCCATCAGGGACCGAGAGCAGCAGGCTCCCGTGAACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCTTCGGCCATCAGGGACCGAGAGCAGCAGGCTCCCGTGAACCACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTGCTTTAAAATAAAGAACAATATGGTTGGTGTGGTCATTGGTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTGCTTTAAAATAAAGAACAATATGGTTGGTGTGGTCATTGGTTACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGATCAAAAATAAAAGATCTACAACATTCGACAAACACTAAAATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGATCAAAAATAAAAGATCTACAACATTCGACAAACACTAAAATACAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATAAACGGGGAATCTGAAGCAAAAGTCAGAATTTTTGGCAATAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATAAACGGGGAATCTGAAGCAAAAGTCAGAATTTTTGGCAATAGGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGAAAGCAAAGGCCAAAGCGGCTATAGAAACACTTATTAGAAAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGAAAGCAAAGGCCAAAGCGGCTATAGAAACACTTATTAGAAAACAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGCTACAACTCAGAATCCAGTGTGGATAATGCTGCATCCCAAACCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAGCTACAACTCAGAATCCAGTGTGGATAATGCTGCATCCCAAACCCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGGAAGAAATCTAGGCAGAAATGACATTGTTGGAGAAGCTGAGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGGAAGAAATCTAGGCAGAAATGACATTGTTGGAGAAGCTGAGCCATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCAAATTGGGATCGCATTAGGGCAGCAGTCGTGGAGTGCGAAAAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCAAATTGGGATCGCATTAGGGCAGCAGTCGTGGAGTGCGAAAAGAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATGGGCAGATCTACCACCAGTTAAGAAAAACTTTTACATAGAATCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATGGGCAGATCTACCACCAGTTAAGAAAAACTTTTACATAGAATCCAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAACAAGCTGCATGTCTGAAATGCAGGTGATTAACTGGAGAAAGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAACAAGCTGCATGTCTGAAATGCAGGTGATTAACTGGAGAAAGGAAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCAACATAACGTGTGATGACTTGAAAAGTGGTGAAAAGCGTCTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCAACATAACGTGTGATGACTTGAAAAGTGGTGAAAAGCGTCTCATTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAACCAACTTGCAGGTTTAAAGACGCTTTTCAGCAATACCCTGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAACCAACTTGCAGGTTTAAAGACGCTTTTCAGCAATACCCTGATCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAAAAGCATAATAAGGGTAGGGATTGTAAAGCCAACGCCAATTCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAAAAGCATAATAAGGGTAGGGATTGTAAAGCCAACGCCAATTCAGTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGGCATGGCCAATTATTCTACAAGGAATAGATCTTATAGTAGTTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGGCATGGCCAATTATTCTACAAGGAATAGATCTTATAGTAGTTGCACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AACCGGAACAGGGAAAACATTGTCCTATCTAATGCCTGGGTTTATTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AACCGGAACAGGGAAAACATTGTCCTATCTAATGCCTGGGTTTATTCATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTGATTCTCAACCAATATCTAGAGAGCAAAGGAATGGGCCTGGGATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTGATTCTCAACCAATATCTAGAGAGCAAAGGAATGGGCCTGGGATGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTCCTTACACCCACTAGAGAGTTGGCTCTTCACGTGGAAGCTGAATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTCCTTACACCCACTAGAGAGTTGGCTCTTCACGTGGAAGCTGAATGTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AAAGTATTCATATAAAGGTCTCAAAAGCATTTGCATATATGGTGGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AAAGTATTCATATAAAGGTCTCAAAAGCATTTGCATATATGGTGGTAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACAGAAATGGACAAATAGAAGACATTAGCAAAGGTGTAGATATCATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACAGAAATGGACAAATAGAAGACATTAGCAAAGGTGTAGATATCATTATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCAACTCCTGGGAGGCTGAATGACCTACAAATGAATAACTCTGTCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCAACTCCTGGGAGGCTGAATGACCTACAAATGAATAACTCTGTCAACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAGAAGCATAACCTACTTGGTTATAGATGAGGCAGATAAAATGCTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAGAAGCATAACCTACTTGGTTATAGATGAGGCAGATAAAATGCTGGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGAATTTGAACCCCAGATAAGGAAGATTTTATTAGATGTGCGCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGAATTTGAACCCCAGATAAGGAAGATTTTATTAGATGTGCGCCCAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGACAGACTGTTATGACAAGTGCAACTTGGCCAGATACTGTACGTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGACAGACTGTTATGACAAGTGCAACTTGGCCAGATACTGTACGTCAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGCACTTTCTTATTTGAAAGATCCTATGATTGTTTATGTTGGTAATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGCACTTTCTTATTTGAAAGATCCTATGATTGTTTATGTTGGTAATCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATCTAGTGGCTGTAAATACAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATCTAGTGGCTGTAAATACAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACCACAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAAGAAAAACGAGCTCTCACCCAAGAATTCGTAGAGAACATGTCACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAAGAAAAACGAGCTCTCACCCAAGAATTCGTAGAGAACATGTCACCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGACAAAGTCATCATGTTTGTCAGCCAAAAACATATTGCTGATGACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGACAAAGTCATCATGTTTGTCAGCCAAAAACATATTGCTGATGACTTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CAAGCGACTTCAATATCCAAGGCATATCTGCAGAATCATTACATGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CAAGCGACTTCAATATCCAAGGCATATCTGCAGAATCATTACATGGCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGTGAACAGAGTGATCAAGAGCGAGCAGTAGAGGACTTTAAAAGCGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGTGAACAGAGTGATCAAGAGCGAGCAGTAGAGGACTTTAAAAGCGGAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CATAAAGATACTGATTACAACTGATATAGTATCCCGAGGTCTTGATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CATAAAGATACTGATTACAACTGATATAGTATCCCGAGGTCTTGATCTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATGATGTCACACATGTATATAATTATGATTTCCCAAGGAATATTGACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATGATGTCACACATGTATATAATTATGATTTCCCAAGGAATATTGACGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TATGTACACAGAGTAGGGTACATTGGACGGACAGGAAAGACTGGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TATGTACACAGAGTAGGGTACATTGGACGGACAGGAAAGACTGGCACATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AGTTACCCTCATCACTCAGAGAGATTCGAAAATGGCCGGTGAATTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 AGTTACCCTCATCACTCAGAGAGATTCGAAAATGGCCGGTGAATTGATTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AAATTCTGGACAGAGCAAATCAGAGTGTTCCGGAAGATCTTGTAGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AAATTCTGGACAGAGCAAATCAGAGTGTTCCGGAAGATCTTGTAGTAATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GCTGAGCAATACAAGTTAAATCAACAAAAGAGGCACAGAGAAACACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GCTGAGCAATACAAGTTAAATCAACAAAAGAGGCACAGAGAAACACGATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AAGAAAACCTGGACAAAGACGCAAGGAGTTTTATTTTTTAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AAGAAAACCTGGACAAAGACGCAAGGAGTTTTATTTTTTAAGT