seq1 = pF1KE5749.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KE5749/gi568815581r_7491833.tfa (gi568815581r:7491833_7714532), 222700 bp

>pF1KE5749 2019
>gi568815581r:7491833_7714532 (Chr17)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-134  (108384-108436)   100% ->
135-228  (108795-108888)   100% ->
229-300  (110453-110524)   100% ->
301-449  (110628-110776)   100% ->
450-543  (111531-111624)   100% ->
544-660  (113008-113124)   100% ->
661-831  (118539-118709)   100% ->
832-910  (119776-119854)   100% ->
911-1020  (120186-120295)   100% ->
1021-1107  (120529-120615)   100% ->
1108-1330  (120908-121130)   100% ->
1331-1528  (121352-121549)   100% ->
1529-1729  (121639-121839)   100% ->
1730-1825  (121934-122029)   100% ->
1826-1926  (122179-122279)   100% ->
1927-2019  (122608-122700)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGGCCTGGCCTCTGGGGGGGATGTGGAGCCGGGACTGCCCGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGGCCTGGCCTCTGGGGGGGATGTGGAGCCGGGACTGCCCGTCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGCGCGGCTCCAACGGGGCCTTCTACAAG         GGCTTTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 GGTGCGCGGCTCCAACGGGGCCTTCTACAAGGTG...TAGGGCTTTGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGATGTCCATGAAGACTCTGTCACCATCTTCTTTGAAAACAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108394 AGGATGTCCATGAAGACTCTGTCACCATCTTCTTTGAAAACAAGTA...T

