seq1 = pF1KE5761.tfa, 2433 bp
seq2 = pF1KE5761/gi568815576r_31339883.tfa (gi568815576r:31339883_31588718), 248836 bp

>pF1KE5761 2433
>gi568815576r:31339883_31588718 (Chr22)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-170  (116802-116875)   100% ->
171-298  (120417-120544)   100% ->
299-474  (130069-130244)   100% ->
475-610  (132732-132867)   100% ->
611-790  (133404-133583)   100% ->
791-987  (134343-134539)   100% ->
988-1059  (138359-138430)   100% ->
1060-1243  (139188-139371)   100% ->
1244-1323  (140487-140566)   100% ->
1324-1466  (141151-141293)   100% ->
1467-1551  (144029-144113)   100% ->
1552-1684  (145625-145757)   100% ->
1685-2029  (146601-146945)   99% ->
2030-2194  (147851-148015)   100% ->
2195-2433  (148598-148836)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAGGAGAAGTATGGGTGAAACAGAAAGTGGAGATGCTTTCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAGGAGAAGTATGGGTGAAACAGAAAGTGGAGATGCTTTCCTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGAAGAAGCCTCCTGCCTCCAAATGCCCCCATCGCTATACAAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 CCTGAAGAAGCCTCCTGCCTCCAAATGCCCCCATCGCTATACAAAAGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GAAGAACTCTTGGATATAAAAGAACTCCCCCATTCCAAACAGAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..TAGGAAGAACTCTTGGATATAAAAGAACTCCCCCATTCCAAACAGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTTCATGCCTTTCTGAAAAATATGACAG         TGATGGTGTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 116847 CCTTCATGCCTTTCTGAAAAATATGACAGGTA...TAGTGATGGTGTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACCCTGAGAAGTGGCATGCCTCTCTCTACCCAGCTTCAGGGCGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120429 GGACCCTGAGAAGTGGCATGCCTCTCTCTACCCAGCTTCAGGGCGGAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACCAGTGGAAAGTCTGAAGAAAGAGTTGGATACAGACCGGCCTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120479 CACCAGTGGAAAGTCTGAAGAAAGAGTTGGATACAGACCGGCCTTCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCGCAGGATAGTAG         GTATAGTAGAGTGCAATGGAGGAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 120529 GTGCGCAGGATAGTAGGTG...CAGGTATAGTAGAGTGCAATGGAGGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCCGAAGAGGATGAAGTGGAGGTCATCCTTGCACAGGAGCCTGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130094 GGCCGAAGAGGATGAAGTGGAGGTCATCCTTGCACAGGAGCCTGCGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCAGGAAGTGCCAAGGGATGCTGTCTTGCCTGAGCAGTCCCCAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130144 ATCAGGAAGTGCCAAGGGATGCTGTCTTGCCTGAGCAGTCCCCAGGAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTTGACTTTAATGAGTTCTTTAACCTTGATAAGGTGCCATGCTTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130194 TTTGACTTTAATGAGTTCTTTAACCTTGATAAGGTGCCATGCTTGGCTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 G         ATGATAGAAGATGTTTTGGGAGAAGGGTCAGTCTCTGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130244 GGTG...CAGATGATAGAAGATGTTTTGGGAGAAGGGTCAGTCTCTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTCGGTTCAGTAGGTGGTTCTCTAACCCGAGCAGATCAGGAAGCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132772 GTCGGTTCAGTAGGTGGTTCTCTAACCCGAGCAGATCAGGAAGCCGATCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCAGTCTTGGGTCAACACCACATGAAGAGCTAGAGAGACTTGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 132822 AGCAGTCTTGGGTCAACACCACATGAAGAGCTAGAGAGACTTGCAGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    611      GTCTGGAGCAAGCCATCCTCTCTCCTGGACAGAACTCGGGGAATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132872 ..CAGGTCTGGAGCAAGCCATCCTCTCTCCTGGACAGAACTCGGGGAATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACTTTGCTCCTATACCATTGGAAGACCATGCTGAAAATAAAGTGGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133449 