seq1 = pF1KE5723.tfa, 2442 bp
seq2 = pF1KE5723/gi568815592r_99335719.tfa (gi568815592r:99335719_99610220), 274502 bp

>pF1KE5723 2442
>gi568815592r:99335719_99610220 (Chr6)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-273  (101439-101611)   100% ->
274-377  (102690-102793)   100% ->
378-478  (106356-106456)   100% ->
479-618  (121401-121540)   100% ->
619-714  (121926-122021)   100% ->
715-845  (127338-127468)   100% ->
846-933  (133991-134078)   100% ->
934-1015  (141603-141684)   100% ->
1016-1107  (143458-143549)   100% ->
1108-1164  (145085-145141)   100% ->
1165-1308  (145474-145617)   100% ->
1309-1975  (163758-164424)   100% ->
1976-2073  (166559-166656)   100% ->
2074-2160  (170366-170452)   100% ->
2161-2314  (172822-172975)   100% ->
2315-2442  (174375-174502)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGGTGAAAGATCCAACTAAAGCTTTACCTGAGAAAGCCAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGGTGAAAGATCCAACTAAAGCTTTACCTGAGAAAGCCAAAAGAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAAGGCCTACTGTACCTCATGATGAAGACTCTTCAGATGATATTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAAAGGCCTACTGTACCTCATGATGAAGACTCTTCAGATGATATTGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          TAGGTTTAACTTGCCAACATGTAAGTCATGCTATCAGCGTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...CAGTAGGTTTAACTTGCCAACATGTAAGTCATGCTATCAGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATCATGTAAAGAGAGCAATAGCTGAGAATCTGTGGTCAGTTTGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101480 AATCATGTAAAGAGAGCAATAGCTGAGAATCTGTGGTCAGTTTGCTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATGTTTAAAAGAAAGAAGATTCTATGATGGGCAGCTAGTACTTACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101530 ATGTTTAAAAGAAAGAAGATTCTATGATGGGCAGCTAGTACTTACTTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATTTGGTTGTGCCTCAAGTGTGGCTTCCAG         GGATGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101580 ATATTTGGTTGTGCCTCAAGTGTGGCTTCCAGGTA...CAGGGATGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAAACTCAGAAAGCCAACATTCATTGAAGCACTTTAAGAGTTCCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102699 AAAAACTCAGAAAGCCAACATTCATTGAAGCACTTTAAGAGTTCCAGAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGCCCCATTGTATTATAATTAATCTGAGCACATGGATTATATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102749 AGAGCCCCATTGTATTATAATTAATCTGAGCACATGGATTATATGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    378     GTGTTATGAATGTGATGAAAAATTATCAACGCATTGTAATAAGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102799 .CAGGTGTTATGAATGTGATGAAAAATTATCAACGCATTGTAATAAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTTTGGCTCAGATAGTTGATTTTCTCCAGAAACATGCTTCTAAAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106402 GTTTTGGCTCAGATAGTTGATTTTCTCCAGAAACATGCTTCTAAAACACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACAA         GTGCATTTTCTAGAATCATGAAACTTTGTGAAGAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106452 AACAAGTA...TAGGTGCATTTTCTAGAATCATGAAACTTTGTGAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATGTGAAACAGATGAAATACAGAAGGGAGGAAAATGCAGAAATTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121437 AATGTGAAACAGATGAAATACAGAAGGGAGGAAAATGCAGAAATTTATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTAAGAGGAATTACAAATTTAGGAAATACTTGCTTTTTTAATGCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121487 GTAAGAGGAATTACAAATTTAGGAAATACTTGCTTTTTTAATGCAGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCAG         AACTTGGCACAGACTTATACTCTTACTGATCTGATGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121537 GCAGGTA...TAGAACTTGGCACAGACTTATACTCTTACTGATCTGATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGAGATCAAAGAAAGTAGTACAAAACTCAAGATTTTTCCTTCCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121963 