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    135   CTGGCAGAGTGAGAGACAAATTCCTTTTGGGGATGTCCGGCTACCACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108793 AGCTGGCAGAGTGAGAGACAAATTCCTTTTGGGGATGTCCGGCTACCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCAGCTGACTATAATAAGGAGATCACAGAAGGGGATGAAGTGGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108843 TCCAGCTGACTATAATAAGGAGATCACAGAAGGGGATGAAGTGGAGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    229      GTTTATTCTCGAGCCAATGAACAGGAACCTTGTGGCTGGTGGCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108893 ..TAGGTTTATTCTCGAGCCAATGAACAGGAACCTTGTGGCTGGTGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCCGGGTGCGGATGATGAAGGGAGAT         TTCTATGTCATTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 110498 GCCCGGGTGCGGATGATGAAGGGAGATGTG...CAGTTCTATGTCATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATATGCTGCCTGTGATGCCACCTACAATGAAATTGTTACCCTGGAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110642 ATATGCTGCCTGTGATGCCACCTACAATGAAATTGTTACCCTGGAGCGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTCGGCCAGTTAATCCCAATCCCCTTGCAACCAAAGGCAGCTTCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110692 TTCGGCCAGTTAATCCCAATCCCCTTGCAACCAAAGGCAGCTTCTTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTTACCATGGCTGTGCCCGAGGATCTGAGAGAAGC         CTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110742 GTTACCATGGCTGTGCCCGAGGATCTGAGAGAAGCGTG...CAGCTGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAATGAAAACGTCCATAAAGAGTTCAAGAAAGCCCTGGGAGCCAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111537 CAATGAAAACGTCCATAAAGAGTTCAAGAAAGCCCTGGGAGCCAACTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTTTCTCAACATCACAAACAGTGAGCTCTTCATTCTG         TCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111587 TCTTTCTCAACATCACAAACAGTGAGCTCTTCATTCTGGTG...CAGTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACCACAGAAGCCCCTGTGAAGCGAGCATCTCTGCTGGGTGATATGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113011 ACCACAGAAGCCCCTGTGAAGCGAGCATCTCTGCTGGGTGATATGCATTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CCGAAGCCTGCGCACCAAACTGCTACTTATGTCCCGCAATGAAGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113061 CCGAAGCCTGCGCACCAAACTGCTACTTATGTCCCGCAATGAAGAAGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCAAGCACCTAGAG         ACAAGCAAGCAGTTGGCAGCAGCCTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 113111 CCAAGCACCTAGAGGTA...CAGACAAGCAAGCAGTTGGCAGCAGCCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAAGAGGAGTTCACAGTGCGAGAGGACCTGATGGGACTGGCAATTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118566 CAAGAGGAGTTCACAGTGCGAGAGGACCTGATGGGACTGGCAATTGGGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCACGGTGCCAACATCCAGCAGGCCCGAAAAGTACCTGGGGTGACCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118616 TCACGGTGCCAACATCCAGCAGGCCCGAAAAGTACCTGGGGTGACCGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTGAGTTGGGTGAAGAGACCTGCACTTTCCGCATCTATGGGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118666 TTGAGTTGGGTGAAGAGACCTGCACTTTCCGCATCTATGGGGAGGTC...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832    ACTCCCGAGGCTTGCCGACAGGCCCGAAGCTACCTTGAGTTTTCTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119773 TAGACTCCCGAGGCTTGCCGACAGGCCCGAAGCTACCTTGAGTTTTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGACTCAGTGCAAGTGCCCAGGAACCTGGTTG         GCAAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 119823 GGACTCAGTGCAAGTGCCCAGGAACCTGGTTGGTG...CAGGCAAAGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTGGAAAGAACGGGAAAGTGATCCAGGAGATTGTGGATAAATCTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120195 TTGGAAAGAACGGGAAAGTGATCCAGGAGATTGTGGATAAATCTGGTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GTGAGGGTTCGAGTGGAAGGTGATAATGACAAGAAGAACCCCAGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120245 GTGAGGGTTCGAGTGGAAGGTGATAATGACAAGAAGAACCCCAGGGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 G         GGAATGGTTCCCTTCATTTTTGTTGGCACCCGAGAGAACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120295 GGTA...TAGGGAATGGTTCCCTTCATTTTTGTTGGCACCCGAGAGAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCAGCAATGCCCAGGCTTTGCTGGAGTATCACCTCTCCTACCTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120569 TCAGCAATGCCCAGGCTTTGCTGGAGTATCACCTCTCCTACCTGCAGGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1108       GAGGTAGAGCAGCTTCGCTTGGAGAGGCTACAAATTGATGAGCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120619 ...CAGGAGGTAGAGCAGCTTCGCTTGGAGAGGCTACAAATTGATGAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GCTTCGGCAGATTGGGCTGGGCTTTCGCCCTCCTGGGAGTGGGCGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120952 GCTTCGGCAGATTGGGCTGGGCTTTCGCCCTCCTGGGAGTGGGCGGGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GCGGTGGCAGCGACAAGGCTGGATATAGCACTGATGAGAGCTCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121002 GCGGTGGCAGCGACAAGGCTGGATATAGCACTGATGAGAGCTCCTCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCCCTCCATGCGACTCGAACCTATGGGGGCAGCTATGGGGGCCGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121052 TCCCTCCATGCGACTCGAACCTATGGGGGCAGCTATGGGGGCCGTGGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGGCCGGAGGACAGGCGGTCCTGCCTATG         GCCCCAGCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 121102 TGGCCGGAGGACAGGCGGTCCTGCCTATGGTG...CAGGCCCCAGCTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATGTGTCTACAGCTTCAGAGACTGAGTCAGAGAAGAGAGAGGAGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121364 ATGTGTCTACAGCTTCAGAGACTGAGTCAGAGAAGAGAGAGGAGCCCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CGAGCTGGGCCTGGCGACAGGGATCCCCCAACCCGAGGGGAAGAAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121414 CGAGCTGGGCCTGGCGACAGGGATCCCCCAACCCGAGGGGAAGAAAGCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GAGGCGGCCGACTGGGGGCCGGGGTAGGGGACCCCCACCTGCCCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121464 GAGGCGGCCGACTGGGGGCCGGGGTAGGGGACCCCCACCTGCCCCCCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCACTTCGAGATACAATTCTTCATCTATTAGCTCAG         TGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 121514 CCACTTCGAGATACAATTCTTCATCTATTAGCTCAGGTA...CAGTGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAGGATCCAGACAGTAATCCCTACAGCCTATTGGACACGTCTGAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121644 AAGGATCCAGACAGTAATCCCTACAGCCTATTGGACACGTCTGAACCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GCCCCCGGTTGATTCAGAACCTGGGGAACCCCCCCCAGCAAGTGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121694 GCCCCCGGTTGATTCAGAACCTGGGGAACCCCCCCCAGCAAGTGCCAGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GCCGCCGCTCCCGCCGCCGCCGCACTGATGAAGACAGGACCGTCATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121744 GCCGCCGCTCCCGCCGCCGCCGCACTGATGAAGACAGGACCGTCATGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGAGGCCTGGAATCAGATGGGCCCAACATGACAGAGAATGGCCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 121794 GGAGGCCTGGAATCAGATGGGCCCAACATGACAGAGAATGGCCTGGGTG.

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1730      AAGATGAATCAAGACCTCAACGTCGTAATCGCAGCCGCCGCCGCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121844 ..CAGAAGATGAATCAAGACCTCAACGTCGTAATCGCAGCCGCCGCCGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GTAACCGTGGTAATCGGACTGATGGCTCTATCAGTGGAGACCGCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121979 GTAACCGTGGTAATCGGACTGATGGCTCTATCAGTGGAGACCGCCAGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 G         TGACTGTGGCTGACTATATCTCACGAGCAGAGTCTCAGAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122029 GGTC...CAGTGACTGTGGCTGACTATATCTCACGAGCAGAGTCTCAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CCGCCAGAGGCCACCCCTGGAACGCACTAAACCCTCAGAAGACTCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122219 CCGCCAGAGGCCACCCCTGGAACGCACTAAACCCTCAGAAGACTCTCTTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CAGGACAGAAG         GGTGACTCTGTCAGCAAGCTTCCTAAGGGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 122269 CAGGACAGAAGGTA...CAGGGTGACTCTGTCAGCAAGCTTCCTAAGGGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CCCTCGGAGAATGGGGAGCTCTCCGCCCCCTTGGAGTTGGGTAGTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122638 CCCTCGGAGAATGGGGAGCTCTCCGCCCCCTTGGAGTTGGGTAGTATGGT

   2150     .    :
   2007 GAATGGGGTTTCA
        |||||||||||||
 122688 GAATGGGGTTTCA