ACTTTGCTCCTATACCATTGGAAGACCATGCTGAAAATAAAGTGGATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTAGAAATGCTACAGAAAGCCAAAGTGGATTTGAAACCTCTTCTTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133499 TTAGAAATGCTACAGAAAGCCAAAGTGGATTTGAAACCTCTTCTTTCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTTTCTGCAAATAAAGAAAAACTTAAAGAAAGCT         CACATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 133549 CCTTTCTGCAAATAAAGAAAAACTTAAAGAAAGCTGTA...CAGCACATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAGGGGTTGTGCTTTCAGTGGAGGAGGTAGAAGCAGGTCTGAAGGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134349 CAGGGGTTGTGCTTTCAGTGGAGGAGGTAGAAGCAGGTCTGAAGGGCTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGGTTGACCAGCAAGTGAAGAATTCAACTCCCTTCATGGCAGAACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134399 AAGGTTGACCAGCAAGTGAAGAATTCAACTCCCTTCATGGCAGAACACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAAGAGACCTTGAGTGCCGTAACCAACAATCGACAACTGAAGAAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134449 AGAAGAGACCTTGAGTGCCGTAACCAACAATCGACAACTGAAGAAAGACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAGACATGACTGCGTTCAACAAGCTAGTGAGCACAATGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 134499 GAGACATGACTGCGTTCAACAAGCTAGTGAGCACAATGAAGGCA...TAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGAAACCTTGAAAGCCATTTGATGTCCCCTGCTGAGATTCCAGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138359 CGAAACCTTGAAAGCCATTTGATGTCCCCTGCTGAGATTCCAGGCCAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGTCCCTAAGAACATCCTGCAG         GAACTTCTGGGTCAACCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 138409 TGTCCCTAAGAACATCCTGCAGGTA...TAGGAACTTCTGGGTCAACCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTCAGAGACCTGCTTCTTCCAATCTTCTGAGTGGCCTTATGGGGAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139207 TTCAGAGACCTGCTTCTTCCAATCTTCTGAGTGGCCTTATGGGGAGCTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAGCCTACAACATCTTTACTGGGCCAAAGAGCACCCTCTCCTCCCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139257 GAGCCTACAACATCTTTACTGGGCCAAAGAGCACCCTCTCCTCCCTTGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACAGGTGTTTCAAACTCGAGCAGCCTCAGCTGACTACCTTCGCCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139307 ACAGGTGTTTCAAACTCGAGCAGCCTCAGCTGACTACCTTCGCCCAAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TACCATCACCAATTG         GTTTCACACCAGGACCACAGCAGCTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 139357 TACCATCACCAATTGGTA...CAGGTTTCACACCAGGACCACAGCAGCTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTCGGAGATCCATTCCAAGGCATGCGCAAACCCATGAGCCCCATCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140513 CTCGGAGATCCATTCCAAGGCATGCGCAAACCCATGAGCCCCATCACAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCAG         CAGATGAGCCAGCTGGAGTTGCAACAGGCAGCTTTAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140563 CCAGGTC...CAGCAGATGAGCCAGCTGGAGTTGCAACAGGCAGCTTTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AAGGGCTGGCCTTGCCACATGACCTTGCTGTACAGGCAGCAAACTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141188 AAGGGCTGGCCTTGCCACATGACCTTGCTGTACAGGCAGCAAACTTCTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CAGCCTGGTTTTGGCAAACCACAGGTGGACAGAACCAGAGATGGATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141238 CAGCCTGGTTTTGGCAAACCACAGGTGGACAGAACCAGAGATGGATTCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AAACAG         GCAACAGCGAGTGACCAAGTCACCAGCACCCGTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141288 AAACAGGTA...CAGGCAACAGCGAGTGACCAAGTCACCAGCACCCGTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ATCGAGGGAATTCCTCTTCCCCTGCCCCTGCTGCCTCCATCACAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144064 ATCGAGGGAATTCCTCTTCCCCTGCCCCTGCTGCCTCCATCACAAGCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552          CTTTCTCCTTCCTTTACCCCTACCTCAGTGATTCGTAAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144114 GTC...CAGCTTTCTCCTTCCTTTACCCCTACCTCAGTGATTCGTAAGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GTACGAGAGCAAAGAGAAAAGCAAGGAGGAGCCAGCATCTGGAAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145666 GTACGAGAGCAAAGAGAAAAGCAAGGAGGAGCCAGCATCTGGAAAAGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTCTTGGTGACAGTAAAGAGGATACTCAGAAGGCCAGTGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 145716 CTCTTGGTGACAGTAAAGAGGATACTCAGAAGGCCAGTGAAGGTA...