seq1 = pF1KE5736.tfa, 2496 bp
seq2 = pF1KE5736/gi568815590r_94028243.tfa (gi568815590r:94028243_94294685), 266443 bp

>pF1KE5736 2496
>gi568815590r:94028243_94294685 (Chr8)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-150  (105401-105499)   100% ->
151-285  (116965-117099)   100% ->
286-424  (118007-118145)   99% ->
425-583  (120426-120584)   99% ->
584-783  (120690-120889)   100% ->
784-915  (123701-123832)   100% ->
916-1066  (124139-124289)   100% ->
1067-1282  (128710-128925)   100% ->
1283-1359  (132524-132600)   100% ->
1360-1551  (134524-134715)   100% ->
1552-1796  (142574-142818)   100% ->
1797-1927  (145812-145942)   99% ->
1928-2167  (148519-148758)   99% ->
2168-2284  (163694-163810)   99% ->
2285-2398  (163947-164060)   100% ->
2399-2496  (166346-166443)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATACTTCAGGCCCATCTTCACTCCCTGTGTCTTCTTATGCTTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATACTTCAGGCCCATCTTCACTCCCTGTGTCTTCTTATGCTTTATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GCAACTGGATATGGCCAAGAGGGGAAGTTTAGTGGACCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...CAGGCAACTGGATATGGCCAAGAGGGGAAGTTTAGTGGACCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAACCCATGACATTTTCTATTTATGAAGGCCAAGAACCGAGTCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105441 TGAAACCCATGACATTTTCTATTTATGAAGGCCAAGAACCGAGTCAAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATATTCCAG         TTTAAGGCCAATCCTCCTGCTGTGACTTTTGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105491 ATATTCCAGGTA...CAGTTTAAGGCCAATCCTCCTGCTGTGACTTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTAACTGGGGAGACAGACAACATATTTGTGATAGAACGGGAGGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116997 ACTAACTGGGGAGACAGACAACATATTTGTGATAGAACGGGAGGGACTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTATTACAACAGAGCCTTGGACAGGGAAACAAGATCTACTCACAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117047 TGTATTACAACAGAGCCTTGGACAGGGAAACAAGATCTACTCACAATCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAG         GTTGCAGCCCTGGACGCTAATGGAATTATAGTGGAGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117097 CAGGTA...CAGGTTGCAGCCCTGGACGCTAATGGAATTATAGTGGAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCAGTCCCTATCACCATAGAAGTGAAGGACATCAACGACAATCGACCCA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 118045 TCCAGTCCCTATCACCATAAAAGTGAAGGACATCAACGACAATCGACCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGTTTCTCCAGTCAAAGTACGAAGGCTCAGTAAGGCAGAACTCTCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118095 CGTTTCTCCAGTCAAAGTACGAAGGCTCAGTAAGGCAGAACTCTCGCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 G         GAAAGCCCTTCTTGTATGTCAATGCCACAGACCTGGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118145 GGTA...CAGGAAAGCCCTTCTTGTATGTCAATGCCACAGACCTGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCGGCCACTCCCAATGGCCAGCTTTATTACCAGATTGTCATCCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120466 TCCGGCCACTCCCAATGGCCAGCTTTATTACCAGATTGTCATCCAGCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCATGATCAACAATGTTATGTACTTTCAGATCAACAACAAAACGGGAGCC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 120516 CCATGATCAACAATGTCATGTACTTTCAGATCAACAACAAAACGGGAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCTCTCTTACCCGAGAGG         GATCTCAGGAATTGAATCCTGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 120566 ATCTCTCTTACCCGAGAGGGTA...CAGGATCTCAGGAATTGAATCCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TAAGAATCCTTCCTATAATCTGGTGATCTCAGTGAAGGACATGGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120712 TAAGAATCCTTCCTATAATCTGGTGATCTCAGTGAAGGACATGGGAGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAGTGAGAATTCCTTCAGTGATACCACATCTGTGGATATCATAGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120762 AGAGTGAGAATTCCTTCAGTGATACCACATCTGTGGATATCATAGTGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGAATATTTGGAAAGCACCAAAACCTGTGGAGATGGTGGAAAACTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120812 GAGAATATTTGGAAAGCACCAAAACCTGTGGAGATGGTGGAAAACTCAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATCCTCACCCCATCAAAATCACTCAG         GTGCGGTGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 120862 