seq1 = pF1KE5765.tfa, 2949 bp
seq2 = pF1KE5765/gi568815585r_79220624.tfa (gi568815585r:79220624_79505774), 285151 bp

>pF1KE5765 2949
>gi568815585r:79220624_79505774 (Chr13)

(complement)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-190  (126868-126986)   100% ->
191-327  (128260-128396)   100% ->
328-416  (133845-133933)   100% ->
417-634  (134613-134830)   100% ->
635-895  (136785-137045)   100% ->
896-1135  (138903-139142)   100% ->
1136-1276  (139580-139720)   100% ->
1277-1417  (140057-140197)   100% ->
1418-1529  (146089-146200)   100% ->
1530-1689  (147342-147501)   100% ->
1690-1854  (150391-150555)   100% ->
1855-1986  (151205-151336)   100% ->
1987-2112  (160981-161106)   100% ->
2113-2187  (161453-161527)   100% ->
2188-2355  (162944-163111)   100% ->
2356-2460  (164548-164652)   100% ->
2461-2661  (168473-168673)   100% ->
2662-2748  (171345-171431)   100% ->
2749-2862  (183313-183426)   100% ->
2863-2949  (185065-185151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTTCTAAAATGATCATTGAAAACTTCGAGGCACTCAAGTCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTTCTAAAATGATCATTGAAAACTTCGAGGCACTCAAGTCCTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCAAGACTCTCGAGCCCAT         CTGTGATGCAGATCCATCCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 CAGCAAGACTCTCGAGCCCATGTG...TAGCTGTGATGCAGATCCATCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCTAGCAAAATATGTTCTGGCTTTGGTAAAGAAAGACAAAAGTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126888 CCCTAGCAAAATATGTTCTGGCTTTGGTAAAGAAAGACAAAAGTGAAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGTTAAAGGCATTATGTATTGATCAGCTGGATGTATTTCTTCAGAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 126938 GAGTTAAAGGCATTATGTATTGATCAGCTGGATGTATTTCTTCAGAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         AGACACAGATATTTGTGGAAAAACTTTTTGATGCTGTGAATA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126988 TA...TAGAGACACAGATATTTGTGGAAAAACTTTTTGATGCTGTGAATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAAGAGTTACCTACCTCCTCCAGAGCAGCCATCATCAGGAAGCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128302 CAAAGAGTTACCTACCTCCTCCAGAGCAGCCATCATCAGGAAGCCTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTAGAATTTTTTCCACACCAAGAAAAAGATATAAAGAAGGAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 128352 GTAGAATTTTTTCCACACCAAGAAAAAGATATAAAGAAGGAAGAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     ATCACTAAGGAGGAAGAGCGAGAGAAGAAGTTTTCTAGAAGGCTAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128402 .CAGATCACTAAGGAGGAAGAGCGAGAGAAGAAGTTTTCTAGAAGGCTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCACAGTCCTCCCCAGTCAAGCTCCCGATACAGGGAAAATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 133891 ATCACAGTCCTCCCCAGTCAAGCTCCCGATACAGGGAAAATAGGTG...T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    417   AAGCCGTGATGAGAGGAAAAAAGATGATCGTTCTCGCAAAAGAGATTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134611 AGAAGCCGTGATGAGAGGAAAAAAGATGATCGTTCTCGCAAAAGAGATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGATCGAAACCCTCCTCGAAGAGATTCATACAGAGACCGGTACAATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134661 TGATCGAAACCCTCCTCGAAGAGATTCATACAGAGACCGGTACAATAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GACGAGGGCGGAGTCGCAGTTATAGCAGGAGTCGAAGTCGAAGTTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134711 GACGAGGGCGGAGTCGCAGTTATAGCAGGAGTCGAAGTCGAAGTTGGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGAGAGGCTTCGTGAGAGGGACAGAGATAGAAGCAGGACTAGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134761 AAAGAGAGGCTTCGTGAGAGGGACAGAGATAGAAGCAGGACTAGAAGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAGCAGAACACGAAGCAGGG         AAAGGGATCTGGTAAAACCTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 134811 AAGCAGAACACGAAGCAGGGGTA...CAGAAAGGGATCTGGTAAAACCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AATATGACCTGGATAGAACAGATCCATTAGAAAATAATTATACTCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136806 AATATGACCTGGATAGAACAGATCCATTAGAAAATAATTATACTCCAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTTCGGTACCTAGTATTTCATCTGGCCACTACCCTGTACCTACTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136856 TCTTCGGTACCTAGTATTTCATCTGGCCACTACCCTGTACCTACTTTGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGCACTATTACAGTAATTGCTCCTACTCATCATGGAAACAACACTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136906 CAGCACTATTACAGTAATTGCTCCTACTCATCATGGAAACAACACTACCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAAGTTGGTCTGAATTTCATGAAGACCAAGTGGACCATAACTCTTACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136956 AAAGTTGGTCTGAATTTCATGAAGACCAAGTGGACCATAACTCTTACGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGACCACCCATGCCAAAGAAACGGTGTAGAGACTATGATG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 