seq1 = pF1KE5726.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KE5726/gi568815575r_55386807.tfa (gi568815575r:55386807_55588939), 202133 bp

>pF1KE5726 2133
>gi568815575r:55386807_55588939 (ChrX)

(complement)

1-2133  (100001-102133)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGGTTCGAGAAACTTCTTTGCCCTCCGGCTCTGGGGTCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGGTTCGAGAAACTTCTTTGCCCTCCGGCTCTGGGGTCCGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCTCCGGAGGTGGGGGAGGAGCCTCTCCTGAGGAGGCGGTTGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCTCCGGAGGTGGGGGAGGAGCCTCTCCTGAGGAGGCGGTTGAGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGGAAAATGGAGGAGGCGGCGGCGGGGGCTACGAAGGCGTCTTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGGAAAATGGAGGAGGCGGCGGCGGGGGCTACGAAGGCGTCTTCGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGAAGCCGAGGAGATGAAGCTGGAGCCATTACAAGAGCGTGAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGAAGCCGAGGAGATGAAGCTGGAGCCATTACAAGAGCGTGAGCCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCGGAGGAGAACTTGACGTGGAGCAGCAGCGGCGGCGACGAGAAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCGGAGGAGAACTTGACGTGGAGCAGCAGCGGCGGCGACGAGAAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCCTTCAATCCCCCTTCGCTGTCACAGCAGCTCCTCGCCCGTTTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCCTTCAATCCCCCTTCGCTGTCACAGCAGCTCCTCGCCCGTTTGCCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCCGCAAGCCCCGCCCTCGGCCCCAGCCCCGGGCCCGCTCCCGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCCGCAAGCCCCGCCCTCGGCCCCAGCCCCGGGCCCGCTCCCGCAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCTGGGCTCTCGGCCCCACCCCCGCCTCCAGCCCGGCCCCCGCCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCTGGGCTCTCGGCCCCACCCCCGCCTCCAGCCCGGCCCCCGCCCCCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCCACCCCCGCCCCCACCCGCACCGCGGCCCAGGGCCTGGCGTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCCACCCCCGCCCCCACCCGCACCGCGGCCCAGGGCCTGGCGTGGATCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGCGCAGATCCCGGCCTGGGTCCAGGCCTCAGACACGGAGAAGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGCGCAGATCCCGGCCTGGGTCCAGGCCTCAGACACGGAGAAGCTGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGTGACCTAGACGGGTCGGGGGATCCTGGCGGCTTAGGGGACTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGTGACCTAGACGGGTCGGGGGATCCTGGCGGCTTAGGGGACTGGTTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAGGTCGAGTTTGGTCAGGGTCCCACAGGCTGCTCTCATGTGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAGGTCGAGTTTGGTCAGGGTCCCACAGGCTGCTCTCATGTGGAGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTAAAGTAGGTAAGAACTGGCAGAAGAACCTGAGGTTGATCTACCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTAAAGTAGGTAAGAACTGGCAGAAGAACCTGAGGTTGATCTACCAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTTCGTTTGGAGTGGGACCCCAGAGACTAGGAAACGTAAAGCAAAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTTCGTTTGGAGTGGGACCCCAGAGACTAGGAAACGTAAAGCAAAGTCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATCTGTCACGTATGTAGTACCCATATGAACAGACTCCACTCTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATCTGTCACGTATGTAGTACCCATATGAACAGACTCCACTCTTGTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCTGTGTCTTTTTTGGCTGCTTCACTGAGAAACATATTCACAAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCTGTGTCTTTTTTGGCTGCTTCACTGAGAAACATATTCACAAACATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAAACAAAGCAGCACCATTTAGCTGTAGACCTTTATCATGGGGTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAAACAAAGCAGCACCATTTAGCTGTAGACCTTTATCATGGGGTCATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATTGCTTCATGTGTAAGGATTATGTATATGACAAAGACATAGAACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATTGCTTCATGTGTAAGGATTATGTATATGACAAAGACATAGAACAGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCAAAGAAACAAAAGAAAAAATTTTGAGATTATTAACTTCCACCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCAAAGAAACAAAAGAAAAAATTTTGAGATTATTAACTTCCACCTCAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGATGTTTCTCATCAACAGTTTATGACATCAGGGTTTGAAGACAAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGATGTTTCTCATCAACAGTTTATGACATCAGGGTTTGAAGACAAGCAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CAACCTGTGAGACAAAGGAACAGGAGCCAAAATTGGTGAAACCCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAACCTGTGAGACAAAGGAACAGGAGCCAAAATTGGTGAAACCCAAