seq1 = pF1KE5769.tfa, 1761 bp
seq2 = pF1KE5769/gi568815576r_24119973.tfa (gi568815576r:24119973_24344725), 224753 bp

>pF1KE5769 1761
>gi568815576r:24119973_24344725 (Chr22)

(complement)

1-173  (100001-100173)   100% ->
174-304  (110722-110852)   100% ->
305-400  (111133-111228)   100% ->
401-596  (111708-111903)   100% ->
597-754  (112518-112675)   100% ->
755-901  (113196-113342)   100% ->
902-1038  (117959-118095)   100% ->
1039-1229  (118460-118650)   100% ->
1230-1336  (119074-119180)   100% ->
1337-1506  (119312-119481)   100% ->
1507-1617  (119620-119730)   100% ->
1618-1761  (124610-124753)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGGGCTACGGGGCCACGGTCAGCCTAGTCCTGCTGGGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGGGCTACGGGGCCACGGTCAGCCTAGTCCTGCTGGGTCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGCGCTGGCTGTCATTGTGCTGGCTGTGGTCCTCTCTCGACACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGCGCTGGCTGTCATTGTGCTGGCTGTGGTCCTCTCTCGACACCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCATGTGGCCCCCAGGCCTTTGCCCACGCTGCTGTTGCCGCCGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCATGTGGCCCCCAGGCCTTTGCCCACGCTGCTGTTGCCGCCGACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGTCTGCTCGGATATTGGACG         AGCCATCCTCCAGCAGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100151 AAGGTCTGCTCGGATATTGGACGGTG...TAGAGCCATCCTCCAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCTCACCCGTGGATGCCACCATCGCGGCTCTGGTCTGCACCAGCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110740 GGGCTCACCCGTGGATGCCACCATCGCGGCTCTGGTCTGCACCAGCGTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAACCCTCAGAGCATGGGCCTGGGCGGAGGGGTCATCTTCACCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110790 TCAACCCTCAGAGCATGGGCCTGGGCGGAGGGGTCATCTTCACCATCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATGTGACAACAG         GGAAGGTGGAGGTCATCAATGCCCGGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110840 AATGTGACAACAGGTG...CAGGGAAGGTGGAGGTCATCAATGCCCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACGGTGCCGGCCAGCCACGCCCCGAGCCTGCTGGACCAGTGTGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111161 GACGGTGCCGGCCAGCCACGCCCCGAGCCTGCTGGACCAGTGTGCACAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCTGCCACTGGGCACAG         GGGCCCAGTGGATCGGGGTGCCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 111211 CTCTGCCACTGGGCACAGGTG...CAGGGGCCCAGTGGATCGGGGTGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGGAGCTCCGTGGCTATGCCGAGGCCCACCGCCGCCATGGCCGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111731 GGGGAGCTCCGTGGCTATGCCGAGGCCCACCGCCGCCATGGCCGCCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGGGCGCAGCTGTTCCAGCCCACCATCGCGCTGCTCCGAGGGGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111781 CTGGGCGCAGCTGTTCCAGCCCACCATCGCGCTGCTCCGAGGGGGGCATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGTGGCCCCTGTCCTCAGCCGTTTCCTGCACAACAGCATCCTGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111831 TGGTGGCCCCTGTCCTCAGCCGTTTCCTGCACAACAGCATCCTGCGGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCTTGCAGGCGTCAACCCTGCG         CCAGCTCTTCTTCAACGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111881 TCCTTGCAGGCGTCAACCCTGCGGTG...CAGCCAGCTCTTCTTCAACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GACAGAACCCCTGAGGCCTCAGGACCCACTCCCATGGCCTGCACTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112536 GACAGAACCCCTGAGGCCTCAGGACCCACTCCCATGGCCTGCACTGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCACCCTGGAGACCGTGGCCACAGAGGGCGTGGAGGTCTTCTACACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112586 CCACCCTGGAGACCGTGGCCACAGAGGGCGTGGAGGTCTTCTACACGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGGCTGGGCCAGATGCTGGTGGAGGACATTGCCAAGGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112636 AGGCTGGGCCAGATGCTGGTGGAGGACATTGCCAAGGAAGGTC...CAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAGCCAGCTGACGCTGCAGGACCTGGCCAAGTTCCAGCCCGAGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113197 GAGCCAGCTGACGCTGCAGGACCTGGCCAAGTTCCAGCCCGAGGTGGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGCCCTGGAGGTGCCCCTGGGGGACTATACCCTGTACTCACCACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113247 ATGCCCTGGAGGTGCCCCTGGGGGACTATACCCTGTACTCACCACCGCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCTGCAGGGGGTGCCATTCTCAGCTTTATCCTCAACGTGCTAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 113297 CCTGCAGGGGGTGCCATTCTCAGCTTTATCCTCAACGTGCTAAGAGGTA.