seq1 = pF1KE5766.tfa, 1767 bp
seq2 = pF1KE5766/gi568815596r_222471874.tfa (gi568815596r:222471874_222756073), 284200 bp

>pF1KE5766 1767
>gi568815596r:222471874_222756073 (Chr2)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-114  (107279-107334)   100% ->
115-269  (113069-113223)   100% ->
270-339  (115143-115212)   100% ->
340-455  (116379-116494)   100% ->
456-606  (121533-121683)   100% ->
607-715  (122767-122875)   100% ->
716-786  (124400-124470)   100% ->
787-848  (125900-125961)   100% ->
849-900  (127186-127237)   100% ->
901-962  (131299-131360)   100% ->
963-1170  (131595-131802)   100% ->
1171-1251  (132344-132424)   100% ->
1252-1344  (136337-136429)   100% ->
1345-1462  (142146-142263)   100% ->
1463-1618  (155991-156146)   100% ->
1619-1767  (184052-184200)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCTACA         CTGACGAAGAATTTGATGAACTATGTTTTGAAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCTACAGTG...TAGCTGACGAAGAATTTGATGAACTATGTTTTGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGGTCTGGAGCTTGATGAAATT         ACATCTGAGAAGGAAATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107312 TTGGTCTGGAGCTTGATGAAATTGTA...TAGACATCTGAGAAGGAAATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATAAGTAAAGAACAAGGTAATGTAAAGGCAGCAGGAGCCTCTGATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113087 ATAAGTAAAGAACAAGGTAATGTAAAGGCAGCAGGAGCCTCTGATGTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTCCTGTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113137 TCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTCCTGTGTCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAG         GATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113187 AAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGTA...TAGGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGGCTCCAGTGTATAAACGGGTAATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115147 AAGGCTCCAGTGTATAAACGGGTAATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATTATCACAGAAGAG         ACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 115197 GATTATCACAGAAGAGGTA...CAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAGCAGCAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116404 TAGCAGCAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAGAATATTTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116454 TTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAGAATATTTGCAGGTT...TAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121533 GAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCCCATTTACTTATACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121583 GCCCATTTACTTATACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGATGAACATATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121633 CTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGATGAACATATACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 G         ACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121683 GGTA...CAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACAAACCCCTGTATCCAGTTATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122807 ACAAACCCCTGTATCCAGTTATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGCCTCCCATCATCAATG         GGGATCATTCCAGAATAACAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 122857 ATGCCTCCCATCATCAATGGTG...CAGGGGATCATTCCAGAATAACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AAATACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 124422 AAATACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787         GCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCACCATGTTCAGTGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124472 TA...CAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCACCATGTTCAGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TATTGTGAGAATCAATTTAC         GGTCGAAGCTGCTGAAGTGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125942 TATTGTGAGAATCAATTTACGTA...CAGGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TTTTCCTAATGGAAAATCACATACCTTTCCA         GAATTAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 127207 TTTTCCTAATGGAAAATCACATACCTTTCCAGTA...AAGGAATTAGCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 ACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131309 ACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AG         AGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131359 AGGTA...CAGAGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATCAGATTGAGATTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131634 GTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATCAGATTGAGATTGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131684 TCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GCAGCTATTGCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131734 GCAGCTATTGCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TTACACCATAGCTAATCAA         TTTCCTCTTAATAAGCTCACTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 131784 TTACACCATAGCTAATCAAGTA...CAGTTTCCTCTTAATAAGCTCACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132366 AACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTTGCCCTG         TGCTCCCAAGAAGATATTGCTGATAAACTAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 132416 TTTGCCCTGGTA...CAGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGATAAACTAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136369 TGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CTGAATTTCAG         GTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 136419 CTGAATTTCAGGTA...TAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCCCCTTCCACTGAAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142176 CTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCCCCTTCCACTGAAACTGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 TGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 142226 TGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGGTA...TAGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TAGGTGCAAAAAACTACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155994 TAGGTGCAAAAAACTACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATTATGCAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156044 CCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATTATGCAGTTGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 CGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156094 CGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 AAG         GGCCTGCTTTCTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATTTTT
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 156144 AAGGTA...CAGGGCCTGCTTTCTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATCTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184090 GCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACGTTAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184140 CACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATGTTG

   1900     .    :
   1757 GACCCTTTTTG
        |||||||||||
 184190 GACCCTTTTTG