ATGAGATCAAAGAAAGTAGTACAAAACTCAAGATTTTTCCTTCCTCAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTCAGCTG         GACCCATTGGTGGTGGAACTTTCAAGGCCTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 122013 TCTCAGCTGGTG...AAGGACCCATTGGTGGTGGAACTTTCAAGGCCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACCACTGACCTCAGCCTTGTTCCTGTTTCTTCACAGCATGAAGGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127370 ACCACTGACCTCAGCCTTGTTCCTGTTTCTTCACAGCATGAAGGAGACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAAAAGGACCACTTTCTCCTAAAGTTCTTTTTAATCAGCTTTGTCAGAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 127420 AAAAAGGACCACTTTCTCCTAAAGTTCTTTTTAATCAGCTTTGTCAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    846         GGCACCTCGATTTAAAGATTTCCAGCAACAGGACAGTCAGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127470 TG...CAGGGCACCTCGATTTAAAGATTTCCAGCAACAGGACAGTCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCTTCTTCATTATCTTCTGGATGCAGTGAGGACAGAAGAAACAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 134033 GCTTCTTCATTATCTTCTGGATGCAGTGAGGACAGAAGAAACAAAGGTC.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    934      CGAATACAAGCTAGCATTCTAAAAGCATTTAACAACCCAACTACT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134083 ..CAGCGAATACAAGCTAGCATTCTAAAAGCATTTAACAACCCAACTACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAAACTGCTGATGATGAAACTAGAAAAAAAGTCAAAG         CATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 141648 AAAACTGCTGATGATGAAACTAGAAAAAAAGTCAAAGGTA...CAGCATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGGAAAAGAAGGTGTGAAAATGAACTTCATAGATCGGATCTTTATTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143462 TGGAAAAGAAGGTGTGAAAATGAACTTCATAGATCGGATCTTTATTGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AATTAACTAGCACGGTCATGTGTGAAGAATGTGCAAAT         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 143512 AATTAACTAGCACGGTCATGTGTGAAGAATGTGCAAATGTA...AAGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCCACGGTGAAAGATCCATTCATTGATATTTCACTTCCTATAATAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145088 TCCACGGTGAAAGATCCATTCATTGATATTTCACTTCCTATAATAGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AAGG         GTTTCAAAACCTTTACTTTGGGGAAGAATGAATAAAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145138 AAGGGTA...TAGGTTTCAAAACCTTTACTTTGGGGAAGAATGAATAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATAGAAGTTTACGGGAGACAGATCATGATCGATACAGTGGCAATGTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145511 ATAGAAGTTTACGGGAGACAGATCATGATCGATACAGTGGCAATGTTACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ATAGAAAATATTCATCAACCTAGAGCTGCCAAGAAGCATTCTTCATCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145561 ATAGAAAATATTCATCAACCTAGAGCTGCCAAGAAGCATTCTTCATCTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AGATAAG         AGTCAACTAATTCATGACCGAAAATGTATTAGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145611 AGATAAGGTA...CAGAGTCAACTAATTCATGACCGAAAATGTATTAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AATTGTCATCTGGAGAAACTGTCACATACCAGAAAAATGAAAACCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163792 AATTGTCATCTGGAGAAACTGTCACATACCAGAAAAATGAAAACCTTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATGAATGGGGATTCTTTAATGTTTGCCAGCCTCATGAATTCTGAGTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163842 ATGAATGGGGATTCTTTAATGTTTGCCAGCCTCATGAATTCTGAGTCACG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCTGAATGAAAGCCCTACTGATGACAGTGAAAAAGAAGCCAGCCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163892 TCTGAATGAAAGCCCTACTGATGACAGTGAAAAAGAAGCCAGCCATTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAAGCAATGTTGATGCTGACAGTGAGCCTTCAGAATCTGAAAGTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163942 AAAGCAATGTTGATGCTGACAGTGAGCCTTCAGAATCTGAAAGTGCTTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAGCAGACTGGGCTGTTCAGATCCAGTAGTGGATCCGGTGTGCAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163992 