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1685  AAAACCTCCTGTCATCCAGTTCTGTACCCAGTGCCGATCGAGACTCTTC
        >||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 146600 GAAAACCTCCTGTCATCCAGCTCTGTACCCAGTGCCGATCGAGACTCTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCCCACTACAAATTCCAAACTGTCAGCATTACAGAGGTCTTCGTGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146650 TCCCACTACAAATTCCAAACTGTCAGCATTACAGAGGTCTTCGTGTTCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CCCCACTGTCCCAGGCCAACCGTTACACCAAAGAACAAGATTATCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146700 CCCCACTGTCCCAGGCCAACCGTTACACCAAAGAACAAGATTATCGACCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AAAGCAACTGGGAGAAAAACACCCACCTTGGCATCCCCAGTTCCTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146750 AAAGCAACTGGGAGAAAAACACCCACCTTGGCATCCCCAGTTCCTACAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 ACCTTTTCTCCGCCCTGTCCACCAAGTTCCCCTTGTCCCCCATGTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146800 ACCTTTTCTCCGCCCTGTCCACCAAGTTCCCCTTGTCCCCCATGTCCCTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TGGTTAGGCCTGCTCACCAGCTTCACCCAGGGTTGGTACAGAGGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146850 TGGTTAGGCCTGCTCACCAGCTTCACCCAGGGTTGGTACAGAGGATGCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GCCCAGGGAGTACATCCACAGCATCTTCCAAGTTTGCTCCAAACTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 146900 GCCCAGGGAGTACATCCACAGCATCTTCCAAGTTTGCTCCAAACTGGTG.

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030      GTGTGCTTCCTCCTGGGATGGACTTGAGTCATTTACAGGGAATAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146950 ..CAGGTGTGCTTCCTCCTGGGATGGACTTGAGTCATTTACAGGGAATAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CTGGCCCCATCCTGGGTCAGCCCTTTTACCCTTTACCTGCTGCTAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147896 CTGGCCCCATCCTGGGTCAGCCCTTTTACCCTTTACCTGCTGCTAGTCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CCTCTCTTAAACCCTCGTCCTGGAACACCTCTGCATCTGGCAATGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147946 CCTCTCTTAAACCCTCGTCCTGGAACACCTCTGCATCTGGCAATGGTGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 ACAGCAGCTACAGCGCTCAG         TTCTGCATCCTCCAGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 147996 ACAGCAGCTACAGCGCTCAGGTA...CAGTTCTGCATCCTCCAGGCTCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GTTCCCATGCAGCAGCTGTCAGCGTTCAGACAACCCCTCAGAACGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148619 GTTCCCATGCAGCAGCTGTCAGCGTTCAGACAACCCCTCAGAACGTGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AGCCGGTCAGGCCTGCCCCACATGCACTCCCAGCTGGAGCATCGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148669 AGCCGGTCAGGCCTGCCCCACATGCACTCCCAGCTGGAGCATCGCCCCAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CCAGAGGAGCAGCTCCCCTGTGGGCCTTGCCAAATGGTTTGGCTCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148719 CCAGAGGAGCAGCTCCCCTGTGGGCCTTGCCAAATGGTTTGGCTCAGATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TGCTACAGCAACCCCTGCCCTCCATGCCCGCCAAAGTTATCAGTGTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148769 TGCTACAGCAACCCCTGCCCTCCATGCCCGCCAAAGTTATCAGTGTAGAT

   2550     .    :    .
   2416 GAATTGGAATACCGACAG
        ||||||||||||||||||
 148819 GAATTGGAATACCGACAG