TGATCCTCACCCCATCAAAATCACTCAGGTA...TAGGTGCGGTGGAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATCCCGGTGCACAATATTCCTTAGTTGACAAAGAGAAGCTGCCAAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123714 ATCCCGGTGCACAATATTCCTTAGTTGACAAAGAGAAGCTGCCAAGATTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCATTTTCAATTGACCAGGAAGGAGATATTTACGTGACTCAGCCCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123764 CCATTTTCAATTGACCAGGAAGGAGATATTTACGTGACTCAGCCCTTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCGAGAAGAAAAGGATGCA         TATGTTTTTTATGCAGTTGCAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 123814 CCGAGAAGAAAAGGATGCAGTG...TAGTATGTTTTTTATGCAGTTGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGGATGAGTACGGAAAACCACTTTCATATCCGCTGGAAATTCATGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124161 AGGATGAGTACGGAAAACCACTTTCATATCCGCTGGAAATTCATGTAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTTAAAGATATTAATGATAATCCACCTACATGTCCGTCACCAGTAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124211 GTTAAAGATATTAATGATAATCCACCTACATGTCCGTCACCAGTAACCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ATTTGAGGTCCAGGAGAATGAACGACTGG         GTAACAGTATCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124261 ATTTGAGGTCCAGGAGAATGAACGACTGGGTA...TAGGTAACAGTATCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGACCCTTACTGCACATGACAGGGATGAAGAAAATACTGCCAACAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128722 GGACCCTTACTGCACATGACAGGGATGAAGAAAATACTGCCAACAGTTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTAAACTACAGGATTGTGGAGCAAACTCCCAAACTTCCCATGGATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128772 CTAAACTACAGGATTGTGGAGCAAACTCCCAAACTTCCCATGGATGGACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTTCCTAATCCAAACCTATGCTGGAATGTTACAGTTAGCTAAACAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128822 CTTCCTAATCCAAACCTATGCTGGAATGTTACAGTTAGCTAAACAGTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGAAGAAGCAAGATACTCCTCAGTACAACTTAACGATAGAGGTGTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128872 TGAAGAAGCAAGATACTCCTCAGTACAACTTAACGATAGAGGTGTCTGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAAG         ATTTCAAGACCCTTTGTTTTGTGCAAATCAACGTTAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128922 AAAGGTT...CAGATTTCAAGACCCTTTGTTTTGTGCAAATCAACGTTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGATATCAATGATCAGATCCCCATCTTTGAAAAATCAGAT         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 132561 TGATATCAATGATCAGATCCCCATCTTTGAAAAATCAGATGTG...TAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATGGAAACCTGACTCTTGCTGAAGACACAAACATTGGGTCCACCATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134525 ATGGAAACCTGACTCTTGCTGAAGACACAAACATTGGGTCCACCATCTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACCATCCAGGCCACTGATGCTGATGAGCCATTTACTGGGAGTTCTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134575 ACCATCCAGGCCACTGATGCTGATGAGCCATTTACTGGGAGTTCTAAAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TCTGTATCATATCATAAAGGGAGACAGTGAGGGACGCCTGGGGGTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134625 TCTGTATCATATCATAAAGGGAGACAGTGAGGGACGCCTGGGGGTTGACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGATCCCCATACCAACACCGGATATGTCATAATTAAAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 134675 CAGATCCCCATACCAACACCGGATATGTCATAATTAAAAAGGTA...CAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCTCTTGATTTTGAAACAGCAGCTGTTTCCAACATTGTGTTCAAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142574 CCTCTTGATTTTGAAACAGCAGCTGTTTCCAACATTGTGTTCAAAGCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AAATCCTGAGCCTCTAGTGTTTGGTGTGAAGTACAATGCAAGTTCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142624 AAATCCTGAGCCTCTAGTGTTTGGTGTGAAGTACAATGCAAGTTCTTTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCAAGTTCACGCTTATTGTGACAGATGTGAATGAAGCACCTCAATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142674 CCAAGTTCACGCTTATTGTGACAGATGTGAATGAAGCACCTCAATTTTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CAACACGTATTCCAAGCGAAAGTCAGTGAGGATGTAGCTATAGGCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142724 CAACACGTATTCCAAGCGAAAGTCAGTGAGGATGTAGCTATAGGCACTAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGTGGGCAATGTGACTGCCAAGGATCCAGAAGGTCTGGACATAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 142774 AGTGGGCAATGTGACTGCCAAGGATCCAGAAGGTCTGGACATAAGGTA..

