Result of SIM4 for
pF1KE5728
seq1 = pF1KE5728.tfa, 2778 bp
seq2 = pF1KE5728/gi568815583r_31383331.tfa (gi568815583r:31383331_31755246), 371916 bp
>pF1KE5728 2778
>gi568815583r:31383331_31755246 (Chr15)
(complement)
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152-331 (185050-185229) 100% ->
332-550 (196060-196278) 100% ->
551-652 (224439-224540) 100% ->
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781-872 (228807-228898) 100% ->
873-1000 (251429-251556) 100% ->
1001-1150 (253408-253557) 100% ->
1151-1265 (267681-267795) 100% ->
1266-1350 (267969-268053) 100% ->
1351-2778 (270523-271950) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTTTCTAGTGTGCTTCCAAACCCCACCTCGGCTGAGTGTTGGGCAGC
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100001 ATGGTTTCTAGTGTGCTTCCAAACCCCACCTCGGCTGAGTGTTGGGCAGC
50 . : . : . : . : . :
51 ACTTCTACATGATCCTATGACTCTTGATATGGACGCAGTCCTGTCAGACT
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100051 ACTTCTACATGATCCTATGACTCTTGATATGGACGCAGTCCTGTCAGACT
100 . : . : . : . : . :
101 TTGTTCGGTCCACGGGGGCAGAACCTGGTCTGGCCAGAGACCTGCTGGAA
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100101 TTGTTCGGTCCACGGGGGCAGAACCTGGTCTGGCCAGAGACCTGCTGGAA
150 . : . : . : . : . :
151 G GCAAAAACTGGGACCTGACAGCCGCTCTGAGCGACTATGA
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100151 GGTA...CAGGCAAAAACTGGGACCTGACAGCCGCTCTGAGCGACTATGA
200 . : . : . : . : . :
192 GCAGCTCCGCCAGGTGCACACAGCCAATCTGCCACATGTGTTCAATGAAG
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185090 GCAGCTCCGCCAGGTGCACACAGCCAATCTGCCACATGTGTTCAATGAAG
250 . : . : . : . : . :
242 GGCGGGGTCCCAAGCAGCCAGAGCGAGAGCCACAGCCCGGGCACAAGGTG
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185140 GGCGGGGTCCCAAGCAGCCAGAGCGAGAGCCACAGCCCGGGCACAAGGTG
300 . : . : . : . : . :
292 GAGCGACCCTGCCTGCAGAGGCAGGACGACATTGCCCAAG A
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185190 GAGCGACCCTGCCTGCAGAGGCAGGACGACATTGCCCAAGGTA...CAGA
350 . : . : . : . : . :
333 AAAGCGGCTTTCCCGGGGGATTTCCCACGCCAGCTCAGCCATCGTCTCCC
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196061 AAAGCGGCTTTCCCGGGGGATTTCCCACGCCAGCTCAGCCATCGTCTCCC
400 . : . : . : . : . :
383 TGGCCCGGTCCCACGTGGCAAGTGAATGCAACAACGAGCAGTTCCCCCTG
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196111 TGGCCCGGTCCCACGTGGCAAGTGAATGCAACAACGAGCAGTTCCCCCTG
450 . : . : . : . : . :
433 GAGATGCCAATCTACACATTCCAGTTGCCAGACCTGAGCGTGTACAGCGA
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196161 GAGATGCCAATCTACACATTCCAGTTGCCAGACCTGAGCGTGTACAGCGA
500 . : . : . : . : . :
483 GGATTTCAGGAGCTTCATCGAGCGGGACTTGATCGAGCAGGCAACAATGG
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196211 GGATTTCAGGAGCTTCATCGAGCGGGACTTGATCGAGCAGGCAACAATGG
550 . : . : . : . : . :
533 TGGCTTTGGAGCAGGCAG GTCGCCTGAACTGGTGGTCCACT
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196261 TGGCTTTGGAGCAGGCAGGTG...CAGGTCGCCTGAACTGGTGGTCCACT