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AAGAGAAGAAAAAAGTCAGTCTATACTGTAGGCCTGAGAGGGCTAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAGAGAAGAAAAAAGTCAGTCTATACTGTAGGCCTGAGAGGGCTAATCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCTTGGGAACACTTGTTTTATGAATTGTATTGTCCAGGCACTTACCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCTTGGGAACACTTGTTTTATGAATTGTATTGTCCAGGCACTTACCCATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCCTCTACTGAAAGATTTCTTCCTCTCTGACAAGCACAAATGTATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTCCTCTACTGAAAGATTTCTTCCTCTCTGACAAGCACAAATGTATAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACAAGCCCCAGCTTGTGTCTGGTCTGTGAAATGTCTTCGCTTTTTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACAAGCCCCAGCTTGTGTCTGGTCTGTGAAATGTCTTCGCTTTTTCATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TATGTACTCTGGGAGCCGAACTCCTCACATTCCCTATAAGTTACTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TATGTACTCTGGGAGCCGAACTCCTCACATTCCCTATAAGTTACTGCATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGATATGGATCCATGCAGAACATTTAGCAGGGTACAGGCAGCAGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TGATATGGATCCATGCAGAACATTTAGCAGGGTACAGGCAGCAGGATGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CATGAGTTCCTTATTGCAATATTAGACGTGCTACATAGACACAGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CATGAGTTCCTTATTGCAATATTAGACGTGCTACATAGACACAGCAAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGATAGTGGTGGGCAGGAGGCCAATAACCCCAACTGCTGTAACTGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGATAGTGGTGGGCAGGAGGCCAATAACCCCAACTGCTGTAACTGCATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TAGACCAAATCTTTACAGGTGGCCTGCAATCAGATGTCACATGTCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TAGACCAAATCTTTACAGGTGGCCTGCAATCAGATGTCACATGTCAAGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TGCCATAGTGTTTCTACCACCATAGACCCATGCTGGGACATCAGTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TGCCATAGTGTTTCTACCACCATAGACCCATGCTGGGACATCAGTTTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTTGCCTGGCTCTTGTGCCACATTCGATTCCCAGAACCCAGAGAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTTGCCTGGCTCTTGTGCCACATTCGATTCCCAGAACCCAGAGAGGGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ACAGCACAGTGAGCAGGGATGACCACATACCAGGAATCCCCTCACTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ACAGCACAGTGAGCAGGGATGACCACATACCAGGAATCCCCTCACTTACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GACTGTCTACAGTGGTTTACAAGGCCAGAGCACCTAGGAAGCAGTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GACTGTCTACAGTGGTTTACAAGGCCAGAGCACCTAGGAAGCAGTGCCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AATCAAATGCAATAGTTGCCAAAGCTACCAGGAGTCTACTAAACAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 AATCAAATGCAATAGTTGCCAAAGCTACCAGGAGTCTACTAAACAGCTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CAATGAAAAAATTACCCATTGTGGCTTGTTTTCATCTCAAGCGGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CAATGAAAAAATTACCCATTGTGGCTTGTTTTCATCTCAAGCGGTTTGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CATGTAGGCAAACAGAGGCGAAAGATTAATACCTTTATCTCCTTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CATGTAGGCAAACAGAGGCGAAAGATTAATACCTTTATCTCCTTTCCCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGAGCTGGACATGACTCCGTTTTTGGCCTCTACTAAAGAGAGCAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGAGCTGGACATGACTCCGTTTTTGGCCTCTACTAAAGAGAGCAGAATGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 AAGAAGGCCAGCCACCAACAGATTGTGTGCCCAATGAGAATAAGTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 AAGAAGGCCAGCCACCAACAGATTGTGTGCCCAATGAGAATAAGTATTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TTGTTTGCAGTGATTAATCACCATGGAACTTTGGAAAGTGGCCACTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TTGTTTGCAGTGATTAATCACCATGGAACTTTGGAAAGTGGCCACTATAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CAGCTTCATCCGGCAACAAAAGGACCAGTGGTTCAGCTGTGATGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CAGCTTCATCCGGCAACAAAAGGACCAGTGGTTCAGCTGTGATGATGCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 TCATCACCAAGGCTACCATTGAGGACTTACTCTACAGTGAAGGGTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TCATCACCAAGGCTACCATTGAGGACTTACTCTACAGTGAAGGGTATTTA

   2100     .    :    .    :    .    :
   2101 CTGTTCTATCACAAACAGGGTCTAGAGAAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CTGTTCTATCACAAACAGGGTCTAGAGAAAGAC