seq1 = pF1KE5753.tfa, 2175 bp
seq2 = pF1KE5753/gi568815588r_73398632.tfa (gi568815588r:73398632_73617689), 219058 bp

>pF1KE5753 2175
>gi568815588r:73398632_73617689 (Chr10)

(complement)

1-1315  (100001-101315)   100% ->
1316-1434  (112264-112382)   100% ->
1435-1618  (116852-117035)   99% ->
1619-2175  (118502-119058)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATACAGAGTTTGGGGCCAGTTCTTTCTTCCATTCACCTGCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATACAGAGTTTGGGGCCAGTTCTTTCTTCCATTCACCTGCTTCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATGAGTCACACTCATCACTATCTCCAGAGTCATCTGCCCCACAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCATGAGTCACACTCATCACTATCTCCAGAGTCATCTGCCCCACAGCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCCCCAGTAGATCTGCCTTGAAGCTTCTGACTTCGGTTGAAGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCCCCAGTAGATCTGCCTTGAAGCTTCTGACTTCGGTTGAAGTAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACATTGAACCCTCTGCATTCCACAGGCAAGGTTTACCTAAAGCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACATTGAACCCTCTGCATTCCACAGGCAAGGTTTACCTAAAGCACCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGGACTGAGAAGAATTCTCATCATAGTTGGGAGCCATTGGATGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGGACTGAGAAGAATTCTCATCATAGTTGGGAGCCATTGGATGCCCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGTAAGCTGCAAGGCTCTAGGTGTGACAACAGCAGTTGCAGCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGGTAAGCTGCAAGGCTCTAGGTGTGACAACAGCAGTTGCAGCAAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTCCACAAGAAGGAAGAGGCATTGCTCAAGAACAGCTGTTCCAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTCCACAAGAAGGAAGAGGCATTGCTCAAGAACAGCTGTTCCAAGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGATCCTGCTAACCCCTCCCCGGTGATGCCTGGAATAGCCACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGGATCCTGCTAACCCCTCCCCGGTGATGCCTGGAATAGCCACCTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAGGGGTGATGAACACAGCCTAGGCTGTAGTCCTTCAAATTCATCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAGGGGTGATGAACACAGCCTAGGCTGTAGTCCTTCAAATTCATCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCCCAGCCTTCCCCTGTATAGAACCTGCCACCCCATAATGCCTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCCCAGCCTTCCCCTGTATAGAACCTGCCACCCCATAATGCCTGTTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCTTCATTTGTGCTTCACTGTCCTGATCCTGTGCAGAAAACTAACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCTTCATTTGTGCTTCACTGTCCTGATCCTGTGCAGAAAACTAACCAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTCCAAGGCCAAAGCCTCAAAACTTCATTGACTTTAAAAGTGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTCCAAGGCCAAAGCCTCAAAACTTCATTGACTTTAAAAGTGGACAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCAGTGAGGAGACCTATAGGCCAGAGTTTCCCAGCACAAAGGGGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCAGTGAGGAGACCTATAGGCCAGAGTTTCCCAGCACAAAGGGGCTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGTTCTCTGGCTGAGCAGTTCCAGAGGATGCAGGGTGTCTCCATGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGTTCTCTGGCTGAGCAGTTCCAGAGGATGCAGGGTGTCTCCATGAGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATAGTACAGGTTTCAAGGATAGAAGTTTGTCAGGTAGTCTAAGGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATAGTACAGGTTTCAAGGATAGAAGTTTGTCAGGTAGTCTAAGGAAGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTTCCCCTTCTGATTCTAAGCCTCCTTTCTCACAGGGTCAAGAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTTCCCCTTCTGATTCTAAGCCTCCTTTCTCACAGGGTCAAGAGAAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACTGGCCATGGGCAAAGCAACAATCCTCTCTGGAGGGTGGGGATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACTGGCCATGGGCAAAGCAACAATCCTCTCTGGAGGGTGGGGATAGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACTTTCCTGGGAAGAGTCCACTGAACATTCTTCTCTTGCCTTAAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACTTTCCTGGGAAGAGTCCACTGAACATTCTTCTCTTGCCTTAAACTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGCTGCCTAATGGTGAAACTTCTAGCGGAGGACAGCCCAGGTTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGCTGCCTAATGGTGAAACTTCTAGCGGAGGACAGCCCAGGTTGGCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCAGACATATACCAAGAGAAGCTGTCCCAAGTGAGAGATGTTAGGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCAGACATATACCAAGAGAAGCTGTCCCAAGTGAGAGATGTTAGGTCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGATCTGGGCAGCAGTACTGACTTGGGGACTTCCTTGCCTTTGGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGATCTGGGCAGCAGTACTGACTTGGGGACTTCCTTGCCTTTGGATTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGGGTGAATATCACAAGGTTCTGTGATTCTCAGCTTAAGCATGGGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGGGTGAATATCACAAGGTTCTGTGATTCTCAGCTTAAGCATGGGGCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TAGGCCAGGAATGAAGTCCTCCCCTCATGATTCCCATACGTGTGTAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TAGGCCAGGAATGAAGTCCTCCCCTCATGATTCCCATACGTGTGTAACCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATCCAGAGAGAAATCACATCCTTTTGCATCCACATTGGAACCAAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATCCAGAGAGAAATCACATCCTTTTGCATCCACATTGGAACCAAGACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGCAGGAGACCTCAGAATTGGAGTCTCTGTATCAGGCCAGTCTTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAGCAGGAGACCTCAGAATTGGAGTCTCTGTATCAGGCCAGTCTTCAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTCTCAAGCTGGCTGTTCTGGATGGGGGCAGCAGGATACCGCCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTCTCAAGCTGGCTGTTCTGGATGGGGGCAGCAGGATACCGCCTGGCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CACTTAGCCAAACAG         GCTCTGCAGATGGCATGGGGAGGAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101301 CACTTAGCCAAACAGGTA...CAGGCTCTGCAGATGGCATGGGGAGGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TTGCACTCAGCCCATGATCCTGGTCTCTCAAAGACTTCAACAGCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112290 TTGCACTCAGCCCATGATCCTGGTCTCTCAAAGACTTCAACAGCAGAAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GGAGCATGGTCTCCATGAAGCCAGAACAGTGCGTACTTCTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112340 GGAGCATGGTCTCCATGAAGCCAGAACAGTGCGTACTTCTCAGGTA...A