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902      GGTTCAACTTCTCAACAGAGTCTATGGCCAGGCCTGAAGGGAGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113347 ..CAGGGTTCAACTTCTCAACAGAGTCTATGGCCAGGCCTGAAGGGAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGAACGTGTACCACCACCTTGTAGAGACGCTCAAGTTTGCCAAGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118004 TGAACGTGTACCACCACCTTGTAGAGACGCTCAAGTTTGCCAAGGGGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGGTGGAGGCTGGGGGACCCTCGAAGCCACCCGAAGCTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118054 AGGTGGAGGCTGGGGGACCCTCGAAGCCACCCGAAGCTCCAGGTG...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1039  AATGCCTCCCGGGACCTGCTGGGGGAGACCCTGGCCCAGCTCATCCGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118459 GAATGCCTCCCGGGACCTGCTGGGGGAGACCCTGGCCCAGCTCATCCGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AACAGATCGATGGCCGGGGGGACCACCAGCTCAGCCACTACAGCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118509 AACAGATCGATGGCCGGGGGGACCACCAGCTCAGCCACTACAGCTTGGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGGCCTGGGGCCACGGGACAGGCACGTCCCATGTGTCTGTGCTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118559 GAGGCCTGGGGCCACGGGACAGGCACGTCCCATGTGTCTGTGCTGGGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGATGGCAGCGCCGTGGCTGCCACCAGCACCATCAACACACC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118609 GGATGGCAGCGCCGTGGCTGCCACCAGCACCATCAACACACCGTG...CA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1230  CTTTGGAGCGATGGTGTATTCACCACGGACAGGCATCATCCTCAACAAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119073 GCTTTGGAGCGATGGTGTATTCACCACGGACAGGCATCATCCTCAACAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGCTCCTGGACTTATGCGAGCGATGCCCCCGGGGTTCCGGCACCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119123 GAGCTCCTGGACTTATGCGAGCGATGCCCCCGGGGTTCCGGCACCACCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CTCACCTG         CAGTGAGTGGAGACAGGGTGGGTGGAGCTCCCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119173 CTCACCTGGTG...CAGCAGTGAGTGGAGACAGGGTGGGTGGAGCTCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GAAGGTGCTGGCCCCCAGTTCCAGGCGAGCGTTCCCCATCCTCCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119345 GAAGGTGCTGGCCCCCAGTTCCAGGCGAGCGTTCCCCATCCTCCATGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCCTCCATCTTGATCAACAAAGCCCAGGGGTCGAAGCTAGTGATTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119395 CCCTCCATCTTGATCAACAAAGCCCAGGGGTCGAAGCTAGTGATTGGCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGCTGGCGGGGAGCTCATCATCTCTGCTGTGGCCCAG         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 119445 GGCTGGCGGGGAGCTCATCATCTCTGCTGTGGCCCAGGTG...CAGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCATGAGCAAGCTGTGGCTTGGCTTTGACCTGAGAGCGGCCATTGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119624 TCATGAGCAAGCTGTGGCTTGGCTTTGACCTGAGAGCGGCCATTGCAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCCATCCTGCATGTCAACAGCAAGGGCTGTGTGGAGTACGAGCCCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119674 CCCATCCTGCATGTCAACAGCAAGGGCTGTGTGGAGTACGAGCCCAACTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CAGCCAG         GAGGTGCAGAGGGGACTCCAAGACCGTGGCCAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119724 CAGCCAGGTG...CAGGAGGTGCAGAGGGGACTCCAAGACCGTGGCCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACCAGACCCAGAGGCCCTTCTTCCTGAACGTGGTCCAGGCTGTGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124644 ACCAGACCCAGAGGCCCTTCTTCCTGAACGTGGTCCAGGCTGTGTCCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GAGGGGGCCTGTGTGTACGCCGTCTCGGACCTGAGGAAGAGTGGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124694 GAGGGGGCCTGTGTGTACGCCGTCTCGGACCTGAGGAAGAGTGGGGAGGC

   1850     .    :
   1752 CGCAGGCTAC
        ||||||||||
 124744 CGCAGGCTAC