600 . : . : . : . : . :
574 GTGTGCACGAGCTGTAAACGGCTTCTTCCTCTGGCCACAACAGGGGATGG
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224462 GTGTGCACGAGCTGTAAACGGCTTCTTCCTCTGGCCACAACAGGGGATGG
650 . : . : . : . : . :
624 GAACTGCCTTTTACATGCTGCTTCACTGG GAATGTGGGGGT
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224512 GAACTGCCTTTTACATGCTGCTTCACTGGGTA...CAGGAATGTGGGGGT
700 . : . : . : . : . :
665 TTCACGACCGGGACCTGGTGTTACGGAAAGCTCTCTATACCATGATGAGG
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227951 TTCACGACCGGGACCTGGTGTTACGGAAAGCTCTCTATACCATGATGAGG
750 . : . : . : . : . :
715 ACGGGAGCTGAGAGGGAAGCCCTGAAGCGGAGGTGGAGGTGGCAGCAGAC
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228001 ACGGGAGCTGAGAGGGAAGCCCTGAAGCGGAGGTGGAGGTGGCAGCAGAC
800 . : . : . : . : . :
765 GCAGCAGAATAAGGAG GAGGAGTGGGAGCGGGAGTGGACGG
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228051 GCAGCAGAATAAGGAGGTT...GAGGAGGAGTGGGAGCGGGAGTGGACGG
850 . : . : . : . : . :
806 AGCTGCTGAAGCTGGCCTCCAGCGAGCCGCGCACACACTTCAGCAAGAAT
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228832 AGCTGCTGAAGCTGGCCTCCAGCGAGCCGCGCACACACTTCAGCAAGAAT
900 . : . : . : . : . :
856 GGCGGCACGGGCGGGGG TGTGGACAACTCTGAGGACCCCGT
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228882 GGCGGCACGGGCGGGGGGTA...CAGTGTGGACAACTCTGAGGACCCCGT
950 . : . : . : . : . :
897 GTACGAGAGCCTGGAAGAGTTCCACGTTTTTGTCCTAGCCCATATATTAA
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251453 GTACGAGAGCCTGGAAGAGTTCCACGTTTTTGTCCTAGCCCATATATTAA
1000 . : . : . : . : . :
947 GAAGGCCCATCGTTGTTGTGGCAGATACAATGTTAAGAGACTCAGGTGGA
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251503 GAAGGCCCATCGTTGTTGTGGCAGATACAATGTTAAGAGACTCAGGTGGA
1050 . : . : . : . : . :
997 GAAG CGTTCGCACCCATCCCATTCGGAGGGATCTACCTGCC
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251553 GAAGGTA...CAGCGTTCGCACCCATCCCATTCGGAGGGATCTACCTGCC
1100 . : . : . : . : . :
1038 CTTGGAGGTCCCTCCCAACAGATGCCACTGCTCGCCTCTGGTTCTGGCCT
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253445 CTTGGAGGTCCCTCCCAACAGATGCCACTGCTCGCCTCTGGTTCTGGCCT
1150 . : . : . : . : . :
1088 ATGATCAAGCCCATTTCTCTGCCCTTGTGTCCATGGAACAGAGAGACCAG
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253495 ATGATCAAGCCCATTTCTCTGCCCTTGTGTCCATGGAACAGAGAGACCAG
1200 . : . : . : . : . :
1138 CAAAGAGAACAAG CCGTGATCCCCCTGACGGATTCTGAGCA
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253545 CAAAGAGAACAAGGTA...CAGCCGTGATCCCCCTGACGGATTCTGAGCA
1250 . : . : . : . : . :
1179 CAAGCTGCTGCCTCTGCACTTTGCAGTGGACCCTGGCAAGGACTGGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
267709 CAAGCTGCTGCCTCTGCACTTTGCAGTGGACCCTGGCAAGGACTGGGAGT
1300 . : . : . : . : . :
1229 GGGGGAAAGACGACAACGATAACGCCCGGCTGGCCCA CCTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
267759 GGGGGAAAGACGACAACGATAACGCCCGGCTGGCCCAGTA...CAGCCTT
1350 . : . : . : . : . :