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1435   CATTCATCAAACGTGAGGAAGCCTTTGGAAACCGGGCACCGTTGTTCC
        >> |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116850 AGGATTCATCAAACGTGAGGAAGCCTTTGGAAACCGGGCACCGTTGTTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AGCTCCTCTTCCCTCCCTGTCATCCATGACCCTTCTGTGTTTCTCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116900 AGCTCCTCTTCCCTCCCTGTCATCCATGACCCTTCTGTGTTTCTCCTCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TCCCCAACTCTACCTTCCCCAACCACAGTTCCTGTCCCCAGATGTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116950 TCCCCAACTCTACCTTCCCCAACCACAGTTCCTGTCCCCAGATGTCCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TGCCCACCATGGCAGGGGAGCCCAATAGACTCCCAG         GAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 117000 TGCCCACCATGGCAGGGGAGCCCAATAGACTCCCAGGTA...CAGGAACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 TCAAGGAGTGTCCAGCAGTTTCTGGCTATGTGTGACAGGGGTGAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118507 TCAAGGAGTGTCCAGCAGTTTCTGGCTATGTGTGACAGGGGTGAAACTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CCAAGGGGCCAAGTACACAGGAAGGACTTTGAACTACCAGAGCCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118557 CCAAGGGGCCAAGTACACAGGAAGGACTTTGAACTACCAGAGCCTCCCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 ATCGCTCCAGAACAGACAACTCCTGGGCACCCTGGTCAGAGACCAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118607 ATCGCTCCAGAACAGACAACTCCTGGGCACCCTGGTCAGAGACCAACCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CATATTGGGACCAGATTCCTGACTACTCCAGGGTGCAATCCTCAACTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118657 CATATTGGGACCAGATTCCTGACTACTCCAGGGTGCAATCCTCAACTAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CTACACTGCCACACTACCAGAAAGAAGCAAGGGCCTTCAGGTTCCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118707 CTACACTGCCACACTACCAGAAAGAAGCAAGGGCCTTCAGGTTCCTCACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 CTCAGTCCTGGAGTGATCTTTTCCATTCACCCTCCCACCCTCCCATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118757 CTCAGTCCTGGAGTGATCTTTTCCATTCACCCTCCCACCCTCCCATTGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 CATCCTGTGTACCCACCATCTAGCAGTCTTCATGTACCCCTGAGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118807 CATCCTGTGTACCCACCATCTAGCAGTCTTCATGTACCCCTGAGGTCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 TTGGAATTCAGATCCTGTTCCAGGGTCCCGAACCCCTGGTCCTCGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118857 TTGGAATTCAGATCCTGTTCCAGGGTCCCGAACCCCTGGTCCTCGAAGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 TAGATATGCCCCCAGATGATGACTGGAGGCAAAGCAGTTATGCCTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118907 TAGATATGCCCCCAGATGATGACTGGAGGCAAAGCAGTTATGCCTCCCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 TCTGGACACAGGAGAACAGTGGGAGAGGGGTTTCTGTTTGTTCTATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118957 TCTGGACACAGGAGAACAGTGGGAGAGGGGTTTCTGTTTGTTCTATCAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2124 TGCTCCCAGAAGAGAGCAGATCAGGGCTAGAGTCCTGCAGCACAGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119007 TGCTCCCAGAAGAGAGCAGATCAGGGCTAGAGTCCTGCAGCACAGTCAAT

   2200 
   2174 GG
        ||
 119057 GG