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797     TTATTCACTGAGGGGAGACACAAGAGGTTGGCTTAAAATTGACCAC
        .>>> |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142824 .AAGCTATTCACTGAGGGGAGACACAAGAGGTTGGCTTAAAATTGACCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GTGACTGGTGAGATCTTTAGTGTGGCTCCATTGGACAGAGAAGCCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145858 GTGACTGGTGAGATCTTTAGTGTGGCTCCATTGGACAGAGAAGCCGGAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TCCATATCGGGTACAAGTGGTGGCCACAGAAGTAG         GGGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 145908 TCCATATCGGGTACAAGTGGTGGCCACAGAAGTAGGTA...TAGGGGGGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CTTCCTTGAGCTCTGTGTCAGAGTTCCACCTGATCCTTATGGATGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148525 CTTCCTTGAGCTCTGTGTCAGAGTTCCACCTGATCCTTATGGATGTGAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GACAACCCTCCCAGGCTAGCCAAGGACTACACGGGCTTGTTCTTCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148575 GACAACCCTCCCAGGCTAGCCAAGGACTACACGGGCTTGTTCTTCTGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TCCCCTCAGTGCACCTGGAAGTCTCATTTTTGAGGCTACTGATGATGATC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 148625 TCCCCTCAGTGCACCTGGAAGTCTCATTTTCGAGGCTACTGATGATGATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AGCACTTATTTCGGGGTCCCCATTTTACATTTTCCCTCGGCAGTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148675 AGCACTTATTTCGGGGTCCCCATTTTACATTTTCCCTCGGCAGTGGAAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 TTACAAAACGACTGGGAAGTTTCCAAAATCAATG         GTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 148725 TTACAAAACGACTGGGAAGTTTCCAAAATCAATGGTG...CAGGTACTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGCCCGACTGTCTACCAGGCACACAGACTTTGAGGAGAGGGAGTATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 163701 TGCCCGACTGTCTACCAGGCACACAGAGTTTGAGGAGAGGGAGTATGTCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TCTTGATCCGCATCAATGATGGGGGTCGGCCACCCTTGGAAGGCATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163751 TCTTGATCCGCATCAATGATGGGGGTCGGCCACCCTTGGAAGGCATTGTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TCTTTACCAG         TTACATTCTGCAGTTGTGTGGAAGGAAGTTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 163801 TCTTTACCAGGTA...CAGTTACATTCTGCAGTTGTGTGGAAGGAAGTTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TTTCCGGCCAGCAGGTCACCAGACTGGGATACCCACTGTGGGCATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163978 TTTCCGGCCAGCAGGTCACCAGACTGGGATACCCACTGTGGGCATGGCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TTGGTATACTGCTGACCACCCTTCTGGTGATTG         GTATAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 164028 TTGGTATACTGCTGACCACCCTTCTGGTGATTGGTG...TAGGTATAATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TTAGCAGTTGTGTTTATCCGCATAAAGAAGGATAAAGGCAAAGATAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166354 TTAGCAGTTGTGTTTATCCGCATAAAGAAGGATAAAGGCAAAGATAATGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TGAAAGTGCTCAAGCATCTGAAGTCAAACCTCTGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166404 TGAAAGTGCTCAAGCATCTGAAGTCAAACCTCTGAGAAGC