137006 AGACCACCCATGCCAAAGAAACGGTGTAGAGACTATGATGGTA...TAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAAGGGTTTTTGTATGAGAGGAGACATGTGTCCTTTTGATCATGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138904 AAAGGGTTTTTGTATGAGAGGAGACATGTGTCCTTTTGATCATGGAAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATCCAGTAGTTGTAGAAGATGTGAATCTTCCTGGTATGCTGCCTTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138954 ATCCAGTAGTTGTAGAAGATGTGAATCTTCCTGGTATGCTGCCTTTCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCACAGCCTCCTGTTGTTGAAGGACCACCTCCTCCTGGACTCCCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139004 GCACAGCCTCCTGTTGTTGAAGGACCACCTCCTCCTGGACTCCCCCCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCCACCAATTCTTACACCCCCACCTGTGAATCTCAGGCCCCCAGTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139054 TCCACCAATTCTTACACCCCCACCTGTGAATCTCAGGCCCCCAGTACCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGCCAGGTCCATTGCCACCCAGTCTCCCACCTGTTACAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 139104 CGCCAGGTCCATTGCCACCCAGTCTCCCACCTGTTACAGGTA...CAGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCACCACCTCCACTTCCTCCTTTGCAGCCATCTGGCATGGATGCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139582 CCACCACCTCCACTTCCTCCTTTGCAGCCATCTGGCATGGATGCTCCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AAACTCTGCAACCAGTTCTGTTCCTACTGTAGTAACAACTGGCATTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139632 AAACTCTGCAACCAGTTCTGTTCCTACTGTAGTAACAACTGGCATTCATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACCAGCCTCCTCCTGCTCCACCCTCTCTTTTTACTGCAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 139682 ACCAGCCTCCTCCTGCTCCACCCTCTCTTTTTACTGCAGGTG...CAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACATATGACACAGATGGCTACAATCCTGAAGCCCCAAGCATAACAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140059 ACATATGACACAGATGGCTACAATCCTGAAGCCCCAAGCATAACAAACAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTCCAGACCTATGTATAGACACAGAGTGCATGCACAAAGGCCCAACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140109 TTCCAGACCTATGTATAGACACAGAGTGCATGCACAAAGGCCCAACTTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TAGGACTAACATCAGGGGATATGGATTTGCCACCCAGAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 140159 TAGGACTAACATCAGGGGATATGGATTTGCCACCCAGAGGTA...CAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AAGCCTCCCAATAAAAGCAGTATGAGGATAGTAGTGGACTCAGAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146091 AAGCCTCCCAATAAAAGCAGTATGAGGATAGTAGTGGACTCAGAATCAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GAAAAGAACCATTGGTTCTGGAGAGCCTGGAGTTCCTACAAAGAAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146141 GAAAAGAACCATTGGTTCTGGAGAGCCTGGAGTTCCTACAAAGAAGACTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GGTTTGATAA         ACCAAATTTTAATAGAACAAACAGCCCAGGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 146191 GGTTTGATAAGTA...CAGACCAAATTTTAATAGAACAAACAGCCCAGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTTCAGAAGAAGGTTCAATTTGGAAATGAAAATACCAAGCTTGAACTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147373 TTTCAGAAGAAGGTTCAATTTGGAAATGAAAATACCAAGCTTGAACTTAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AAAAGTTCCTCCAGAATTAAATAATATCAGCAAACTTAATGAACATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147423 AAAAGTTCCTCCAGAATTAAATAATATCAGCAAACTTAATGAACATTTTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTCGATTTGGAACCTTGGTTAACTTACAG         GTTGCTTATAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 147473 GTCGATTTGGAACCTTGGTTAACTTACAGGTA...TAGGTTGCTTATAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GGTGATCCTGAAGGTGCCCTAATCCAATTTGCAACATACGAAGAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150403 GGTGATCCTGAAGGTGCCCTAATCCAATTTGCAACATACGAAGAAGCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GAAAGCAATATCAAGTACGGAAGCAGTATTAAACAATCGCTTTATTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150453 GAAAGCAATATCAAGTACGGAAGCAGTATTAAACAATCGCTTTATTAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TTTATTGGCACAGAGAAGGAAGCACCCAACAGTTACAAACTACTTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150503 TTTATTGGCACAGAGAAGGAAGCACCCAACAGTTACAAACTACTTCTCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AAG         GTAATGCAGCCTTTAGTCCAGCAGCCCATTTTGCCTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150553 AAGGTA...GAGGTAATGCAGCCTTTAGTCCAGCAGCCCATTTTGCCTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGTGAAGCAGTCAGTCAAAGAGCGGCTGGGTCCAGTACCTTCAAGTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151243 TGTGAAGCAGTCAGTCAAAGAGCGGCTGGGTCCAGTACCTTCAAGTACTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TTGAACCTGCAGAAGCCCAGAGTGCCTCTTCAGACCTTCCTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 151293 TTGAACCTGCAGAAGCCCAGAGTGCCTCTTCAGACCTTCCTCAGGTA...