1270 ATCCTGTCGCTAGAAGCCAAGCTGAACCTTCTGCACAGCTACATGAACGT
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267973 ATCCTGTCGCTAGAAGCCAAGCTGAACCTTCTGCACAGCTACATGAACGT
1400 . : . : . : . : . :
1320 GACGTGGATCCGGATCCCCTCCGAGACACGG GCGCCCCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
268023 GACGTGGATCCGGATCCCCTCCGAGACACGGGTG...CAGGCGCCCCTGG
1450 . : . : . : . : . :
1361 CACAGCCGGAGTCTCCCACGGCCTCGGCAGGGGAGGACGTGCAGTCCCTG
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270533 CACAGCCGGAGTCTCCCACGGCCTCGGCAGGGGAGGACGTGCAGTCCCTG
1500 . : . : . : . : . :
1411 GCCGACTCGCTGGACTCGGACCGCGATTCGGTGTGCAGCAATTCTAACAG
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270583 GCCGACTCGCTGGACTCGGACCGCGATTCGGTGTGCAGCAATTCTAACAG
1550 . : . : . : . : . :
1461 CAATAACGGCAAGAACGGCAAGGACAAGGAGAAGGAGAAGCAGCGCAAGG
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270633 CAATAACGGCAAGAACGGCAAGGACAAGGAGAAGGAGAAGCAGCGCAAGG
1600 . : . : . : . : . :
1511 AGAAGGACAAGACGCGCGCCGACTCCGTGGCCAACAAGCTGGGCAGCTTC
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270683 AGAAGGACAAGACGCGCGCCGACTCCGTGGCCAACAAGCTGGGCAGCTTC
1650 . : . : . : . : . :
1561 AGCAAGACGCTGGGCATCAAGCTGAAGAAAAACATGGGCGGCCTCGGCGG
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270733 AGCAAGACGCTGGGCATCAAGCTGAAGAAAAACATGGGCGGCCTCGGCGG
1700 . : . : . : . : . :
1611 CCTGGTGCACGGCAAGATGGGCCGCGCCAACTCCGCCAATGGCAAGAACG
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270783 CCTGGTGCACGGCAAGATGGGCCGCGCCAACTCCGCCAATGGCAAGAACG
1750 . : . : . : . : . :
1661 GGGACTCGGCCGAGCGGGGCAAGGAGAAGAAGGCCAAGTCGCGCAAGGGC
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270833 GGGACTCGGCCGAGCGGGGCAAGGAGAAGAAGGCCAAGTCGCGCAAGGGC
1800 . : . : . : . : . :
1711 AGCAAGGAGGAGTCTGGTGCGTCGGCCAGCACGTCGCCGTCGGAAAAGAC
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270883 AGCAAGGAGGAGTCTGGTGCGTCGGCCAGCACGTCGCCGTCGGAAAAGAC
1850 . : . : . : . : . :
1761 CACGCCGTCGCCCACAGACAAGGCAGCGGGCGCGTCGCCGGCGGAGAAGG
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270933 CACGCCGTCGCCCACAGACAAGGCAGCGGGCGCGTCGCCGGCGGAGAAGG
1900 . : . : . : . : . :
1811 GCGGTGGGCCGCGGGGCGACGCCTGGAAGTACAGCACGGATGTGAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270983 GCGGTGGGCCGCGGGGCGACGCCTGGAAGTACAGCACGGATGTGAAGCTG
1950 . : . : . : . : . :
1861 AGCCTCAACATCCTGCGCGCCGCCATGCAGGGGGAGCGCAAGTTCATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271033 AGCCTCAACATCCTGCGCGCCGCCATGCAGGGGGAGCGCAAGTTCATCTT
2000 . : . : . : . : . :
1911 CGCCGGCCTGCTGCTCACCAGCCACCGGCACCAGTTCCACGAGGAGATGA
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271083 CGCCGGCCTGCTGCTCACCAGCCACCGGCACCAGTTCCACGAGGAGATGA
2050 . : . : . : . : . :
1961 TCGGCTACTACCTGACGAGCGCGCAGGAGCGCTTCAGCGCCGAGCAGGAG
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271133 TCGGCTACTACCTGACGAGCGCGCAGGAGCGCTTCAGCGCCGAGCAGGAG
2100 . : . : . : . : . :