AAGCAGACTGGGCTGTTCAGATCCAGTAGTGGATCCGGTGTGCAGCCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGGACCCCTTTACCCTCTGTCAGCAGGTAAACTGCTGTACACCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164042 TGGACCCCTTTACCCTCTGTCAGCAGGTAAACTGCTGTACACCAAGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTGACAGTGGTGATAAGGAAATGGCAGAAGCTATTTCTGAACTTCGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164092 CTGACAGTGGTGATAAGGAAATGGCAGAAGCTATTTCTGAACTTCGTTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGCAGCACTGTAACTGGAGATCAAGATTTTGACAGAGAAAATCAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164142 AGCAGCACTGTAACTGGAGATCAAGATTTTGACAGAGAAAATCAGCCACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AAATATTTCAAATAATTTATGTTTTTTAGAGGGGAAGCATTTGAGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164192 AAATATTTCAAATAATTTATGTTTTTTAGAGGGGAAGCATTTGAGGTCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ATAGTCCCCAAAATGCTTTTCAGACCCTTTCTCAGAGCTATATAACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164242 ATAGTCCCCAAAATGCTTTTCAGACCCTTTCTCAGAGCTATATAACTACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TCTAAAGAATGTTCAATTCAGTCCTGTCTCTACCAGTTTACATCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164292 TCTAAAGAATGTTCAATTCAGTCCTGTCTCTACCAGTTTACATCTATGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ATTACTAATGGGGAATAATAAGCTTCTATGTGAGAATTGTACTAAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164342 ATTACTAATGGGGAATAATAAGCTTCTATGTGAGAATTGTACTAAAAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AACAGAAGTACCAAGAAGAAACCAGTTTTGCAG         AAAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 164392 AACAGAAGTACCAAGAAGAAACCAGTTTTGCAGGTA...TAGAAAAGAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GTAGAAGGAGTTTATACTAATGCCAGGAAGCAATTGCTCATTTCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166567 GTAGAAGGAGTTTATACTAATGCCAGGAAGCAATTGCTCATTTCTGCTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TCCAGCTGTCCTAATTCTCCACCTGAAAAGATTTCATCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 166617 TCCAGCTGTCCTAATTCTCCACCTGAAAAGATTTCATCAGGTA...AAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CTGGCTTGAGTCTTCGTAAAGTAAACAGACATGTAGATTTTCCACTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170367 CTGGCTTGAGTCTTCGTAAAGTAAACAGACATGTAGATTTTCCACTTATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CTCGATTTAGCACCATTCTGCTCTGCTACTTGTAAG         AATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 170417 CTCGATTTAGCACCATTCTGCTCTGCTACTTGTAAGGTA...AAGAATGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 AAGTGTGGGAGATAAAGTTCTCTACGGTCTCTATGGCATAGTGGAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172827 AAGTGTGGGAGATAAAGTTCTCTACGGTCTCTATGGCATAGTGGAACATA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GTGGCTCGATGAGAGAAGGCCACTACACTGCTTATGTGAAAGTGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172877 GTGGCTCGATGAGAGAAGGCCACTACACTGCTTATGTGAAAGTGAGAACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CCCTCCAGGAAATTATCGGAACATAACACTAAAAAGAAAAATGTGCCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 172927 CCCTCCAGGAAATTATCGGAACATAACACTAAAAAGAAAAATGTGCCTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2315         GTTTGAAAGCGGCTGATAATGAATCAGCAGGCCAGTGGGTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172977 TA...TAGGTTTGAAAGCGGCTGATAATGAATCAGCAGGCCAGTGGGTCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 ATGTTAGTGACACTTACTTACAGGTGGTTCCAGAATCAAGAGCACTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174417 ATGTTAGTGACACTTACTTACAGGTGGTTCCAGAATCAAGAGCACTTAGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .
   2407 GCACAAGCCTACCTTCTTTTCTATGAAAGAGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174467 GCACAAGCCTACCTTCTTTTCTATGAAAGAGTATTA