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1987    GTGTTGTCTACATCTACTGGCCTAACAAAAACAGTGTATAATCCAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160978 TAGGTGTTGTCTACATCTACTGGCCTAACAAAAACAGTGTATAATCCAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TGCTTTGAAGGCTGCACAGAAAACCTTACTTGTTTCCACCTCTGCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161028 TGCTTTGAAGGCTGCACAGAAAACCTTACTTGTTTCCACCTCTGCAGTTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 ATAATAATGAAGCACAGAAAAAAAAACAG         GAGGCATTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 161078 ATAATAATGAAGCACAGAAAAAAAAACAGGTA...TAGGAGGCATTGAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CTTCAGCAGGATGTAAGGAAAAGGAAACAAGAAATTTTAGAAAAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161465 CTTCAGCAGGATGTAAGGAAAAGGAAACAAGAAATTTTAGAAAAGCACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGAAACACAGAAG         ATGTTAATTTCAAAACTGGAGAAAAACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 161515 TGAAACACAGAAGGTA...CAGATGTTAATTTCAAAACTGGAGAAAAACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 AAACAATGAAGTCTGAAGATAAAGCAGAAATAATGAAAACTTTAGAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162972 AAACAATGAAGTCTGAAGATAAAGCAGAAATAATGAAAACTTTAGAGGTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TTGACAAAAAATATTACCAAGTTGAAAGATGAGGTCAAAGCTGCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163022 TTGACAAAAAATATTACCAAGTTGAAAGATGAGGTCAAAGCTGCTTCTCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TGGACGCTGTCTTCCAAAAAGTATAAAAACCAAGACTCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 163072 TGGACGCTGTCTTCCAAAAAGTATAAAAACCAAGACTCAGGTA...TAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TGCAGAAGGAATTACTTGACACAGAACTGGATTTATATAAGAAGATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164549 TGCAGAAGGAATTACTTGACACAGAACTGGATTTATATAAGAAGATGCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GCTGGAGAAGAAGTCACTGAACTTAGGAGAAAGTATACAGAATTACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164599 GCTGGAGAAGAAGTCACTGAACTTAGGAGAAAGTATACAGAATTACAGCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GGAA         GCTGCCAAACGAGGGATTCTTTCATCTGGTCGGGGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164649 GGAAGTA...TAGGCTGCCAAACGAGGGATTCTTTCATCTGGTCGGGGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GAGGAATTCATTCAAGAGGTCGAGGTGCAGTTCATGGCCGAGGCAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168510 GAGGAATTCATTCAAGAGGTCGAGGTGCAGTTCATGGCCGAGGCAGGGGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 CGAGGGCGAGGGCGAGGTGTGCCTGGTCATGCTGTGGTGGATCACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168560 CGAGGGCGAGGGCGAGGTGTGCCTGGTCATGCTGTGGTGGATCACCGTCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CAGGGCATTGGAGATTTCTGCATTTACGGAGAGCGATAGAGAAGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168610 CAGGGCATTGGAGATTTCTGCATTTACGGAGAGCGATAGAGAAGATCTTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TTCCTCATTTTGCG         CAATATGGTGAAATTGAAGATTGTCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 168660 TTCCTCATTTTGCGGTA...AAGCAATATGGTGAAATTGAAGATTGTCAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 ATTGATGATTCCTCACTTCATGCAGTAATTACATTCAAGACAAGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171372 ATTGATGATTCCTCACTTCATGCAGTAATTACATTCAAGACAAGAGCAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 AGCTGAAGCA         GCTGCAGTTCATGGAGCTCGTTTCAAAGGGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 171422 AGCTGAAGCAGTA...TAGGCTGCAGTTCATGGAGCTCGTTTCAAAGGGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 AAGATCTAAAACTGGCATGGAATAAACCAGTAACTAATATTTCAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183344 AAGATCTAAAACTGGCATGGAATAAACCAGTAACTAATATTTCAGCTGTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GAAACAGAAGAAGTTGAGCCTGATGAAGAAGAA         TTTCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 183394 GAAACAGAAGAAGTTGAGCCTGATGAAGAAGAAGTA...AAGTTTCAGGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 AGAGTCTTTGGTGGATGACTCATTACTTCAAGATGATGATGAAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185073 AGAGTCTTTGGTGGATGACTCATTACTTCAAGATGATGATGAAGAAGAAG

   3100     .    :    .    :    .
   2921 AGGACAATGAATCTCGTTCTTGGAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 185123 AGGACAATGAATCTCGTTCTTGGAGAAGA