2011 CAGCGGCGCCGCGACGCCGCTACTGCGGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271183 CAGCGGCGCCGCGACGCCGCTACTGCGGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGC
2150 . : . : . : . : . :
2061 CGCCGCCACGGCCAAGCGGCCGCCGCGCAGACCGGAGACGGAGGGCGTGC
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271233 CGCCGCCACGGCCAAGCGGCCGCCGCGCAGACCGGAGACGGAGGGCGTGC
2200 . : . : . : . : . :
2111 CGGTCCCGGAGCGCGCCTCTCCGGGCCCACCCACGCAGCTGGTGCTCAAG
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271283 CGGTCCCGGAGCGCGCCTCTCCGGGCCCACCCACGCAGCTGGTGCTCAAG
2250 . : . : . : . : . :
2161 CTCAAGGAGCGGCCGAGCCCCGGGCCCGCGGCAGGGCGTGCGGCGCGGGC
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271333 CTCAAGGAGCGGCCGAGCCCCGGGCCCGCGGCAGGGCGTGCGGCGCGGGC
2300 . : . : . : . : . :
2211 GGCGGCGGGCGGCACGGCCTCCCCGGGGGGAGGCGCGCGGCGTGCGAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271383 GGCGGCGGGCGGCACGGCCTCCCCGGGGGGAGGCGCGCGGCGTGCGAGCG
2350 . : . : . : . : . :
2261 CCAGCGGACCAGTGCCTGGCCGCAGCCCCCCGGCGCCAGCGCGCCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271433 CCAGCGGACCAGTGCCTGGCCGCAGCCCCCCGGCGCCAGCGCGCCAGAGC
2400 . : . : . : . : . :
2311 GTCATCCACGTGCAGGCGTCGGGCGCGCGGGACGAGGCGTGCGCGCCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271483 GTCATCCACGTGCAGGCGTCGGGCGCGCGGGACGAGGCGTGCGCGCCGGC
2450 . : . : . : . : . :
2361 CGTGGGGGCGCTGCGGCCGTGCGCCACGTACCCGCAGCAGAACCGCTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271533 CGTGGGGGCGCTGCGGCCGTGCGCCACGTACCCGCAGCAGAACCGCTCGC
2500 . : . : . : . : . :
2411 TGTCGTCGCAGAGCTACAGCCCGGCGCGCGCCGCCGCCCTGCGCACCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271583 TGTCGTCGCAGAGCTACAGCCCGGCGCGCGCCGCCGCCCTGCGCACCGTC
2550 . : . : . : . : . :
2461 AACACGGTCGAGTCGCTGGCGCGCGCGGTGCCCGGGGCCCTACCGGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271633 AACACGGTCGAGTCGCTGGCGCGCGCGGTGCCCGGGGCCCTACCGGGCGC
2600 . : . : . : . : . :
2511 GGCGGGGACGGCGGGGGCGGCCGAGCACAAGTCGCAGACCTACACCAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271683 GGCGGGGACGGCGGGGGCGGCCGAGCACAAGTCGCAGACCTACACCAACG
2650 . : . : . : . : . :
2561 GCTTCGGCGCCCTGCGCGACGGCCTGGAGTTCGCCGACGCCGACGCGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271733 GCTTCGGCGCCCTGCGCGACGGCCTGGAGTTCGCCGACGCCGACGCGCCG
2700 . : . : . : . : . :
2611 ACCGCGCGCTCGAACGGTGAGTGCGGCCGTGGCGGCCCGGGGCCGGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271783 ACCGCGCGCTCGAACGGTGAGTGCGGCCGTGGCGGCCCGGGGCCGGTGCA
2750 . : . : . : . : . :
2661 GCGGCGCTGCCAGCGCGAGAACTGTGCGTTCTACGGGCGCGCCGAGACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271833 GCGGCGCTGCCAGCGCGAGAACTGTGCGTTCTACGGGCGCGCCGAGACCG
2800 . : . : . : . : . :
2711 AGCACTACTGCTCCTACTGCTACCGCGAGGAGCTGCGGCGGCGGCGCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271883 AGCACTACTGCTCCTACTGCTACCGCGAGGAGCTGCGGCGGCGGCGCGAG
2850 . : .
2761 GCGCGCGGGGCCCGGCCC
||||||||||||||||||
271933 GCGCGCGGGGCCCGGCCC